MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides J18 plasmid pKLE04

Total Repeats: 60

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016828	TTTC	2	8	982	989	0 %	75 %	0 %	25 %	379987607
2	NC_016828	TGAT	2	8	1068	1075	25 %	50 %	25 %	0 %	379987608
3	NC_016828	TTAT	2	8	1228	1235	25 %	75 %	0 %	0 %	379987608
4	NC_016828	ATTA	2	8	1281	1288	50 %	50 %	0 %	0 %	379987608
5	NC_016828	AACT	2	8	1483	1490	50 %	25 %	0 %	25 %	379987609
6	NC_016828	TTTA	2	8	1505	1512	25 %	75 %	0 %	0 %	379987609
7	NC_016828	GCTT	2	8	1710	1717	0 %	50 %	25 %	25 %	379987609
8	NC_016828	AATT	2	8	2260	2267	50 %	50 %	0 %	0 %	379987610
9	NC_016828	TACT	2	8	2280	2287	25 %	50 %	0 %	25 %	379987610
10	NC_016828	CGGT	2	8	3007	3014	0 %	25 %	50 %	25 %	379987610
11	NC_016828	TATT	2	8	3167	3174	25 %	75 %	0 %	0 %	379987610
12	NC_016828	AATG	2	8	3643	3650	50 %	25 %	25 %	0 %	379987610
13	NC_016828	TTTA	2	8	3787	3794	25 %	75 %	0 %	0 %	379987610
14	NC_016828	ATTT	2	8	4018	4025	25 %	75 %	0 %	0 %	379987610
15	NC_016828	TCAT	2	8	4892	4899	25 %	50 %	0 %	25 %	379987610
16	NC_016828	ATCA	2	8	4963	4970	50 %	25 %	0 %	25 %	379987610
17	NC_016828	ATTA	2	8	5005	5012	50 %	50 %	0 %	0 %	379987610
18	NC_016828	GCTC	2	8	5453	5460	0 %	25 %	25 %	50 %	379987610
19	NC_016828	TACT	2	8	5711	5718	25 %	50 %	0 %	25 %	379987610
20	NC_016828	CCAC	2	8	6178	6185	25 %	0 %	0 %	75 %	379987610
21	NC_016828	TAAG	2	8	6784	6791	50 %	25 %	25 %	0 %	379987610
22	NC_016828	AACT	2	8	6796	6803	50 %	25 %	0 %	25 %	379987610
23	NC_016828	TCTA	2	8	7341	7348	25 %	50 %	0 %	25 %	379987611
24	NC_016828	TGCT	2	8	7398	7405	0 %	50 %	25 %	25 %	379987611
25	NC_016828	TTGT	2	8	7549	7556	0 %	75 %	25 %	0 %	379987612
26	NC_016828	ATTT	2	8	7912	7919	25 %	75 %	0 %	0 %	379987612
27	NC_016828	CAAC	2	8	8101	8108	50 %	0 %	0 %	50 %	379987612
28	NC_016828	TACT	2	8	8126	8133	25 %	50 %	0 %	25 %	379987612
29	NC_016828	AAAG	2	8	8389	8396	75 %	0 %	25 %	0 %	379987612
30	NC_016828	TTTC	2	8	9431	9438	0 %	75 %	0 %	25 %	379987613
31	NC_016828	TATC	2	8	10675	10682	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_016828	TAAT	3	12	11139	11150	50 %	50 %	0 %	0 %	379987615
33	NC_016828	ATCC	2	8	11998	12005	25 %	25 %	0 %	50 %	379987616
34	NC_016828	CAAT	2	8	12302	12309	50 %	25 %	0 %	25 %	379987616
35	NC_016828	ATCC	2	8	12791	12798	25 %	25 %	0 %	50 %	379987616
36	NC_016828	ACAA	2	8	12977	12984	75 %	0 %	0 %	25 %	379987617
37	NC_016828	ATAA	2	8	12997	13004	75 %	25 %	0 %	0 %	379987617
38	NC_016828	ACCA	2	8	13088	13095	50 %	0 %	0 %	50 %	379987617
39	NC_016828	GAAT	2	8	13346	13353	50 %	25 %	25 %	0 %	379987617
40	NC_016828	TAAA	2	8	13495	13502	75 %	25 %	0 %	0 %	379987617
41	NC_016828	ATAA	2	8	13850	13857	75 %	25 %	0 %	0 %	379987617
42	NC_016828	TAAA	2	8	13889	13896	75 %	25 %	0 %	0 %	379987617
43	NC_016828	TAAC	2	8	14561	14568	50 %	25 %	0 %	25 %	379987618
44	NC_016828	TCAT	2	8	14912	14919	25 %	50 %	0 %	25 %	379987618
45	NC_016828	CATC	2	8	15087	15094	25 %	25 %	0 %	50 %	379987618
46	NC_016828	ATTT	2	8	15300	15307	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016828	ATTT	2	8	15642	15649	25 %	75 %	0 %	0 %	379987619
48	NC_016828	ATGA	2	8	15747	15754	50 %	25 %	25 %	0 %	379987619
49	NC_016828	ATGG	2	8	15963	15970	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016828	TTTC	2	8	16387	16394	0 %	75 %	0 %	25 %	379987620
51	NC_016828	CGTG	2	8	16518	16525	0 %	25 %	50 %	25 %	379987620
52	NC_016828	GTAA	2	8	16698	16705	50 %	25 %	25 %	0 %	379987620
53	NC_016828	AGTA	2	8	17210	17217	50 %	25 %	25 %	0 %	379987620
54	NC_016828	CATA	2	8	17368	17375	50 %	25 %	0 %	25 %	379987620
55	NC_016828	TTTC	2	8	17585	17592	0 %	75 %	0 %	25 %	379987620
56	NC_016828	ATTT	2	8	17681	17688	25 %	75 %	0 %	0 %	379987621
57	NC_016828	GCAA	2	8	18442	18449	50 %	0 %	25 %	25 %	379987622
58	NC_016828	GTTA	2	8	18655	18662	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016828	ATCT	2	8	18853	18860	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_016828	AAAG	2	8	19015	19022	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.