MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides J18 plasmid pKLE04

Total Repeats: 267

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016828	GTT	2	6	16	21	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016828	CCA	2	6	29	34	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_016828	TGC	2	6	76	81	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_016828	CCA	2	6	101	106	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_016828	ACT	2	6	122	127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_016828	CAT	2	6	129	134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_016828	TTA	2	6	165	170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016828	GTC	2	6	171	176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_016828	CTT	2	6	218	223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_016828	AAT	2	6	231	236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016828	TTA	2	6	290	295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016828	CTT	2	6	355	360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_016828	ATT	2	6	362	367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379987606
14	NC_016828	CTT	3	9	395	403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379987606
15	NC_016828	TCA	2	6	511	516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379987606
16	NC_016828	TGA	2	6	527	532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379987606
17	NC_016828	AAG	2	6	602	607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379987606
18	NC_016828	TTC	2	6	634	639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379987606
19	NC_016828	GTT	2	6	677	682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379987606
20	NC_016828	ACT	2	6	774	779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379987607
21	NC_016828	GTT	2	6	901	906	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379987607
22	NC_016828	AAT	2	6	908	913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379987607
23	NC_016828	GGA	2	6	933	938	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379987607
24	NC_016828	GTT	2	6	1057	1062	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379987608
25	NC_016828	TTC	2	6	1103	1108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379987608
26	NC_016828	GCA	2	6	1115	1120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379987608
27	NC_016828	ATT	2	6	1269	1274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379987608
28	NC_016828	TAG	2	6	1307	1312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379987608
29	NC_016828	TAA	2	6	1363	1368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016828	AAT	2	6	1565	1570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379987609
31	NC_016828	CTG	2	6	1648	1653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379987609
32	NC_016828	TCA	2	6	1659	1664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379987609
33	NC_016828	TTC	2	6	1700	1705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379987609
34	NC_016828	ATA	2	6	1851	1856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379987609
35	NC_016828	TCG	2	6	2003	2008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379987609
36	NC_016828	TTC	2	6	2042	2047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379987609
37	NC_016828	TTC	2	6	2088	2093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_016828	TTG	2	6	2111	2116	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016828	ATT	2	6	2155	2160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016828	TAA	2	6	2164	2169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016828	TAT	2	6	2225	2230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379987610
42	NC_016828	TAA	2	6	2289	2294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379987610
43	NC_016828	ATA	2	6	2298	2303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379987610
44	NC_016828	ATC	2	6	2347	2352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379987610
45	NC_016828	AAT	2	6	2395	2400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379987610
46	NC_016828	GAC	2	6	2415	2420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379987610
47	NC_016828	TCT	2	6	2520	2525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379987610
48	NC_016828	CAA	2	6	2752	2757	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379987610
49	NC_016828	AAT	2	6	2920	2925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379987610
50	NC_016828	ATA	2	6	2983	2988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379987610
51	NC_016828	ATT	2	6	3020	3025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379987610
52	NC_016828	TCA	2	6	3038	3043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379987610
53	NC_016828	TCA	2	6	3128	3133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379987610
54	NC_016828	ACC	2	6	3221	3226	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379987610
55	NC_016828	ATT	2	6	3331	3336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379987610
56	NC_016828	ATC	2	6	3406	3411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379987610
57	NC_016828	GAT	2	6	3588	3593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379987610
58	NC_016828	AAT	2	6	3605	3610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379987610
59	NC_016828	GTT	2	6	3629	3634	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379987610
60	NC_016828	ATC	2	6	3820	3825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379987610
61	NC_016828	GGA	2	6	3854	3859	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379987610
62	NC_016828	AAT	2	6	3865	3870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379987610
63	NC_016828	CTT	2	6	3885	3890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379987610
64	NC_016828	CGT	2	6	3909	3914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379987610
65	NC_016828	ATC	3	9	3928	3936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379987610
66	NC_016828	CAT	2	6	4263	4268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379987610
67	NC_016828	GAA	2	6	4354	4359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379987610
68	NC_016828	GAT	2	6	4378	4383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379987610
69	NC_016828	TCT	2	6	4394	4399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379987610
70	NC_016828	TCA	2	6	4616	4621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379987610
71	NC_016828	TGA	2	6	4648	4653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379987610
72	NC_016828	GTT	2	6	4935	4940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379987610
73	NC_016828	TTA	2	6	5039	5044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379987610
74	NC_016828	ATA	2	6	5093	5098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379987610
75	NC_016828	ATA	2	6	5129	5134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379987610
76	NC_016828	AAG	2	6	5225	5230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379987610
77	NC_016828	CTG	2	6	5259	5264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379987610
78	NC_016828	TCA	2	6	5360	5365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379987610
79	NC_016828	AAC	2	6	5389	5394	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379987610
80	NC_016828	TTC	2	6	5395	5400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379987610
81	NC_016828	CAT	2	6	5472	5477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379987610
82	NC_016828	ACG	2	6	5512	5517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379987610
83	NC_016828	CAT	2	6	5518	5523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379987610
84	NC_016828	CAT	2	6	5553	5558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379987610
85	NC_016828	AGA	2	6	5731	5736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379987610
86	NC_016828	CTT	2	6	5865	5870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379987610
87	NC_016828	TAG	2	6	5871	5876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379987610
88	NC_016828	TCA	2	6	5906	5911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379987610
89	NC_016828	GAT	2	6	5914	5919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379987610
90	NC_016828	GTA	2	6	6039	6044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379987610
91	NC_016828	TGT	2	6	6058	6063	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379987610
92	NC_016828	CAG	2	6	6081	6086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379987610
93	NC_016828	AAT	2	6	6200	6205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379987610
94	NC_016828	TTG	2	6	6370	6375	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379987610
95	NC_016828	AAT	2	6	6478	6483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379987610
96	NC_016828	TAG	2	6	6569	6574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379987610
97	NC_016828	AAC	2	6	6737	6742	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379987610
98	NC_016828	CCA	2	6	6912	6917	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379987611
99	NC_016828	CTG	2	6	6950	6955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379987611
100	NC_016828	TTC	2	6	7041	7046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379987611
101	NC_016828	GTT	3	9	7076	7084	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379987611
102	NC_016828	TGT	2	6	7156	7161	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379987611
103	NC_016828	TGT	2	6	7191	7196	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379987611
104	NC_016828	GTA	2	6	7213	7218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379987611
105	NC_016828	ACC	2	6	7236	7241	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379987611
106	NC_016828	TAC	2	6	7247	7252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379987611
107	NC_016828	TGT	2	6	7285	7290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379987611
108	NC_016828	TAC	2	6	7317	7322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379987611
109	NC_016828	TCA	2	6	7420	7425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379987611
110	NC_016828	TAG	2	6	7656	7661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379987612
111	NC_016828	TCT	2	6	7748	7753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379987612
112	NC_016828	TCT	2	6	7757	7762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379987612
113	NC_016828	ATC	2	6	7792	7797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379987612
114	NC_016828	ACT	2	6	7807	7812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379987612
115	NC_016828	TGC	2	6	7860	7865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379987612
116	NC_016828	AAT	2	6	7961	7966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379987612
117	NC_016828	TGA	2	6	8013	8018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379987612
118	NC_016828	TTC	2	6	8044	8049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379987612
119	NC_016828	AAT	2	6	8116	8121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379987612
120	NC_016828	CTT	2	6	8349	8354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379987612
121	NC_016828	TTA	2	6	8369	8374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379987612
122	NC_016828	TAT	2	6	8526	8531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379987612
123	NC_016828	CGA	2	6	8535	8540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379987612
124	NC_016828	GTT	2	6	8630	8635	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_016828	TAT	2	6	8683	8688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016828	TTA	2	6	8813	8818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_016828	TTA	2	6	8891	8896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_016828	TTA	2	6	8987	8992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016828	ATT	2	6	8999	9004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_016828	TAA	2	6	9011	9016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016828	ATT	2	6	9047	9052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_016828	GTC	2	6	9232	9237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379987613
133	NC_016828	TTC	2	6	9282	9287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379987613
134	NC_016828	TTC	2	6	9504	9509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379987613
135	NC_016828	TTC	2	6	9538	9543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379987613
136	NC_016828	TTC	2	6	9717	9722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379987613
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261	NC_016828	CAC	2	6	18981	18986	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
262	NC_016828	TTC	2	6	19069	19074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
263	NC_016828	ATT	2	6	19096	19101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
264	NC_016828	AAT	2	6	19114	19119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
265	NC_016828	CTA	2	6	19131	19136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
266	NC_016828	ATC	2	6	19174	19179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
267	NC_016828	TTG	2	6	19272	19277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.