MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides J18 plasmid pKLE04

Total Repeats: 56

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016828	GTT	2	6	16	21	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016828	CCA	2	6	29	34	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_016828	TGC	2	6	76	81	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_016828	CCA	2	6	101	106	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_016828	ACT	2	6	122	127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_016828	CAT	2	6	129	134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_016828	TTA	2	6	165	170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016828	GTC	2	6	171	176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_016828	CTT	2	6	218	223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_016828	AAT	2	6	231	236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016828	TTA	2	6	290	295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016828	CTT	2	6	355	360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_016828	TAA	2	6	1363	1368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016828	TTC	2	6	2088	2093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_016828	TTG	2	6	2111	2116	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016828	ATT	2	6	2155	2160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016828	TAA	2	6	2164	2169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016828	GTT	2	6	8630	8635	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016828	TAT	2	6	8683	8688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016828	TTA	2	6	8813	8818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016828	TTA	2	6	8891	8896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016828	TTA	2	6	8987	8992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016828	ATT	2	6	8999	9004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016828	TAA	2	6	9011	9016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016828	ATT	2	6	9047	9052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016828	CCT	2	6	10349	10354	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_016828	ACT	2	6	10496	10501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_016828	TAT	2	6	10515	10520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016828	CGG	2	6	10538	10543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_016828	TAA	2	6	10780	10785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016828	TCC	2	6	11307	11312	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_016828	AAC	2	6	11337	11342	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_016828	TAC	2	6	11353	11358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_016828	GAT	2	6	11384	11389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016828	CTA	2	6	11404	11409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_016828	ATT	2	6	14161	14166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016828	TTC	2	6	15272	15277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_016828	AAT	2	6	15288	15293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016828	TAG	2	6	15401	15406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016828	TAA	2	6	16001	16006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016828	CTT	2	6	16209	16214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_016828	TAT	2	6	16223	16228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016828	CTA	2	6	16259	16264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_016828	ACC	2	6	18559	18564	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_016828	TTG	2	6	18636	18641	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016828	ATT	2	6	18694	18699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016828	ATC	2	6	18763	18768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_016828	TCA	2	6	18812	18817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_016828	CGA	2	6	18914	18919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_016828	CAC	2	6	18981	18986	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_016828	TTC	2	6	19069	19074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_016828	ATT	2	6	19096	19101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016828	AAT	2	6	19114	19119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016828	CTA	2	6	19131	19136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_016828	ATC	2	6	19174	19179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_016828	TTG	2	6	19272	19277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.