MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides J18 plasmid pKLE04

Total Repeats: 211

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016828	ATT	2	6	362	367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379987606
2	NC_016828	CTT	3	9	395	403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379987606
3	NC_016828	TCA	2	6	511	516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379987606
4	NC_016828	TGA	2	6	527	532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379987606
5	NC_016828	AAG	2	6	602	607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379987606
6	NC_016828	TTC	2	6	634	639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379987606
7	NC_016828	GTT	2	6	677	682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379987606
8	NC_016828	ACT	2	6	774	779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379987607
9	NC_016828	GTT	2	6	901	906	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379987607
10	NC_016828	AAT	2	6	908	913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379987607
11	NC_016828	GGA	2	6	933	938	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379987607
12	NC_016828	GTT	2	6	1057	1062	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379987608
13	NC_016828	TTC	2	6	1103	1108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379987608
14	NC_016828	GCA	2	6	1115	1120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379987608
15	NC_016828	ATT	2	6	1269	1274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379987608
16	NC_016828	TAG	2	6	1307	1312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379987608
17	NC_016828	AAT	2	6	1565	1570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379987609
18	NC_016828	CTG	2	6	1648	1653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379987609
19	NC_016828	TCA	2	6	1659	1664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379987609
20	NC_016828	TTC	2	6	1700	1705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379987609
21	NC_016828	ATA	2	6	1851	1856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379987609
22	NC_016828	TCG	2	6	2003	2008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379987609
23	NC_016828	TTC	2	6	2042	2047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379987609
24	NC_016828	TAT	2	6	2225	2230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379987610
25	NC_016828	TAA	2	6	2289	2294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379987610
26	NC_016828	ATA	2	6	2298	2303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379987610
27	NC_016828	ATC	2	6	2347	2352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379987610
28	NC_016828	AAT	2	6	2395	2400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379987610
29	NC_016828	GAC	2	6	2415	2420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379987610
30	NC_016828	TCT	2	6	2520	2525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379987610
31	NC_016828	CAA	2	6	2752	2757	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379987610
32	NC_016828	AAT	2	6	2920	2925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379987610
33	NC_016828	ATA	2	6	2983	2988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379987610
34	NC_016828	ATT	2	6	3020	3025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379987610
35	NC_016828	TCA	2	6	3038	3043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379987610
36	NC_016828	TCA	2	6	3128	3133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379987610
37	NC_016828	ACC	2	6	3221	3226	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379987610
38	NC_016828	ATT	2	6	3331	3336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379987610
39	NC_016828	ATC	2	6	3406	3411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379987610
40	NC_016828	GAT	2	6	3588	3593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379987610
41	NC_016828	AAT	2	6	3605	3610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379987610
42	NC_016828	GTT	2	6	3629	3634	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379987610
43	NC_016828	ATC	2	6	3820	3825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379987610
44	NC_016828	GGA	2	6	3854	3859	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379987610
45	NC_016828	AAT	2	6	3865	3870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379987610
46	NC_016828	CTT	2	6	3885	3890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379987610
47	NC_016828	CGT	2	6	3909	3914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379987610
48	NC_016828	ATC	3	9	3928	3936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379987610
49	NC_016828	CAT	2	6	4263	4268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379987610
50	NC_016828	GAA	2	6	4354	4359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379987610
51	NC_016828	GAT	2	6	4378	4383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379987610
52	NC_016828	TCT	2	6	4394	4399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379987610
53	NC_016828	TCA	2	6	4616	4621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379987610
54	NC_016828	TGA	2	6	4648	4653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379987610
55	NC_016828	GTT	2	6	4935	4940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379987610
56	NC_016828	TTA	2	6	5039	5044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379987610
57	NC_016828	ATA	2	6	5093	5098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379987610
58	NC_016828	ATA	2	6	5129	5134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379987610
59	NC_016828	AAG	2	6	5225	5230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379987610
60	NC_016828	CTG	2	6	5259	5264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379987610
61	NC_016828	TCA	2	6	5360	5365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379987610
62	NC_016828	AAC	2	6	5389	5394	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379987610
63	NC_016828	TTC	2	6	5395	5400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379987610
64	NC_016828	CAT	2	6	5472	5477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379987610
65	NC_016828	ACG	2	6	5512	5517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379987610
66	NC_016828	CAT	2	6	5518	5523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379987610
67	NC_016828	CAT	2	6	5553	5558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379987610
68	NC_016828	AGA	2	6	5731	5736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379987610
69	NC_016828	CTT	2	6	5865	5870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379987610
70	NC_016828	TAG	2	6	5871	5876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379987610
71	NC_016828	TCA	2	6	5906	5911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379987610
72	NC_016828	GAT	2	6	5914	5919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379987610
73	NC_016828	GTA	2	6	6039	6044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379987610
74	NC_016828	TGT	2	6	6058	6063	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379987610
75	NC_016828	CAG	2	6	6081	6086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379987610
76	NC_016828	AAT	2	6	6200	6205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379987610
77	NC_016828	TTG	2	6	6370	6375	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379987610
78	NC_016828	AAT	2	6	6478	6483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379987610
79	NC_016828	TAG	2	6	6569	6574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379987610
80	NC_016828	AAC	2	6	6737	6742	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379987610
81	NC_016828	CCA	2	6	6912	6917	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379987611
82	NC_016828	CTG	2	6	6950	6955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379987611
83	NC_016828	TTC	2	6	7041	7046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379987611
84	NC_016828	GTT	3	9	7076	7084	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379987611
85	NC_016828	TGT	2	6	7156	7161	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379987611
86	NC_016828	TGT	2	6	7191	7196	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379987611
87	NC_016828	GTA	2	6	7213	7218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379987611
88	NC_016828	ACC	2	6	7236	7241	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379987611
89	NC_016828	TAC	2	6	7247	7252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379987611
90	NC_016828	TGT	2	6	7285	7290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379987611
91	NC_016828	TAC	2	6	7317	7322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379987611
92	NC_016828	TCA	2	6	7420	7425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379987611
93	NC_016828	TAG	2	6	7656	7661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379987612
94	NC_016828	TCT	2	6	7748	7753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379987612
95	NC_016828	TCT	2	6	7757	7762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379987612
96	NC_016828	ATC	2	6	7792	7797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379987612
97	NC_016828	ACT	2	6	7807	7812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379987612
98	NC_016828	TGC	2	6	7860	7865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379987612
99	NC_016828	AAT	2	6	7961	7966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379987612
100	NC_016828	TGA	2	6	8013	8018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379987612
101	NC_016828	TTC	2	6	8044	8049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379987612
102	NC_016828	AAT	2	6	8116	8121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379987612
103	NC_016828	CTT	2	6	8349	8354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379987612
104	NC_016828	TTA	2	6	8369	8374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379987612
105	NC_016828	TAT	2	6	8526	8531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379987612
106	NC_016828	CGA	2	6	8535	8540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379987612
107	NC_016828	GTC	2	6	9232	9237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379987613
108	NC_016828	TTC	2	6	9282	9287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379987613
109	NC_016828	TTC	2	6	9504	9509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379987613
110	NC_016828	TTC	2	6	9538	9543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379987613
111	NC_016828	TTC	2	6	9717	9722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379987613
112	NC_016828	GCA	2	6	9836	9841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379987613
113	NC_016828	CTT	2	6	9902	9907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379987613
114	NC_016828	ATC	2	6	9936	9941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379987613
115	NC_016828	ACC	2	6	9946	9951	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379987613
116	NC_016828	TGG	2	6	10046	10051	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379987613
117	NC_016828	TTC	2	6	10098	10103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379987613
118	NC_016828	TTA	2	6	10844	10849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379987614
119	NC_016828	ATT	2	6	10909	10914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379987614
120	NC_016828	ATT	2	6	10932	10937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379987614
121	NC_016828	CAA	2	6	11185	11190	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379987615
122	NC_016828	ATT	2	6	11235	11240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379987615
123	NC_016828	ATT	2	6	11243	11248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379987615
124	NC_016828	ATC	2	6	11662	11667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379987616
125	NC_016828	TAT	2	6	11691	11696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379987616
126	NC_016828	TTC	2	6	11734	11739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379987616
127	NC_016828	TCA	2	6	11762	11767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379987616
128	NC_016828	TTC	2	6	12018	12023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379987616
129	NC_016828	ATT	2	6	12103	12108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379987616
130	NC_016828	CTA	2	6	12129	12134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379987616
131	NC_016828	AGA	2	6	12200	12205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379987616
132	NC_016828	CTT	2	6	12255	12260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379987616
133	NC_016828	CTA	2	6	12291	12296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379987616
134	NC_016828	TAT	2	6	12426	12431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379987616
135	NC_016828	ATT	2	6	12457	12462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379987616
136	NC_016828	ATA	2	6	12544	12549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379987616
137	NC_016828	ATG	2	6	12550	12555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379987616
138	NC_016828	ATA	2	6	12751	12756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379987616
139	NC_016828	TAT	2	6	12837	12842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379987616
140	NC_016828	CTT	2	6	12867	12872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379987616
141	NC_016828	TCA	2	6	13192	13197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379987617
142	NC_016828	TTA	2	6	13293	13298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379987617
143	NC_016828	CAT	2	6	13319	13324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379987617
144	NC_016828	TTG	2	6	13421	13426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379987617
145	NC_016828	TAG	2	6	13567	13572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379987617
146	NC_016828	AAT	2	6	13577	13582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379987617
147	NC_016828	AAT	2	6	13644	13649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379987617
148	NC_016828	CAC	2	6	13759	13764	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379987617
149	NC_016828	CTA	2	6	13801	13806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379987617
150	NC_016828	TAA	2	6	13832	13837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379987617
151	NC_016828	AAT	2	6	13985	13990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379987617
152	NC_016828	ATT	2	6	14118	14123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379987617
153	NC_016828	GAA	2	6	14268	14273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379987618
154	NC_016828	CAT	2	6	14289	14294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379987618
155	NC_016828	CTA	2	6	14310	14315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379987618
156	NC_016828	AAT	2	6	14356	14361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379987618
157	NC_016828	TAA	2	6	14377	14382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379987618
158	NC_016828	CAT	2	6	14403	14408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379987618
159	NC_016828	AGC	2	6	14473	14478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379987618
160	NC_016828	CAT	2	6	14484	14489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379987618
161	NC_016828	GAT	2	6	14750	14755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379987618
162	NC_016828	ATT	2	6	14770	14775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379987618
163	NC_016828	AAT	2	6	14794	14799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379987618
164	NC_016828	CAA	2	6	14847	14852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379987618
165	NC_016828	ATT	2	6	14998	15003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379987618
166	NC_016828	CCA	2	6	15024	15029	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379987618
167	NC_016828	CAT	2	6	15096	15101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379987618
168	NC_016828	TCA	2	6	15144	15149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379987618
169	NC_016828	CAT	2	6	15192	15197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379987618
170	NC_016828	ATT	2	6	15212	15217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379987618
171	NC_016828	TAT	2	6	15720	15725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379987619
172	NC_016828	AAT	2	6	15840	15845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379987619
173	NC_016828	GAT	3	9	15881	15889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379987619
174	NC_016828	ATC	2	6	16380	16385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379987620
175	NC_016828	ATC	2	6	16445	16450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379987620
176	NC_016828	CTG	2	6	16453	16458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379987620
177	NC_016828	CAG	2	6	16471	16476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379987620
178	NC_016828	GAT	2	6	16486	16491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379987620
179	NC_016828	ATC	2	6	16526	16531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379987620
180	NC_016828	AAT	2	6	16582	16587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379987620
181	NC_016828	GTT	2	6	16686	16691	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379987620
182	NC_016828	TTA	2	6	16692	16697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379987620
183	NC_016828	AGT	2	6	16714	16719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379987620
184	NC_016828	CAA	2	6	16765	16770	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379987620
185	NC_016828	TAA	2	6	16903	16908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379987620
186	NC_016828	TCA	2	6	17028	17033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379987620
187	NC_016828	TGA	2	6	17040	17045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379987620
188	NC_016828	GCA	2	6	17112	17117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379987620
189	NC_016828	ACA	2	6	17119	17124	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379987620
190	NC_016828	CAG	2	6	17281	17286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379987620
191	NC_016828	ATT	2	6	17297	17302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379987620
192	NC_016828	CAA	2	6	17323	17328	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379987620
193	NC_016828	ATG	2	6	17329	17334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379987620
194	NC_016828	ATT	2	6	17384	17389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379987620
195	NC_016828	TGC	2	6	17501	17506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379987620
196	NC_016828	CAA	2	6	17572	17577	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379987620
197	NC_016828	AAC	2	6	17645	17650	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379987620
198	NC_016828	TCT	3	9	17694	17702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379987621
199	NC_016828	CAG	2	6	17757	17762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379987621
200	NC_016828	CAT	2	6	17763	17768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379987621
201	NC_016828	TAT	2	6	17769	17774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379987621
202	NC_016828	TCC	2	6	17822	17827	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379987622
203	NC_016828	TCT	3	9	17834	17842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379987622
204	NC_016828	CAC	2	6	17886	17891	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379987622
205	NC_016828	TTA	2	6	17903	17908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379987622
206	NC_016828	GCA	2	6	17927	17932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379987622
207	NC_016828	TTG	2	6	17944	17949	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379987622
208	NC_016828	TGA	2	6	17978	17983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379987622
209	NC_016828	CAT	2	6	18057	18062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379987622
210	NC_016828	TAA	2	6	18159	18164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379987622
211	NC_016828	TAC	2	6	18193	18198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379987622

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.