MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides J18 plasmid pKLE01

Total Repeats: 113

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016827	TCC	2	6	2104	2109	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_016827	AAT	2	6	2146	2151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016827	ATA	2	6	2159	2164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016827	GAA	2	6	2178	2183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016827	TAA	2	6	2225	2230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016827	AGG	2	6	2233	2238	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016827	TGA	2	6	5201	5206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016827	CTT	2	6	5261	5266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_016827	GGA	2	6	5294	5299	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016827	ATT	2	6	5651	5656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016827	AGC	2	6	5672	5677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_016827	TAG	2	6	8425	8430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016827	TAA	2	6	8463	8468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016827	GTT	2	6	8483	8488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016827	ATA	2	6	8497	8502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016827	ACA	2	6	8509	8514	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_016827	TCA	2	6	8535	8540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_016827	CTC	2	6	8567	8572	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_016827	GAG	2	6	8663	8668	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016827	TTG	2	6	8672	8677	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016827	TAT	2	6	8689	8694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016827	TGG	2	6	8726	8731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016827	TCC	2	6	8757	8762	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_016827	AAC	2	6	8915	8920	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_016827	TGT	2	6	8945	8950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016827	TCA	2	6	9100	9105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_016827	ATT	2	6	9150	9155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016827	ATT	2	6	9221	9226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016827	TTA	2	6	9262	9267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016827	CTC	2	6	9371	9376	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_016827	ATG	2	6	9388	9393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016827	AAC	2	6	9429	9434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_016827	ATT	2	6	9692	9697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016827	ATA	2	6	9752	9757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016827	CTG	2	6	9798	9803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_016827	ACT	2	6	9821	9826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_016827	ATT	2	6	10150	10155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016827	ATC	2	6	10225	10230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_016827	ATA	2	6	10280	10285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016827	ATT	2	6	10374	10379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016827	TAA	2	6	10434	10439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016827	TGA	2	6	10849	10854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016827	TTA	2	6	11583	11588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016827	AAG	2	6	11606	11611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016827	TAT	2	6	11667	11672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016827	TGC	2	6	11691	11696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_016827	AAG	2	6	11711	11716	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016827	AAT	2	6	11729	11734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016827	TAG	2	6	11862	11867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016827	ATA	2	6	11927	11932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016827	TTA	2	6	11970	11975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016827	CAT	2	6	11992	11997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_016827	AAC	2	6	12084	12089	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_016827	TTG	2	6	12093	12098	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016827	AAT	2	6	12158	12163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016827	AAT	2	6	12925	12930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016827	ACT	2	6	12968	12973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_016827	ATA	2	6	13052	13057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016827	ACA	2	6	13088	13093	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_016827	TGT	2	6	13095	13100	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016827	TAT	2	6	13718	13723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016827	ATA	2	6	13794	13799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016827	ATA	2	6	16166	16171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016827	TAG	2	6	16235	16240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016827	TGT	2	6	16254	16259	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016827	TGT	2	6	17521	17526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016827	CAA	2	6	17558	17563	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_016827	TAA	2	6	17650	17655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016827	TAT	2	6	17660	17665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016827	ATT	2	6	17732	17737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016827	CCA	2	6	17849	17854	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_016827	TGT	2	6	17932	17937	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016827	ACT	2	6	18091	18096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_016827	GTA	2	6	18142	18147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016827	CAA	2	6	18470	18475	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_016827	ATA	3	9	18533	18541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016827	TGT	2	6	18560	18565	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016827	GGT	3	9	18566	18574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016827	TGG	2	6	18599	18604	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016827	TCT	2	6	19769	19774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_016827	AAT	2	6	19913	19918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016827	AGT	2	6	19960	19965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016827	TGA	2	6	19995	20000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016827	ACT	2	6	20029	20034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_016827	GTT	2	6	20203	20208	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016827	TTG	2	6	20270	20275	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016827	GTG	2	6	20347	20352	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016827	TTG	2	6	20694	20699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016827	CTG	2	6	23154	23159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_016827	CTG	2	6	23181	23186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_016827	TGG	2	6	23196	23201	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016827	TAA	2	6	23400	23405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016827	ATT	2	6	23434	23439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016827	GGA	2	6	24977	24982	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016827	AGG	2	6	26268	26273	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016827	ATC	2	6	28877	28882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_016827	GTG	2	6	31494	31499	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016827	GGT	2	6	31522	31527	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016827	AGT	2	6	31769	31774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_016827	ATG	2	6	31810	31815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_016827	ATG	2	6	31822	31827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016827	TGA	2	6	36078	36083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016827	ACT	2	6	36106	36111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_016827	ACC	2	6	36188	36193	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_016827	TAT	2	6	36274	36279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016827	CTG	2	6	36378	36383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_016827	AAT	2	6	36689	36694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016827	AAT	2	6	36746	36751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016827	TGA	2	6	36772	36777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016827	ATA	2	6	36873	36878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016827	AAC	2	6	36907	36912	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_016827	GTG	2	6	37103	37108	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016827	ATT	2	6	37136	37141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.