MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides J18 plasmid pKLE01

Total Repeats: 403

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016827	CAG	2	6	78	83	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379703890
2	NC_016827	TAG	2	6	330	335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379703890
3	NC_016827	ATT	2	6	337	342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379703890
4	NC_016827	AAC	2	6	343	348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379703890
5	NC_016827	TCA	2	6	420	425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379703890
6	NC_016827	TAA	2	6	984	989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379703891
7	NC_016827	TGA	2	6	1002	1007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379703891
8	NC_016827	TGA	2	6	1038	1043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379703891
9	NC_016827	AGT	2	6	1128	1133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379703891
10	NC_016827	ATG	2	6	1174	1179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379703892
11	NC_016827	TGT	2	6	1217	1222	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379703892
12	NC_016827	TAT	2	6	1248	1253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379703892
13	NC_016827	TAA	3	9	1271	1279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379703892
14	NC_016827	ATT	2	6	1285	1290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379703892
15	NC_016827	TGT	2	6	1391	1396	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379703892
16	NC_016827	TTG	2	6	1405	1410	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379703892
17	NC_016827	ATG	2	6	1426	1431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379703892
18	NC_016827	TAA	2	6	1467	1472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379703892
19	NC_016827	ATT	2	6	1627	1632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379703893
20	NC_016827	GAT	2	6	1941	1946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379703894
21	NC_016827	TTA	2	6	1980	1985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379703894
22	NC_016827	ATT	2	6	2012	2017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379703894
23	NC_016827	CTG	2	6	2024	2029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379703894
24	NC_016827	TTC	2	6	2033	2038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379703894
25	NC_016827	AGA	2	6	2045	2050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379703894
26	NC_016827	TTA	2	6	2073	2078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379703894
27	NC_016827	GAT	2	6	2252	2257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379703895
28	NC_016827	TTA	2	6	2385	2390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379703895
29	NC_016827	AAT	2	6	2501	2506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379703895
30	NC_016827	CAT	2	6	2522	2527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379703895
31	NC_016827	ACT	2	6	2534	2539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379703895
32	NC_016827	AAC	2	6	2946	2951	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379703896
33	NC_016827	ATG	2	6	3108	3113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379703896
34	NC_016827	CTG	2	6	3174	3179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379703896
35	NC_016827	TGT	2	6	3340	3345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379703896
36	NC_016827	TAT	2	6	3511	3516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379703896
37	NC_016827	ATT	2	6	3622	3627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379703896
38	NC_016827	CTA	2	6	3686	3691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379703896
39	NC_016827	ATT	2	6	3804	3809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379703896
40	NC_016827	AAC	2	6	3889	3894	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379703896
41	NC_016827	TAA	2	6	3957	3962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379703896
42	NC_016827	AAT	2	6	3964	3969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379703896
43	NC_016827	GTA	2	6	4001	4006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379703896
44	NC_016827	ATT	2	6	4025	4030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379703896
45	NC_016827	TCT	2	6	4031	4036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379703896
46	NC_016827	TTG	2	6	4089	4094	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379703896
47	NC_016827	TAA	2	6	4282	4287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379703896
48	NC_016827	TCA	2	6	4296	4301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379703896
49	NC_016827	AAT	2	6	4364	4369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379703896
50	NC_016827	TGA	2	6	4486	4491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379703896
51	NC_016827	TAA	2	6	4894	4899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379703896
52	NC_016827	TGA	2	6	4927	4932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379703896
53	NC_016827	CAA	2	6	4935	4940	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379703896
54	NC_016827	GGT	2	6	5093	5098	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379703896
55	NC_016827	TGA	2	6	5122	5127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379703896
56	NC_016827	TAT	2	6	5128	5133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379703896
57	NC_016827	CAA	2	6	5315	5320	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379703897
58	NC_016827	AAG	2	6	5360	5365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379703897
59	NC_016827	GAT	2	6	5412	5417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379703897
60	NC_016827	TAC	2	6	5426	5431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379703897
61	NC_016827	AGA	2	6	5442	5447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379703897
62	NC_016827	ATT	2	6	5545	5550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379703897
63	NC_016827	TTG	2	6	5579	5584	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379703897
64	NC_016827	GCT	2	6	5688	5693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379703898
65	NC_016827	TGA	2	6	5834	5839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379703898
66	NC_016827	AAG	2	6	5843	5848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379703898
67	NC_016827	ATA	2	6	5902	5907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379703898
68	NC_016827	GAT	2	6	5909	5914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379703898
69	NC_016827	ATG	2	6	5926	5931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379703898
70	NC_016827	CAA	2	6	5934	5939	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379703898
71	NC_016827	TAT	2	6	5949	5954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379703898
72	NC_016827	ACT	2	6	6273	6278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379703898
73	NC_016827	TTA	2	6	6343	6348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379703898
74	NC_016827	TGC	2	6	6350	6355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379703898
75	NC_016827	TTG	2	6	6421	6426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379703898
76	NC_016827	TCA	2	6	6491	6496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379703898
77	NC_016827	ATC	2	6	6715	6720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379703898
78	NC_016827	TAT	2	6	6729	6734	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379703898
79	NC_016827	ATG	2	6	6753	6758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379703898
80	NC_016827	TCT	2	6	6836	6841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379703898
81	NC_016827	GAT	2	6	6873	6878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379703898
82	NC_016827	CTC	2	6	6904	6909	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379703898
83	NC_016827	AGC	2	6	6917	6922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379703898
84	NC_016827	ATT	2	6	6963	6968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379703898
85	NC_016827	ATA	2	6	6982	6987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379703898
86	NC_016827	TTA	2	6	7029	7034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379703898
87	NC_016827	TCT	2	6	7047	7052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379703898
88	NC_016827	TAA	2	6	7205	7210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379703898
89	NC_016827	AAT	2	6	7285	7290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379703898
90	NC_016827	CAG	2	6	7362	7367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379703899
91	NC_016827	GTC	2	6	7421	7426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379703899
92	NC_016827	CTG	2	6	7437	7442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379703899
93	NC_016827	CAA	2	6	7598	7603	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379703900
94	NC_016827	CTT	2	6	7645	7650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379703900
95	NC_016827	TAA	2	6	7714	7719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379703900
96	NC_016827	TCT	2	6	7751	7756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379703900
97	NC_016827	TAA	2	6	7834	7839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379703900
98	NC_016827	GTG	2	6	7866	7871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379703900
99	NC_016827	TTA	2	6	7944	7949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379703900
100	NC_016827	TTG	2	6	7997	8002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379703900
101	NC_016827	TGT	2	6	8200	8205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379703900
102	NC_016827	ATG	2	6	8343	8348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379703900
103	NC_016827	TAA	2	6	8366	8371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379703900
104	NC_016827	TTA	2	6	10692	10697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379703901
105	NC_016827	CAA	2	6	10723	10728	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379703901
106	NC_016827	AAT	2	6	10735	10740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379703901
107	NC_016827	TAT	2	6	10948	10953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379703902
108	NC_016827	ATT	2	6	10964	10969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379703902
109	NC_016827	TGA	2	6	11161	11166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379703902
110	NC_016827	TTA	2	6	11178	11183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379703902
111	NC_016827	TGG	2	6	11242	11247	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379703902
112	NC_016827	TAT	2	6	11256	11261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379703902
113	NC_016827	CTG	2	6	11304	11309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379703902
114	NC_016827	CCT	2	6	11393	11398	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379703902
115	NC_016827	TTG	2	6	11550	11555	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379703902
116	NC_016827	ATA	2	6	12362	12367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379703903
117	NC_016827	AAC	2	6	12387	12392	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379703903
118	NC_016827	ATG	2	6	12469	12474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379703903
119	NC_016827	AGA	2	6	12498	12503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379703903
120	NC_016827	CAT	2	6	12506	12511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379703903
121	NC_016827	ATT	2	6	12619	12624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379703903
122	NC_016827	CTT	2	6	13251	13256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379703904
123	NC_016827	AAT	2	6	13309	13314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379703904
124	NC_016827	CTT	2	6	13597	13602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379703904
125	NC_016827	ACC	2	6	14046	14051	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379703905
126	NC_016827	TAT	2	6	14063	14068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379703905
127	NC_016827	CTT	2	6	14075	14080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379703905
128	NC_016827	TTA	2	6	14134	14139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379703905
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130	NC_016827	TTG	2	6	14335	14340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379703905
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403	NC_016827	TAC	2	6	35888	35893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379703931

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.