MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides J18 plasmid pKLE01

Total Repeats: 51

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016827	GA	3	6	136	141	50 %	0 %	50 %	0 %	379703890
2	NC_016827	TA	3	6	177	182	50 %	50 %	0 %	0 %	379703890
3	NC_016827	AG	3	6	811	816	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016827	TA	3	6	2205	2210	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016827	AT	3	6	2512	2517	50 %	50 %	0 %	0 %	379703895
6	NC_016827	GT	3	6	3044	3049	0 %	50 %	50 %	0 %	379703896
7	NC_016827	AG	3	6	3287	3292	50 %	0 %	50 %	0 %	379703896
8	NC_016827	AT	3	6	3488	3493	50 %	50 %	0 %	0 %	379703896
9	NC_016827	CT	3	6	4132	4137	0 %	50 %	0 %	50 %	379703896
10	NC_016827	GA	3	6	4495	4500	50 %	0 %	50 %	0 %	379703896
11	NC_016827	AT	3	6	5234	5239	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016827	TA	3	6	5251	5256	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016827	AG	3	6	6151	6156	50 %	0 %	50 %	0 %	379703898
14	NC_016827	AT	3	6	8549	8554	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016827	AT	3	6	9452	9457	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016827	AT	3	6	9723	9728	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016827	TG	3	6	10317	10322	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016827	TA	3	6	10395	10400	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016827	AT	3	6	10606	10611	50 %	50 %	0 %	0 %	379703901
20	NC_016827	AT	3	6	12720	12725	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016827	AT	3	6	12794	12799	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016827	AT	3	6	13133	13138	50 %	50 %	0 %	0 %	379703904
23	NC_016827	TA	3	6	14025	14030	50 %	50 %	0 %	0 %	379703905
24	NC_016827	AT	3	6	14401	14406	50 %	50 %	0 %	0 %	379703905
25	NC_016827	CT	3	6	15093	15098	0 %	50 %	0 %	50 %	379703905
26	NC_016827	AT	3	6	15158	15163	50 %	50 %	0 %	0 %	379703905
27	NC_016827	TA	3	6	15883	15888	50 %	50 %	0 %	0 %	379703906
28	NC_016827	AT	3	6	16004	16009	50 %	50 %	0 %	0 %	379703906
29	NC_016827	CT	3	6	16095	16100	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_016827	AG	3	6	16592	16597	50 %	0 %	50 %	0 %	379703907
31	NC_016827	TG	3	6	16978	16983	0 %	50 %	50 %	0 %	379703908
32	NC_016827	TA	3	6	17109	17114	50 %	50 %	0 %	0 %	379703908
33	NC_016827	AT	3	6	17607	17612	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016827	AT	3	6	17688	17693	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016827	TA	3	6	17723	17728	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016827	TA	3	6	17739	17744	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016827	CG	3	6	18582	18587	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_016827	AT	3	6	19150	19155	50 %	50 %	0 %	0 %	379703909
39	NC_016827	TA	3	6	19522	19527	50 %	50 %	0 %	0 %	379703910
40	NC_016827	GA	3	6	19783	19788	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016827	GC	3	6	20062	20067	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_016827	TA	3	6	23067	23072	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016827	CA	3	6	24983	24988	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_016827	AG	3	6	26921	26926	50 %	0 %	50 %	0 %	379703921
45	NC_016827	CA	3	6	27131	27136	50 %	0 %	0 %	50 %	379703922
46	NC_016827	GT	3	6	29253	29258	0 %	50 %	50 %	0 %	379703925
47	NC_016827	TG	3	6	29641	29646	0 %	50 %	50 %	0 %	379703925
48	NC_016827	AG	3	6	32717	32722	50 %	0 %	50 %	0 %	379703927
49	NC_016827	GA	3	6	34301	34306	50 %	0 %	50 %	0 %	379703928
50	NC_016827	AG	3	6	35168	35173	50 %	0 %	50 %	0 %	379703930
51	NC_016827	AG	3	6	36811	36816	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.