MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. P-stx-12 plasmid unnamed

Total Repeats: 230

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016825	GT	3	6	480	485	0 %	50 %	50 %	0 %	378962822
2	NC_016825	CT	4	8	661	668	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_016825	TC	3	6	974	979	0 %	50 %	0 %	50 %	378962823
4	NC_016825	CA	3	6	1035	1040	50 %	0 %	0 %	50 %	378962823
5	NC_016825	AT	3	6	1534	1539	50 %	50 %	0 %	0 %	378962823
6	NC_016825	CA	3	6	2158	2163	50 %	0 %	0 %	50 %	378962824
7	NC_016825	TG	4	8	2467	2474	0 %	50 %	50 %	0 %	378962825
8	NC_016825	CA	3	6	2978	2983	50 %	0 %	0 %	50 %	378962825
9	NC_016825	TC	3	6	3108	3113	0 %	50 %	0 %	50 %	378962825
10	NC_016825	TC	3	6	3458	3463	0 %	50 %	0 %	50 %	378962826
11	NC_016825	TA	3	6	5740	5745	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016825	CA	3	6	5995	6000	50 %	0 %	0 %	50 %	378962831
13	NC_016825	TG	3	6	7087	7092	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016825	AT	3	6	7352	7357	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016825	GA	3	6	8235	8240	50 %	0 %	50 %	0 %	378962834
16	NC_016825	GA	3	6	8901	8906	50 %	0 %	50 %	0 %	378962835
17	NC_016825	AT	4	8	9266	9273	50 %	50 %	0 %	0 %	378962835
18	NC_016825	AT	3	6	9351	9356	50 %	50 %	0 %	0 %	378962835
19	NC_016825	AC	3	6	9792	9797	50 %	0 %	0 %	50 %	378962836
20	NC_016825	TA	3	6	11676	11681	50 %	50 %	0 %	0 %	378962838
21	NC_016825	CT	3	6	11843	11848	0 %	50 %	0 %	50 %	378962838
22	NC_016825	CA	3	6	13990	13995	50 %	0 %	0 %	50 %	378962841
23	NC_016825	AT	3	6	14028	14033	50 %	50 %	0 %	0 %	378962841
24	NC_016825	TC	3	6	14512	14517	0 %	50 %	0 %	50 %	378962841
25	NC_016825	AT	3	6	14842	14847	50 %	50 %	0 %	0 %	378962842
26	NC_016825	AC	3	6	15694	15699	50 %	0 %	0 %	50 %	378962843
27	NC_016825	TC	3	6	16751	16756	0 %	50 %	0 %	50 %	378962843
28	NC_016825	AG	3	6	17189	17194	50 %	0 %	50 %	0 %	378962844
29	NC_016825	TA	3	6	18380	18385	50 %	50 %	0 %	0 %	378962845
30	NC_016825	TA	3	6	19333	19338	50 %	50 %	0 %	0 %	378962846
31	NC_016825	AC	3	6	20411	20416	50 %	0 %	0 %	50 %	378962847
32	NC_016825	TA	3	6	20487	20492	50 %	50 %	0 %	0 %	378962847
33	NC_016825	CT	3	6	20769	20774	0 %	50 %	0 %	50 %	378962848
34	NC_016825	TC	4	8	20896	20903	0 %	50 %	0 %	50 %	378962848
35	NC_016825	TC	3	6	21052	21057	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_016825	GT	3	6	21365	21370	0 %	50 %	50 %	0 %	378962849
37	NC_016825	CT	3	6	21547	21552	0 %	50 %	0 %	50 %	378962849
38	NC_016825	GT	3	6	21690	21695	0 %	50 %	50 %	0 %	378962849
39	NC_016825	TA	4	8	21993	22000	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016825	GC	3	6	23806	23811	0 %	0 %	50 %	50 %	378962851
41	NC_016825	CT	3	6	25288	25293	0 %	50 %	0 %	50 %	378962854
42	NC_016825	CT	3	6	25435	25440	0 %	50 %	0 %	50 %	378962854
43	NC_016825	CT	3	6	27370	27375	0 %	50 %	0 %	50 %	378962855
44	NC_016825	CA	3	6	27478	27483	50 %	0 %	0 %	50 %	378962855
45	NC_016825	CG	3	6	27894	27899	0 %	0 %	50 %	50 %	378962855
46	NC_016825	CA	3	6	28222	28227	50 %	0 %	0 %	50 %	378962855
47	NC_016825	AT	3	6	29195	29200	50 %	50 %	0 %	0 %	378962855
48	NC_016825	TA	3	6	29228	29233	50 %	50 %	0 %	0 %	378962856
49	NC_016825	CA	3	6	29437	29442	50 %	0 %	0 %	50 %	378962856
50	NC_016825	CT	3	6	30340	30345	0 %	50 %	0 %	50 %	378962857
51	NC_016825	CT	3	6	30913	30918	0 %	50 %	0 %	50 %	378962858
52	NC_016825	TC	3	6	32416	32421	0 %	50 %	0 %	50 %	378962859
53	NC_016825	TC	3	6	32432	32437	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_016825	GA	3	6	34393	34398	50 %	0 %	50 %	0 %	378962862
55	NC_016825	AG	3	6	35402	35407	50 %	0 %	50 %	0 %	378962862
56	NC_016825	AG	3	6	36212	36217	50 %	0 %	50 %	0 %	378962862
57	NC_016825	AT	3	6	36430	36435	50 %	50 %	0 %	0 %	378962862
58	NC_016825	GA	3	6	37520	37525	50 %	0 %	50 %	0 %	378962863
59	NC_016825	CT	3	6	37680	37685	0 %	50 %	0 %	50 %	378962864
60	NC_016825	CT	3	6	37860	37865	0 %	50 %	0 %	50 %	378962864
61	NC_016825	CT	3	6	39370	39375	0 %	50 %	0 %	50 %	378962866
62	NC_016825	TC	3	6	39576	39581	0 %	50 %	0 %	50 %	378962866
63	NC_016825	AC	3	6	41031	41036	50 %	0 %	0 %	50 %	378962868
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65	NC_016825	AC	3	6	42113	42118	50 %	0 %	0 %	50 %	378962869
66	NC_016825	AT	4	8	43532	43539	50 %	50 %	0 %	0 %	378962872
67	NC_016825	TA	3	6	44427	44432	50 %	50 %	0 %	0 %	378962873
68	NC_016825	GT	3	6	45722	45727	0 %	50 %	50 %	0 %	378962874
69	NC_016825	CG	3	6	45918	45923	0 %	0 %	50 %	50 %	378962874
70	NC_016825	AG	3	6	46299	46304	50 %	0 %	50 %	0 %	378962874
71	NC_016825	TA	3	6	46401	46406	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016825	AG	3	6	48934	48939	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016825	TA	3	6	49833	49838	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_016825	CG	3	6	50995	51000	0 %	0 %	50 %	50 %	378962882
75	NC_016825	TA	3	6	51357	51362	50 %	50 %	0 %	0 %	378962882
76	NC_016825	AT	3	6	51408	51413	50 %	50 %	0 %	0 %	378962882
77	NC_016825	AG	3	6	51576	51581	50 %	0 %	50 %	0 %	378962882
78	NC_016825	TG	3	6	51750	51755	0 %	50 %	50 %	0 %	378962882
79	NC_016825	AT	3	6	52336	52341	50 %	50 %	0 %	0 %	378962883
80	NC_016825	GT	3	6	52773	52778	0 %	50 %	50 %	0 %	378962883
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82	NC_016825	TG	3	6	57302	57307	0 %	50 %	50 %	0 %	378962887
83	NC_016825	GA	3	6	58629	58634	50 %	0 %	50 %	0 %	378962888
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85	NC_016825	CT	3	6	60937	60942	0 %	50 %	0 %	50 %	378962891
86	NC_016825	AT	3	6	61867	61872	50 %	50 %	0 %	0 %	378962892
87	NC_016825	AG	3	6	64336	64341	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016825	AT	3	6	66398	66403	50 %	50 %	0 %	0 %	378962901
89	NC_016825	CA	3	6	66682	66687	50 %	0 %	0 %	50 %	378962901
90	NC_016825	CT	3	6	67262	67267	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_016825	TC	3	6	67271	67276	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_016825	AT	3	6	67422	67427	50 %	50 %	0 %	0 %	378962902
93	NC_016825	TG	3	6	69021	69026	0 %	50 %	50 %	0 %	378962905
94	NC_016825	AT	3	6	69860	69865	50 %	50 %	0 %	0 %	378962906
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99	NC_016825	TC	3	6	78689	78694	0 %	50 %	0 %	50 %	378962915
100	NC_016825	AT	3	6	79240	79245	50 %	50 %	0 %	0 %	378962916
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103	NC_016825	TA	3	6	81163	81168	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016825	CA	3	6	82868	82873	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_016825	AC	3	6	83065	83070	50 %	0 %	0 %	50 %	378962920
106	NC_016825	AG	3	6	83100	83105	50 %	0 %	50 %	0 %	378962920
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108	NC_016825	TG	3	6	85821	85826	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016825	TG	3	6	85834	85839	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016825	TG	3	6	87110	87115	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016825	TC	3	6	88139	88144	0 %	50 %	0 %	50 %	378962927
112	NC_016825	CA	3	6	88960	88965	50 %	0 %	0 %	50 %	378962928
113	NC_016825	GA	3	6	89173	89178	50 %	0 %	50 %	0 %	378962928
114	NC_016825	AT	3	6	90161	90166	50 %	50 %	0 %	0 %	378962930
115	NC_016825	AT	3	6	90362	90367	50 %	50 %	0 %	0 %	378962931
116	NC_016825	CT	3	6	91763	91768	0 %	50 %	0 %	50 %	378962933
117	NC_016825	AG	3	6	92735	92740	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016825	AC	3	6	94129	94134	50 %	0 %	0 %	50 %	378962938
119	NC_016825	CG	3	6	95325	95330	0 %	0 %	50 %	50 %	378962940
120	NC_016825	GT	3	6	96852	96857	0 %	50 %	50 %	0 %	378962940
121	NC_016825	TG	3	6	97130	97135	0 %	50 %	50 %	0 %	378962940
122	NC_016825	GT	4	8	97601	97608	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_016825	AT	3	6	97707	97712	50 %	50 %	0 %	0 %	378962941
124	NC_016825	AG	3	6	98035	98040	50 %	0 %	50 %	0 %	378962941
125	NC_016825	TA	3	6	98096	98101	50 %	50 %	0 %	0 %	378962941
126	NC_016825	TG	3	6	98395	98400	0 %	50 %	50 %	0 %	378962942
127	NC_016825	TG	3	6	98595	98600	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_016825	TG	3	6	98606	98611	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016825	GA	3	6	99429	99434	50 %	0 %	50 %	0 %	378962945
130	NC_016825	TC	3	6	100145	100150	0 %	50 %	0 %	50 %	378962947
131	NC_016825	CG	3	6	101794	101799	0 %	0 %	50 %	50 %	378962951
132	NC_016825	AG	4	8	103652	103659	50 %	0 %	50 %	0 %	378962955
133	NC_016825	GC	4	8	104095	104102	0 %	0 %	50 %	50 %	378962956
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135	NC_016825	GT	3	6	104888	104893	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_016825	GC	3	6	104924	104929	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
137	NC_016825	AG	4	8	106652	106659	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_016825	GA	3	6	108018	108023	50 %	0 %	50 %	0 %	378962967
139	NC_016825	GA	3	6	110451	110456	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_016825	TA	3	6	111026	111031	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_016825	CT	3	6	111093	111098	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_016825	TA	3	6	116499	116504	50 %	50 %	0 %	0 %	378962982
143	NC_016825	CA	4	8	117376	117383	50 %	0 %	0 %	50 %	378962983
144	NC_016825	GA	4	8	117515	117522	50 %	0 %	50 %	0 %	378962983
145	NC_016825	CA	3	6	117957	117962	50 %	0 %	0 %	50 %	378962983
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.