MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. P-stx-12 plasmid unnamed

Total Repeats: 299

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016825	A	6	6	243	248	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016825	T	7	7	446	452	0 %	100 %	0 %	0 %	378962822
3	NC_016825	T	7	7	612	618	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016825	T	6	6	668	673	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016825	T	6	6	852	857	0 %	100 %	0 %	0 %	378962823
6	NC_016825	C	6	6	1624	1629	0 %	0 %	0 %	100 %	378962823
7	NC_016825	T	6	6	3078	3083	0 %	100 %	0 %	0 %	378962825
8	NC_016825	T	6	6	3634	3639	0 %	100 %	0 %	0 %	378962826
9	NC_016825	A	6	6	5584	5589	100 %	0 %	0 %	0 %	378962830
10	NC_016825	A	7	7	6530	6536	100 %	0 %	0 %	0 %	378962832
11	NC_016825	A	9	9	7300	7308	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016825	A	6	6	8496	8501	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016825	T	6	6	8711	8716	0 %	100 %	0 %	0 %	378962835
14	NC_016825	A	6	6	10595	10600	100 %	0 %	0 %	0 %	378962837
15	NC_016825	A	6	6	11175	11180	100 %	0 %	0 %	0 %	378962837
16	NC_016825	A	6	6	11467	11472	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016825	T	6	6	11656	11661	0 %	100 %	0 %	0 %	378962838
18	NC_016825	A	8	8	13151	13158	100 %	0 %	0 %	0 %	378962840
19	NC_016825	C	8	8	13238	13245	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
20	NC_016825	A	6	6	13437	13442	100 %	0 %	0 %	0 %	378962841
21	NC_016825	A	6	6	15070	15075	100 %	0 %	0 %	0 %	378962843
22	NC_016825	A	6	6	15768	15773	100 %	0 %	0 %	0 %	378962843
23	NC_016825	T	7	7	16481	16487	0 %	100 %	0 %	0 %	378962843
24	NC_016825	A	6	6	17163	17168	100 %	0 %	0 %	0 %	378962844
25	NC_016825	T	6	6	18515	18520	0 %	100 %	0 %	0 %	378962846
26	NC_016825	T	7	7	20039	20045	0 %	100 %	0 %	0 %	378962847
27	NC_016825	A	6	6	20557	20562	100 %	0 %	0 %	0 %	378962847
28	NC_016825	T	6	6	20597	20602	0 %	100 %	0 %	0 %	378962847
29	NC_016825	T	6	6	21539	21544	0 %	100 %	0 %	0 %	378962849
30	NC_016825	T	6	6	22852	22857	0 %	100 %	0 %	0 %	378962851
31	NC_016825	T	7	7	23337	23343	0 %	100 %	0 %	0 %	378962851
32	NC_016825	A	6	6	24528	24533	100 %	0 %	0 %	0 %	378962853
33	NC_016825	T	6	6	25036	25041	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016825	A	6	6	25971	25976	100 %	0 %	0 %	0 %	378962854
35	NC_016825	T	7	7	26015	26021	0 %	100 %	0 %	0 %	378962855
36	NC_016825	T	6	6	26467	26472	0 %	100 %	0 %	0 %	378962855
37	NC_016825	T	6	6	27524	27529	0 %	100 %	0 %	0 %	378962855
38	NC_016825	T	7	7	29290	29296	0 %	100 %	0 %	0 %	378962856
39	NC_016825	T	6	6	29431	29436	0 %	100 %	0 %	0 %	378962856
40	NC_016825	A	6	6	29988	29993	100 %	0 %	0 %	0 %	378962856
41	NC_016825	T	6	6	30255	30260	0 %	100 %	0 %	0 %	378962856
42	NC_016825	T	6	6	30522	30527	0 %	100 %	0 %	0 %	378962858
43	NC_016825	A	8	8	32325	32332	100 %	0 %	0 %	0 %	378962859
44	NC_016825	T	7	7	32548	32554	0 %	100 %	0 %	0 %	378962860
45	NC_016825	A	6	6	32649	32654	100 %	0 %	0 %	0 %	378962861
46	NC_016825	T	6	6	33695	33700	0 %	100 %	0 %	0 %	378962862
47	NC_016825	C	7	7	34994	35000	0 %	0 %	0 %	100 %	378962862
48	NC_016825	A	6	6	36741	36746	100 %	0 %	0 %	0 %	378962862
49	NC_016825	T	7	7	37008	37014	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016825	A	6	6	37041	37046	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016825	A	8	8	37072	37079	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016825	T	6	6	37106	37111	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016825	C	6	6	38189	38194	0 %	0 %	0 %	100 %	378962865
54	NC_016825	T	6	6	38423	38428	0 %	100 %	0 %	0 %	378962865
55	NC_016825	A	7	7	38663	38669	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016825	T	6	6	38697	38702	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016825	T	7	7	38841	38847	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016825	A	8	8	39045	39052	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016825	T	6	6	39271	39276	0 %	100 %	0 %	0 %	378962866
60	NC_016825	A	6	6	39546	39551	100 %	0 %	0 %	0 %	378962866
61	NC_016825	T	8	8	39694	39701	0 %	100 %	0 %	0 %	378962866
62	NC_016825	A	6	6	39703	39708	100 %	0 %	0 %	0 %	378962866
63	NC_016825	T	6	6	39783	39788	0 %	100 %	0 %	0 %	378962866
64	NC_016825	T	7	7	40422	40428	0 %	100 %	0 %	0 %	378962867
65	NC_016825	A	6	6	40972	40977	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016825	A	6	6	41174	41179	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016825	A	6	6	42479	42484	100 %	0 %	0 %	0 %	378962870
68	NC_016825	A	6	6	42636	42641	100 %	0 %	0 %	0 %	378962870
69	NC_016825	A	6	6	42675	42680	100 %	0 %	0 %	0 %	378962870
70	NC_016825	A	6	6	42768	42773	100 %	0 %	0 %	0 %	378962870
71	NC_016825	T	7	7	43555	43561	0 %	100 %	0 %	0 %	378962872
72	NC_016825	T	6	6	44000	44005	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016825	T	6	6	44093	44098	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_016825	T	6	6	45227	45232	0 %	100 %	0 %	0 %	378962874
75	NC_016825	A	7	7	46184	46190	100 %	0 %	0 %	0 %	378962874
76	NC_016825	T	8	8	46200	46207	0 %	100 %	0 %	0 %	378962874
77	NC_016825	G	6	6	46627	46632	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016825	G	7	7	46842	46848	0 %	0 %	100 %	0 %	378962875
79	NC_016825	T	6	6	47214	47219	0 %	100 %	0 %	0 %	378962875
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81	NC_016825	A	7	7	48832	48838	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016825	A	6	6	48883	48888	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016825	T	6	6	48940	48945	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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88	NC_016825	A	6	6	49814	49819	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016825	A	6	6	50319	50324	100 %	0 %	0 %	0 %	378962881
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91	NC_016825	A	6	6	53805	53810	100 %	0 %	0 %	0 %	378962883
92	NC_016825	A	6	6	54500	54505	100 %	0 %	0 %	0 %	378962886
93	NC_016825	T	7	7	58285	58291	0 %	100 %	0 %	0 %	378962888
94	NC_016825	T	6	6	58784	58789	0 %	100 %	0 %	0 %	378962888
95	NC_016825	C	7	7	59378	59384	0 %	0 %	0 %	100 %	378962889
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107	NC_016825	T	7	7	64841	64847	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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112	NC_016825	T	6	6	67253	67258	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016825	T	6	6	67518	67523	0 %	100 %	0 %	0 %	378962902
114	NC_016825	A	7	7	68105	68111	100 %	0 %	0 %	0 %	378962903
115	NC_016825	A	7	7	68363	68369	100 %	0 %	0 %	0 %	378962903
116	NC_016825	A	6	6	68869	68874	100 %	0 %	0 %	0 %	378962904
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123	NC_016825	A	6	6	71607	71612	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_016825	T	6	6	71649	71654	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_016825	T	8	8	71657	71664	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016825	A	6	6	71675	71680	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_016825	T	6	6	71728	71733	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_016825	T	9	9	71817	71825	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016825	A	6	6	71860	71865	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_016825	A	6	6	72523	72528	100 %	0 %	0 %	0 %	378962908
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146	NC_016825	A	7	7	89501	89507	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_016825	C	6	6	89881	89886	0 %	0 %	0 %	100 %	378962929
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.