MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Shigella sonnei 53G

Total Repeats: 7738

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016822	TG	3	6	37	42	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016822	CT	3	6	445	450	0 %	50 %	0 %	50 %	383176585
3	NC_016822	GC	3	6	1333	1338	0 %	0 %	50 %	50 %	383176585
4	NC_016822	TG	3	6	1435	1440	0 %	50 %	50 %	0 %	383176585
5	NC_016822	CG	4	8	2526	2533	0 %	0 %	50 %	50 %	383176585
6	NC_016822	GC	3	6	3961	3966	0 %	0 %	50 %	50 %	383176587
7	NC_016822	GC	3	6	4442	4447	0 %	0 %	50 %	50 %	383176587
8	NC_016822	TG	3	6	4815	4820	0 %	50 %	50 %	0 %	383176587
9	NC_016822	AG	3	6	4882	4887	50 %	0 %	50 %	0 %	383176587
10	NC_016822	AT	3	6	5613	5618	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016822	CG	3	6	7553	7558	0 %	0 %	50 %	50 %	383176591
12	NC_016822	CG	3	6	7745	7750	0 %	0 %	50 %	50 %	383176591
13	NC_016822	TA	3	6	8024	8029	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016822	TC	3	6	8345	8350	0 %	50 %	0 %	50 %	383176592
15	NC_016822	CG	3	6	8432	8437	0 %	0 %	50 %	50 %	383176592
16	NC_016822	TG	3	6	9477	9482	0 %	50 %	50 %	0 %	383176593
17	NC_016822	AG	3	6	11612	11617	50 %	0 %	50 %	0 %	383176596
18	NC_016822	AT	3	6	12141	12146	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016822	CG	3	6	13558	13563	0 %	0 %	50 %	50 %	383176597
20	NC_016822	CG	3	6	14501	14506	0 %	0 %	50 %	50 %	383176598
21	NC_016822	CT	3	6	15556	15561	0 %	50 %	0 %	50 %	383176599
22	NC_016822	CT	3	6	15719	15724	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_016822	AG	3	6	17151	17156	50 %	0 %	50 %	0 %	383176601
24	NC_016822	TG	3	6	17670	17675	0 %	50 %	50 %	0 %	383176601
25	NC_016822	TG	3	6	18115	18120	0 %	50 %	50 %	0 %	383176601
26	NC_016822	AG	3	6	18833	18838	50 %	0 %	50 %	0 %	383176603
27	NC_016822	GA	3	6	19008	19013	50 %	0 %	50 %	0 %	383176603
28	NC_016822	CT	3	6	20338	20343	0 %	50 %	0 %	50 %	383176605
29	NC_016822	TG	3	6	20388	20393	0 %	50 %	50 %	0 %	383176605
30	NC_016822	GA	3	6	21012	21017	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016822	TA	3	6	22820	22825	50 %	50 %	0 %	0 %	383176607
32	NC_016822	AT	4	8	22942	22949	50 %	50 %	0 %	0 %	383176608
33	NC_016822	TA	3	6	23156	23161	50 %	50 %	0 %	0 %	383176608
34	NC_016822	AT	3	6	23591	23596	50 %	50 %	0 %	0 %	383176608
35	NC_016822	AT	3	6	25718	25723	50 %	50 %	0 %	0 %	383176612
36	NC_016822	TA	3	6	26288	26293	50 %	50 %	0 %	0 %	383176612
37	NC_016822	TC	3	6	26499	26504	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_016822	GT	3	6	27113	27118	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016822	TC	3	6	27119	27124	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_016822	GC	3	6	27433	27438	0 %	0 %	50 %	50 %	383176613
41	NC_016822	GT	3	6	27843	27848	0 %	50 %	50 %	0 %	383176615
42	NC_016822	CG	3	6	27889	27894	0 %	0 %	50 %	50 %	383176615
43	NC_016822	CG	3	6	29275	29280	0 %	0 %	50 %	50 %	383176616
44	NC_016822	GC	3	6	29948	29953	0 %	0 %	50 %	50 %	383176616
45	NC_016822	CG	3	6	30022	30027	0 %	0 %	50 %	50 %	383176616
46	NC_016822	CG	3	6	30750	30755	0 %	0 %	50 %	50 %	383176616
47	NC_016822	GC	3	6	31912	31917	0 %	0 %	50 %	50 %	383176617
48	NC_016822	AT	3	6	32759	32764	50 %	50 %	0 %	0 %	383176619
49	NC_016822	TG	3	6	33109	33114	0 %	50 %	50 %	0 %	383176619
50	NC_016822	CG	3	6	33383	33388	0 %	0 %	50 %	50 %	383176619
51	NC_016822	CT	3	6	36328	36333	0 %	50 %	0 %	50 %	383176623
52	NC_016822	CG	3	6	36478	36483	0 %	0 %	50 %	50 %	383176623
53	NC_016822	GC	3	6	37291	37296	0 %	0 %	50 %	50 %	383176624
54	NC_016822	GC	3	6	37495	37500	0 %	0 %	50 %	50 %	383176624
55	NC_016822	CG	3	6	37631	37636	0 %	0 %	50 %	50 %	383176624
56	NC_016822	CA	3	6	37648	37653	50 %	0 %	0 %	50 %	383176624
57	NC_016822	TC	3	6	37793	37798	0 %	50 %	0 %	50 %	383176624
58	NC_016822	GC	5	10	39153	39162	0 %	0 %	50 %	50 %	383176624
59	NC_016822	CG	3	6	40263	40268	0 %	0 %	50 %	50 %	383176624
60	NC_016822	AT	3	6	41376	41381	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016822	TG	3	6	41463	41468	0 %	50 %	50 %	0 %	383176627
62	NC_016822	AG	3	6	41543	41548	50 %	0 %	50 %	0 %	383176627
63	NC_016822	CG	3	6	41722	41727	0 %	0 %	50 %	50 %	383176627
64	NC_016822	CT	3	6	42319	42324	0 %	50 %	0 %	50 %	383176628
65	NC_016822	CA	3	6	42387	42392	50 %	0 %	0 %	50 %	383176628
66	NC_016822	TC	3	6	43276	43281	0 %	50 %	0 %	50 %	383176629
67	NC_016822	CG	3	6	46550	46555	0 %	0 %	50 %	50 %	383176633
68	NC_016822	GC	3	6	46889	46894	0 %	0 %	50 %	50 %	383176633
69	NC_016822	CG	3	6	47161	47166	0 %	0 %	50 %	50 %	383176633
70	NC_016822	TG	3	6	47364	47369	0 %	50 %	50 %	0 %	383176633
71	NC_016822	GC	4	8	48039	48046	0 %	0 %	50 %	50 %	383176634
72	NC_016822	CG	3	6	49921	49926	0 %	0 %	50 %	50 %	383176635
73	NC_016822	GC	3	6	51023	51028	0 %	0 %	50 %	50 %	383176636
74	NC_016822	GC	3	6	51830	51835	0 %	0 %	50 %	50 %	383176637
75	NC_016822	CG	3	6	52999	53004	0 %	0 %	50 %	50 %	383176638
76	NC_016822	TC	3	6	54439	54444	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_016822	AT	3	6	54482	54487	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016822	CT	3	6	54632	54637	0 %	50 %	0 %	50 %	383176641
79	NC_016822	CT	3	6	55601	55606	0 %	50 %	0 %	50 %	383176642
80	NC_016822	CG	3	6	56758	56763	0 %	0 %	50 %	50 %	383176642
81	NC_016822	GA	3	6	56992	56997	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016822	TA	3	6	57789	57794	50 %	50 %	0 %	0 %	383176644
83	NC_016822	CG	4	8	58099	58106	0 %	0 %	50 %	50 %	383176644
84	NC_016822	CG	4	8	58387	58394	0 %	0 %	50 %	50 %	383176644
85	NC_016822	AC	3	6	58871	58876	50 %	0 %	0 %	50 %	383176645
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89	NC_016822	GC	4	8	62861	62868	0 %	0 %	50 %	50 %	383176649
90	NC_016822	GT	3	6	64631	64636	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016822	AT	3	6	64648	64653	50 %	50 %	0 %	0 %	383176650
92	NC_016822	GC	3	6	66385	66390	0 %	0 %	50 %	50 %	383176652
93	NC_016822	CG	3	6	67691	67696	0 %	0 %	50 %	50 %	383176652
94	NC_016822	AG	3	6	68571	68576	50 %	0 %	50 %	0 %	383176652
95	NC_016822	CG	3	6	68645	68650	0 %	0 %	50 %	50 %	383176652
96	NC_016822	CG	4	8	68764	68771	0 %	0 %	50 %	50 %	383176652
97	NC_016822	GC	3	6	72773	72778	0 %	0 %	50 %	50 %	383176655
98	NC_016822	TG	3	6	73387	73392	0 %	50 %	50 %	0 %	383176655
99	NC_016822	CG	3	6	73702	73707	0 %	0 %	50 %	50 %	383176655
100	NC_016822	CG	3	6	74441	74446	0 %	0 %	50 %	50 %	383176656
101	NC_016822	GC	3	6	75596	75601	0 %	0 %	50 %	50 %	383176656
102	NC_016822	AG	3	6	75869	75874	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016822	GA	3	6	76396	76401	50 %	0 %	50 %	0 %	383176657
104	NC_016822	CG	3	6	76465	76470	0 %	0 %	50 %	50 %	383176657
105	NC_016822	CG	3	6	78080	78085	0 %	0 %	50 %	50 %	383176659
106	NC_016822	GC	3	6	78888	78893	0 %	0 %	50 %	50 %	383176660
107	NC_016822	AG	3	6	80048	80053	50 %	0 %	50 %	0 %	383176660
108	NC_016822	GA	3	6	80061	80066	50 %	0 %	50 %	0 %	383176660
109	NC_016822	TC	3	6	81694	81699	0 %	50 %	0 %	50 %	383176662
110	NC_016822	CG	3	6	82276	82281	0 %	0 %	50 %	50 %	383176662
111	NC_016822	GC	3	6	83490	83495	0 %	0 %	50 %	50 %	383176664
112	NC_016822	TC	3	6	85494	85499	0 %	50 %	0 %	50 %	383176667
113	NC_016822	GC	3	6	85842	85847	0 %	0 %	50 %	50 %	383176667
114	NC_016822	TG	3	6	85939	85944	0 %	50 %	50 %	0 %	383176667
115	NC_016822	CG	3	6	86306	86311	0 %	0 %	50 %	50 %	383176668
116	NC_016822	CG	3	6	86426	86431	0 %	0 %	50 %	50 %	383176668
117	NC_016822	GC	3	6	87137	87142	0 %	0 %	50 %	50 %	383176668
118	NC_016822	GC	3	6	87240	87245	0 %	0 %	50 %	50 %	383176668
119	NC_016822	AT	3	6	87297	87302	50 %	50 %	0 %	0 %	383176668
120	NC_016822	GC	3	6	88188	88193	0 %	0 %	50 %	50 %	383176669
121	NC_016822	AT	3	6	90581	90586	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016822	TC	3	6	91743	91748	0 %	50 %	0 %	50 %	383176672
123	NC_016822	TG	3	6	91901	91906	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_016822	CT	3	6	91909	91914	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_016822	GC	4	8	92325	92332	0 %	0 %	50 %	50 %	383176673
126	NC_016822	GC	3	6	92732	92737	0 %	0 %	50 %	50 %	383176673
127	NC_016822	GC	3	6	93212	93217	0 %	0 %	50 %	50 %	383176673
128	NC_016822	GA	3	6	93855	93860	50 %	0 %	50 %	0 %	383176673
129	NC_016822	GC	3	6	94104	94109	0 %	0 %	50 %	50 %	383176674
130	NC_016822	CG	3	6	94335	94340	0 %	0 %	50 %	50 %	383176674
131	NC_016822	GC	3	6	95096	95101	0 %	0 %	50 %	50 %	383176675
132	NC_016822	CG	3	6	95165	95170	0 %	0 %	50 %	50 %	383176675
133	NC_016822	CA	3	6	96595	96600	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_016822	AG	3	6	98306	98311	50 %	0 %	50 %	0 %	383176679
135	NC_016822	AG	3	6	99931	99936	50 %	0 %	50 %	0 %	383176681
136	NC_016822	GA	3	6	100522	100527	50 %	0 %	50 %	0 %	383176682
137	NC_016822	AT	3	6	100604	100609	50 %	50 %	0 %	0 %	383176682
138	NC_016822	CG	3	6	101459	101464	0 %	0 %	50 %	50 %	383176682
139	NC_016822	GC	3	6	101574	101579	0 %	0 %	50 %	50 %	383176682
140	NC_016822	GC	3	6	102242	102247	0 %	0 %	50 %	50 %	383176683
141	NC_016822	CG	3	6	104303	104308	0 %	0 %	50 %	50 %	383176684
142	NC_016822	CG	3	6	105238	105243	0 %	0 %	50 %	50 %	383176685
143	NC_016822	GC	3	6	105450	105455	0 %	0 %	50 %	50 %	383176685
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