MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides J18 plasmid pKLE03

Total Repeats: 72

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016821	ATGT	2	8	262	269	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016821	CTGG	2	8	549	556	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3	NC_016821	CTGG	2	8	639	646	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_016821	AGCT	2	8	754	761	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_016821	CGTT	2	8	1255	1262	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_016821	CAAG	2	8	1562	1569	50 %	0 %	25 %	25 %	381335624
7	NC_016821	GTCA	2	8	1591	1598	25 %	25 %	25 %	25 %	381335624
8	NC_016821	ATTA	2	8	2276	2283	50 %	50 %	0 %	0 %	381335625
9	NC_016821	TTCA	2	8	2284	2291	25 %	50 %	0 %	25 %	381335625
10	NC_016821	TTCA	2	8	2407	2414	25 %	50 %	0 %	25 %	381335625
11	NC_016821	TTGG	2	8	2479	2486	0 %	50 %	50 %	0 %	381335625
12	NC_016821	AACT	2	8	3887	3894	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_016821	GATT	2	8	4427	4434	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016821	TTTA	2	8	4572	4579	25 %	75 %	0 %	0 %	381335628
15	NC_016821	AATA	2	8	4948	4955	75 %	25 %	0 %	0 %	381335629
16	NC_016821	GAAC	2	8	5338	5345	50 %	0 %	25 %	25 %	381335630
17	NC_016821	TACA	2	8	5463	5470	50 %	25 %	0 %	25 %	381335630
18	NC_016821	CTTA	2	8	5670	5677	25 %	50 %	0 %	25 %	381335631
19	NC_016821	TGTT	2	8	5796	5803	0 %	75 %	25 %	0 %	381335631
20	NC_016821	CAAG	2	8	5927	5934	50 %	0 %	25 %	25 %	381335631
21	NC_016821	TATT	2	8	6128	6135	25 %	75 %	0 %	0 %	381335632
22	NC_016821	GTAT	2	8	6350	6357	25 %	50 %	25 %	0 %	381335632
23	NC_016821	GATT	2	8	6965	6972	25 %	50 %	25 %	0 %	381335633
24	NC_016821	TTTC	2	8	7244	7251	0 %	75 %	0 %	25 %	381335633
25	NC_016821	CAAA	2	8	8546	8553	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_016821	TATT	2	8	9672	9679	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016821	TGTT	2	8	9718	9725	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016821	TTAA	2	8	9750	9757	50 %	50 %	0 %	0 %	381335636
29	NC_016821	AATG	2	8	9877	9884	50 %	25 %	25 %	0 %	381335636
30	NC_016821	ATAA	2	8	9998	10005	75 %	25 %	0 %	0 %	381335636
31	NC_016821	TTTA	2	8	10475	10482	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016821	CTTC	2	8	10548	10555	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_016821	ATTG	2	8	10736	10743	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016821	AACA	2	8	10851	10858	75 %	0 %	0 %	25 %	381335637
35	NC_016821	TCTT	2	8	12149	12156	0 %	75 %	0 %	25 %	381335638
36	NC_016821	GCTG	2	8	13535	13542	0 %	25 %	50 %	25 %	381335640
37	NC_016821	AGTG	2	8	13642	13649	25 %	25 %	50 %	0 %	381335640
38	NC_016821	AATT	2	8	14158	14165	50 %	50 %	0 %	0 %	381335641
39	NC_016821	GCTT	2	8	14186	14193	0 %	50 %	25 %	25 %	381335641
40	NC_016821	GCCT	2	8	14650	14657	0 %	25 %	25 %	50 %	381335641
41	NC_016821	TTTA	2	8	14755	14762	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016821	GGCT	2	8	15638	15645	0 %	25 %	50 %	25 %	381335642
43	NC_016821	ACCA	2	8	16559	16566	50 %	0 %	0 %	50 %	381335643
44	NC_016821	TAAT	2	8	16738	16745	50 %	50 %	0 %	0 %	381335643
45	NC_016821	ATGC	2	8	17269	17276	25 %	25 %	25 %	25 %	381335643
46	NC_016821	GCAA	2	8	17279	17286	50 %	0 %	25 %	25 %	381335643
47	NC_016821	AAAG	2	8	17345	17352	75 %	0 %	25 %	0 %	381335643
48	NC_016821	TTCA	2	8	17594	17601	25 %	50 %	0 %	25 %	381335643
49	NC_016821	CATT	2	8	17791	17798	25 %	50 %	0 %	25 %	381335643
50	NC_016821	CGAA	2	8	17845	17852	50 %	0 %	25 %	25 %	381335643
51	NC_016821	CAAA	2	8	18034	18041	75 %	0 %	0 %	25 %	381335643
52	NC_016821	CAAA	2	8	18868	18875	75 %	0 %	0 %	25 %	381335644
53	NC_016821	CCAT	2	8	19087	19094	25 %	25 %	0 %	50 %	381335644
54	NC_016821	ATAA	2	8	19739	19746	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016821	AATT	2	8	19907	19914	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016821	TTTG	2	8	19979	19986	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016821	AAAC	2	8	20174	20181	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_016821	TCAC	2	8	20363	20370	25 %	25 %	0 %	50 %	381335647
59	NC_016821	ATTG	2	8	20603	20610	25 %	50 %	25 %	0 %	381335647
60	NC_016821	GTAC	2	8	21607	21614	25 %	25 %	25 %	25 %	381335648
61	NC_016821	CCAT	2	8	21889	21896	25 %	25 %	0 %	50 %	381335648
62	NC_016821	AGCT	2	8	22085	22092	25 %	25 %	25 %	25 %	381335648
63	NC_016821	CACC	2	8	22112	22119	25 %	0 %	0 %	75 %	381335648
64	NC_016821	GACA	2	8	22226	22233	50 %	0 %	25 %	25 %	381335649
65	NC_016821	AATC	2	8	22540	22547	50 %	25 %	0 %	25 %	381335649
66	NC_016821	AATG	2	8	22624	22631	50 %	25 %	25 %	0 %	381335649
67	NC_016821	TTGG	2	8	22943	22950	0 %	50 %	50 %	0 %	381335649
68	NC_016821	GCTG	2	8	23448	23455	0 %	25 %	50 %	25 %	381335650
69	NC_016821	GATT	2	8	23475	23482	25 %	50 %	25 %	0 %	381335650
70	NC_016821	TAAA	2	8	23733	23740	75 %	25 %	0 %	0 %	381335650
71	NC_016821	AATA	2	8	24324	24331	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016821	CACT	2	8	24357	24364	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.