MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides J18 plasmid pKLE03

Total Repeats: 208

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016821	AAG	2	6	1492	1497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	381335624
2	NC_016821	GGA	2	6	1646	1651	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	381335624
3	NC_016821	TGC	2	6	1928	1933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	381335625
4	NC_016821	CAA	2	6	1941	1946	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	381335625
5	NC_016821	AGC	2	6	2471	2476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	381335625
6	NC_016821	CAG	3	9	2617	2625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	381335626
7	NC_016821	TAT	2	6	2747	2752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	381335626
8	NC_016821	CGT	2	6	3253	3258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	381335627
9	NC_016821	ATT	2	6	4603	4608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	381335628
10	NC_016821	TTA	2	6	4670	4675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	381335628
11	NC_016821	TGA	2	6	4714	4719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	381335629
12	NC_016821	TGA	2	6	4801	4806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	381335629
13	NC_016821	TAA	2	6	4809	4814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	381335629
14	NC_016821	ATA	2	6	4866	4871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	381335629
15	NC_016821	TTA	2	6	4882	4887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	381335629
16	NC_016821	TAA	2	6	4942	4947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	381335629
17	NC_016821	AAG	2	6	5091	5096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	381335630
18	NC_016821	ATT	2	6	5300	5305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	381335630
19	NC_016821	ACA	2	6	5371	5376	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	381335630
20	NC_016821	GAA	2	6	5519	5524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	381335630
21	NC_016821	TGG	2	6	5563	5568	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	381335630
22	NC_016821	TCA	3	9	5734	5742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	381335631
23	NC_016821	TAA	2	6	5752	5757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	381335631
24	NC_016821	TAT	2	6	5777	5782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	381335631
25	NC_016821	CTA	2	6	5838	5843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	381335631
26	NC_016821	TAC	2	6	5863	5868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	381335631
27	NC_016821	ATG	2	6	6122	6127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	381335632
28	NC_016821	TGA	2	6	6147	6152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	381335632
29	NC_016821	ATT	2	6	6160	6165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	381335632
30	NC_016821	GAT	2	6	6226	6231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	381335632
31	NC_016821	GAT	2	6	6319	6324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	381335632
32	NC_016821	GTC	2	6	7045	7050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	381335633
33	NC_016821	ATG	2	6	7329	7334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	381335633
34	NC_016821	TTC	2	6	7351	7356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	381335633
35	NC_016821	GTC	2	6	7389	7394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	381335633
36	NC_016821	ATC	2	6	7446	7451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	381335633
37	NC_016821	TTC	2	6	7530	7535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	381335633
38	NC_016821	TAT	2	6	7619	7624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	381335633
39	NC_016821	GCA	2	6	7649	7654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	381335633
40	NC_016821	CTT	2	6	7715	7720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	381335633
41	NC_016821	ATC	2	6	7749	7754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	381335633
42	NC_016821	TGG	2	6	7859	7864	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	381335633
43	NC_016821	TTC	2	6	7911	7916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	381335633
44	NC_016821	ATC	2	6	8597	8602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	381335634
45	NC_016821	AAT	2	6	8605	8610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	381335634
46	NC_016821	GAA	2	6	8672	8677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	381335634
47	NC_016821	TGA	2	6	9457	9462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	381335635
48	NC_016821	GAA	2	6	9482	9487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	381335635
49	NC_016821	TGG	2	6	9504	9509	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	381335635
50	NC_016821	TTG	2	6	10071	10076	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	381335636
51	NC_016821	ATC	2	6	10122	10127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	381335636
52	NC_016821	ATA	2	6	10159	10164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	381335636
53	NC_016821	TTA	2	6	10213	10218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	381335636
54	NC_016821	AAT	2	6	10225	10230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	381335636
55	NC_016821	TTA	2	6	10231	10236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	381335636
56	NC_016821	CAG	2	6	11006	11011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	381335637
57	NC_016821	ACC	2	6	11019	11024	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	381335637
58	NC_016821	TGG	2	6	11205	11210	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	381335637
59	NC_016821	GTT	2	6	11242	11247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	381335637
60	NC_016821	GCT	2	6	11281	11286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	381335637
61	NC_016821	ATG	2	6	11534	11539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	381335637
62	NC_016821	TTG	3	9	11540	11548	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	381335637
63	NC_016821	AAG	2	6	11573	11578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	381335637
64	NC_016821	GTG	2	6	11600	11605	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	381335637
65	NC_016821	TTG	2	6	11737	11742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	381335637
66	NC_016821	TCA	2	6	11743	11748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	381335637
67	NC_016821	TGC	2	6	11973	11978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	381335638
68	NC_016821	TGT	2	6	11994	11999	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	381335638
69	NC_016821	CTG	2	6	12047	12052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	381335638
70	NC_016821	TAA	2	6	12066	12071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	381335638
71	NC_016821	CAG	2	6	12090	12095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	381335638
72	NC_016821	GTT	2	6	12130	12135	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	381335638
73	NC_016821	CAG	2	6	12374	12379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	381335638
74	NC_016821	CCA	2	6	12454	12459	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	381335638
75	NC_016821	TAT	2	6	12471	12476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	381335638
76	NC_016821	ATC	2	6	12481	12486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	381335638
77	NC_016821	CTT	2	6	12531	12536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	381335638
78	NC_016821	GGT	2	6	12544	12549	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	381335638
79	NC_016821	ATT	3	9	12666	12674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	381335639
80	NC_016821	CAG	2	6	12717	12722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	381335639
81	NC_016821	TGA	2	6	12826	12831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	381335639
82	NC_016821	ACA	2	6	12875	12880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	381335639
83	NC_016821	TGC	2	6	12889	12894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	381335639
84	NC_016821	TGC	2	6	12898	12903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	381335639
85	NC_016821	CGA	2	6	12931	12936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	381335639
86	NC_016821	ACA	2	6	12943	12948	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	381335639
87	NC_016821	TTG	2	6	13008	13013	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	381335639
88	NC_016821	ATT	2	6	13213	13218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	381335640
89	NC_016821	TGT	2	6	13249	13254	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	381335640
90	NC_016821	ATA	2	6	13359	13364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	381335640
91	NC_016821	TGC	2	6	13381	13386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	381335640
92	NC_016821	ATT	2	6	13403	13408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	381335640
93	NC_016821	TAT	2	6	13508	13513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	381335640
94	NC_016821	ATG	2	6	13728	13733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	381335640
95	NC_016821	TGA	2	6	13807	13812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	381335640
96	NC_016821	GTT	2	6	14043	14048	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	381335640
97	NC_016821	ATT	2	6	14065	14070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	381335640
98	NC_016821	TTG	2	6	14441	14446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	381335641
99	NC_016821	GTA	2	6	14608	14613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	381335641
100	NC_016821	TTG	2	6	14729	14734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	381335641
101	NC_016821	GTG	2	6	14931	14936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	381335642
102	NC_016821	ATT	2	6	14941	14946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	381335642
103	NC_016821	AAG	2	6	14955	14960	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	381335642
104	NC_016821	GCC	2	6	14961	14966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	381335642
105	NC_016821	CTA	2	6	15019	15024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	381335642
106	NC_016821	TGC	2	6	15034	15039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	381335642
107	NC_016821	TTG	2	6	15061	15066	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	381335642
108	NC_016821	CCT	2	6	15098	15103	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	381335642
109	NC_016821	TGC	2	6	15122	15127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	381335642
110	NC_016821	TAT	2	6	15137	15142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	381335642
111	NC_016821	ATT	2	6	15330	15335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	381335642
112	NC_016821	CAT	2	6	15410	15415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	381335642
113	NC_016821	AAC	2	6	15508	15513	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	381335642
114	NC_016821	AAC	2	6	15519	15524	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	381335642
115	NC_016821	CTG	2	6	15580	15585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	381335642
116	NC_016821	CGG	2	6	15680	15685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	381335642
117	NC_016821	ATC	2	6	15735	15740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	381335642
118	NC_016821	CAT	2	6	15827	15832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	381335642
119	NC_016821	CAA	2	6	15882	15887	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	381335642
120	NC_016821	CAG	2	6	15895	15900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	381335642
121	NC_016821	TGC	2	6	16031	16036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	381335642
122	NC_016821	GGT	2	6	16046	16051	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	381335642
123	NC_016821	GCA	2	6	16287	16292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	381335643
124	NC_016821	ACA	2	6	16327	16332	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	381335643
125	NC_016821	CCA	2	6	16376	16381	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	381335643
126	NC_016821	TGA	2	6	16567	16572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	381335643
127	NC_016821	AAT	2	6	16601	16606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	381335643
128	NC_016821	ATC	2	6	16616	16621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	381335643
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.