MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides J18 plasmid pKLE02

Total Repeats: 35

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016820	ACTGA	2	10	447	456	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_016820	TTAAT	2	10	506	515	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016820	AAAGT	2	10	753	762	60 %	20 %	20 %	0 %	379703845
4	NC_016820	ACTGA	2	10	2010	2019	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_016820	TAATT	2	10	3327	3336	40 %	60 %	0 %	0 %	379703849
6	NC_016820	TTCAA	2	10	3519	3528	40 %	40 %	0 %	20 %	379703849
7	NC_016820	TAATT	2	10	3999	4008	40 %	60 %	0 %	0 %	379703849
8	NC_016820	GAAAA	2	10	4407	4416	80 %	0 %	20 %	0 %	379703849
9	NC_016820	AATTA	2	10	4723	4732	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016820	ATTTG	2	10	5103	5112	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016820	TTAAT	2	10	5139	5148	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016820	TGGTT	2	10	5294	5303	0 %	60 %	40 %	0 %	379703850
13	NC_016820	ATATA	2	10	5548	5557	60 %	40 %	0 %	0 %	379703850
14	NC_016820	GTGTT	2	10	5577	5586	0 %	60 %	40 %	0 %	379703850
15	NC_016820	GATAA	2	10	5915	5924	60 %	20 %	20 %	0 %	379703850
16	NC_016820	ATTTT	2	10	7644	7653	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016820	TGGAA	2	10	8001	8010	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016820	TAAAA	2	10	8833	8842	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016820	TTATA	2	10	10584	10593	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016820	TGTTT	2	10	11028	11037	0 %	80 %	20 %	0 %	379703858
21	NC_016820	TTCTT	2	10	11689	11698	0 %	80 %	0 %	20 %	379703859
22	NC_016820	TTATA	2	10	12445	12454	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016820	GAATT	2	10	13755	13764	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016820	ACTAC	2	10	15948	15957	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
25	NC_016820	TGTTT	2	10	15969	15978	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016820	GAGAA	2	10	17312	17321	60 %	0 %	40 %	0 %	379703864
27	NC_016820	GCACC	2	10	17952	17961	20 %	0 %	20 %	60 %	379703865
28	NC_016820	ATCTA	2	10	21448	21457	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_016820	TAAAA	2	10	22138	22147	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016820	CAATA	2	10	22790	22799	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_016820	TATTT	2	10	23566	23575	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016820	TACAT	2	10	24968	24977	40 %	40 %	0 %	20 %	379703872
33	NC_016820	TGCAT	2	10	25025	25034	20 %	40 %	20 %	20 %	379703872
34	NC_016820	CCAAG	2	10	29578	29587	40 %	0 %	20 %	40 %	379703878
35	NC_016820	TAGTT	2	10	33208	33217	20 %	60 %	20 %	0 %	379703885

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.