MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides J18 plasmid pKLE02

Total Repeats: 116

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016820	TGAC	2	8	141	148	25 %	25 %	25 %	25 %	379703844
2	NC_016820	GTTG	2	8	396	403	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016820	TAAT	2	8	517	524	50 %	50 %	0 %	0 %	379703845
4	NC_016820	GCAA	2	8	1242	1249	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_016820	TTTA	2	8	1643	1650	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016820	TTTG	2	8	1967	1974	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016820	ATTA	2	8	2536	2543	50 %	50 %	0 %	0 %	379703847
8	NC_016820	ATAC	2	8	3013	3020	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_016820	AATC	2	8	3580	3587	50 %	25 %	0 %	25 %	379703849
10	NC_016820	TTTG	2	8	3753	3760	0 %	75 %	25 %	0 %	379703849
11	NC_016820	TAAA	2	8	4663	4670	75 %	25 %	0 %	0 %	379703849
12	NC_016820	TGAG	2	8	4845	4852	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016820	TTTG	2	8	5698	5705	0 %	75 %	25 %	0 %	379703850
14	NC_016820	TTCT	2	8	5851	5858	0 %	75 %	0 %	25 %	379703850
15	NC_016820	GGCA	2	8	6031	6038	25 %	0 %	50 %	25 %	379703850
16	NC_016820	GCGT	2	8	7243	7250	0 %	25 %	50 %	25 %	379703852
17	NC_016820	ATAC	2	8	7437	7444	50 %	25 %	0 %	25 %	379703852
18	NC_016820	GCCA	2	8	7489	7496	25 %	0 %	25 %	50 %	379703852
19	NC_016820	ATTT	2	8	7600	7607	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016820	CATT	2	8	7880	7887	25 %	50 %	0 %	25 %	379703853
21	NC_016820	TATT	3	12	8034	8045	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016820	CTAT	2	8	8192	8199	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_016820	TTTG	2	8	8306	8313	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016820	ATCT	2	8	8729	8736	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_016820	GTCA	2	8	9012	9019	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_016820	CAAA	2	8	9672	9679	75 %	0 %	0 %	25 %	379703855
27	NC_016820	AATT	2	8	9797	9804	50 %	50 %	0 %	0 %	379703855
28	NC_016820	CAAA	2	8	9925	9932	75 %	0 %	0 %	25 %	379703855
29	NC_016820	ATTA	2	8	9990	9997	50 %	50 %	0 %	0 %	379703855
30	NC_016820	TAAA	2	8	10209	10216	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016820	TAAA	2	8	10225	10232	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016820	TAAT	2	8	11207	11214	50 %	50 %	0 %	0 %	379703858
33	NC_016820	AATA	2	8	11254	11261	75 %	25 %	0 %	0 %	379703859
34	NC_016820	GTTT	2	8	11710	11717	0 %	75 %	25 %	0 %	379703859
35	NC_016820	TTTA	2	8	12192	12199	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016820	AAAT	2	8	12362	12369	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016820	TACA	2	8	12414	12421	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_016820	ACAA	2	8	12657	12664	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_016820	TAAT	2	8	12826	12833	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016820	GACG	2	8	12878	12885	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
41	NC_016820	GTTT	2	8	12905	12912	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016820	TCAA	2	8	12979	12986	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_016820	CTTG	2	8	12997	13004	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_016820	GTCG	2	8	13990	13997	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
45	NC_016820	TCAT	2	8	14238	14245	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_016820	AGTA	2	8	14266	14273	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016820	TCCA	2	8	14758	14765	25 %	25 %	0 %	50 %	379703861
48	NC_016820	TAAT	2	8	15288	15295	50 %	50 %	0 %	0 %	379703861
49	NC_016820	ATCA	2	8	15871	15878	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_016820	TAAA	2	8	16326	16333	75 %	25 %	0 %	0 %	379703862
51	NC_016820	CACG	2	8	16488	16495	25 %	0 %	25 %	50 %	379703862
52	NC_016820	GTCA	2	8	16725	16732	25 %	25 %	25 %	25 %	379703863
53	NC_016820	TTCA	2	8	17541	17548	25 %	50 %	0 %	25 %	379703864
54	NC_016820	TTGG	2	8	17613	17620	0 %	50 %	50 %	0 %	379703864
55	NC_016820	AATG	2	8	18428	18435	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016820	ATTG	2	8	18497	18504	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016820	TAAA	2	8	18601	18608	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016820	AGTT	2	8	19163	19170	25 %	50 %	25 %	0 %	379703866
59	NC_016820	GAAA	2	8	19410	19417	75 %	0 %	25 %	0 %	379703866
60	NC_016820	GAAC	2	8	19480	19487	50 %	0 %	25 %	25 %	379703866
61	NC_016820	AGGC	2	8	19745	19752	25 %	0 %	50 %	25 %	379703866
62	NC_016820	TTTG	2	8	20001	20008	0 %	75 %	25 %	0 %	379703866
63	NC_016820	AAGT	2	8	20126	20133	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016820	ATCT	2	8	20289	20296	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_016820	TACT	2	8	20322	20329	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_016820	TAAT	2	8	20966	20973	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016820	ATAG	2	8	21156	21163	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016820	GTTT	2	8	21364	21371	0 %	75 %	25 %	0 %	379703868
69	NC_016820	TTTG	2	8	21788	21795	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016820	AACA	2	8	21866	21873	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_016820	GTTT	2	8	22231	22238	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016820	GGCT	2	8	22507	22514	0 %	25 %	50 %	25 %	379703870
73	NC_016820	AAAG	2	8	23230	23237	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_016820	TAAA	2	8	23763	23770	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016820	AGAA	2	8	23935	23942	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016820	CAAG	2	8	24163	24170	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_016820	AGGT	2	8	24258	24265	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016820	ATTT	2	8	24588	24595	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016820	GATA	2	8	24604	24611	50 %	25 %	25 %	0 %	379703871
80	NC_016820	AAAC	2	8	24683	24690	75 %	0 %	0 %	25 %	379703871
81	NC_016820	AAGG	2	8	24833	24840	50 %	0 %	50 %	0 %	379703871
82	NC_016820	ATTA	2	8	25396	25403	50 %	50 %	0 %	0 %	379703872
83	NC_016820	AAAC	2	8	25849	25856	75 %	0 %	0 %	25 %	379703873
84	NC_016820	CAAT	2	8	26398	26405	50 %	25 %	0 %	25 %	379703874
85	NC_016820	CTGG	2	8	26590	26597	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
86	NC_016820	TCGG	2	8	26930	26937	0 %	25 %	50 %	25 %	379703875
87	NC_016820	CAAT	2	8	27043	27050	50 %	25 %	0 %	25 %	379703875
88	NC_016820	CATT	2	8	27084	27091	25 %	50 %	0 %	25 %	379703875
89	NC_016820	ACAA	2	8	27807	27814	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_016820	AAAC	2	8	27919	27926	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_016820	CTTG	2	8	28188	28195	0 %	50 %	25 %	25 %	379703877
92	NC_016820	TAAG	2	8	28209	28216	50 %	25 %	25 %	0 %	379703877
93	NC_016820	TCAC	2	8	28599	28606	25 %	25 %	0 %	50 %	379703877
94	NC_016820	AATG	2	8	28795	28802	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016820	GACT	2	8	29086	29093	25 %	25 %	25 %	25 %	379703878
96	NC_016820	TGGT	2	8	29119	29126	0 %	50 %	50 %	0 %	379703878
97	NC_016820	CACG	2	8	29149	29156	25 %	0 %	25 %	50 %	379703878
98	NC_016820	AGCC	2	8	29252	29259	25 %	0 %	25 %	50 %	379703878
99	NC_016820	GTTC	2	8	29939	29946	0 %	50 %	25 %	25 %	379703879
100	NC_016820	GATC	2	8	30531	30538	25 %	25 %	25 %	25 %	379703880
101	NC_016820	TACT	2	8	30735	30742	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_016820	AACT	2	8	30947	30954	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_016820	AACT	2	8	31008	31015	50 %	25 %	0 %	25 %	379703881
104	NC_016820	AATT	2	8	31544	31551	50 %	50 %	0 %	0 %	379703882
105	NC_016820	TAAT	2	8	31601	31608	50 %	50 %	0 %	0 %	379703882
106	NC_016820	AATC	2	8	31759	31766	50 %	25 %	0 %	25 %	379703882
107	NC_016820	AATT	2	8	32391	32398	50 %	50 %	0 %	0 %	379703883
108	NC_016820	TTTG	2	8	32587	32594	0 %	75 %	25 %	0 %	379703883
109	NC_016820	ATAA	2	8	32752	32759	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016820	AATG	2	8	33063	33070	50 %	25 %	25 %	0 %	379703884
111	NC_016820	TGAC	2	8	33123	33130	25 %	25 %	25 %	25 %	379703884
112	NC_016820	AGAA	2	8	33174	33181	75 %	0 %	25 %	0 %	379703885
113	NC_016820	CAAT	2	8	34367	34374	50 %	25 %	0 %	25 %	379703887
114	NC_016820	TAAA	2	8	34439	34446	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016820	ACCA	2	8	34675	34682	50 %	0 %	0 %	50 %	379703888
116	NC_016820	TGAA	2	8	34748	34755	50 %	25 %	25 %	0 %	379703888

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.