MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides J18 plasmid pKLE02

Total Repeats: 64

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016820	TGAC	2	8	141	148	25 %	25 %	25 %	25 %	379703844
2	NC_016820	TAAT	2	8	517	524	50 %	50 %	0 %	0 %	379703845
3	NC_016820	ATTA	2	8	2536	2543	50 %	50 %	0 %	0 %	379703847
4	NC_016820	AATC	2	8	3580	3587	50 %	25 %	0 %	25 %	379703849
5	NC_016820	TTTG	2	8	3753	3760	0 %	75 %	25 %	0 %	379703849
6	NC_016820	TAAA	2	8	4663	4670	75 %	25 %	0 %	0 %	379703849
7	NC_016820	TTTG	2	8	5698	5705	0 %	75 %	25 %	0 %	379703850
8	NC_016820	TTCT	2	8	5851	5858	0 %	75 %	0 %	25 %	379703850
9	NC_016820	GGCA	2	8	6031	6038	25 %	0 %	50 %	25 %	379703850
10	NC_016820	GCGT	2	8	7243	7250	0 %	25 %	50 %	25 %	379703852
11	NC_016820	ATAC	2	8	7437	7444	50 %	25 %	0 %	25 %	379703852
12	NC_016820	GCCA	2	8	7489	7496	25 %	0 %	25 %	50 %	379703852
13	NC_016820	CATT	2	8	7880	7887	25 %	50 %	0 %	25 %	379703853
14	NC_016820	CAAA	2	8	9672	9679	75 %	0 %	0 %	25 %	379703855
15	NC_016820	AATT	2	8	9797	9804	50 %	50 %	0 %	0 %	379703855
16	NC_016820	CAAA	2	8	9925	9932	75 %	0 %	0 %	25 %	379703855
17	NC_016820	ATTA	2	8	9990	9997	50 %	50 %	0 %	0 %	379703855
18	NC_016820	TAAT	2	8	11207	11214	50 %	50 %	0 %	0 %	379703858
19	NC_016820	AATA	2	8	11254	11261	75 %	25 %	0 %	0 %	379703859
20	NC_016820	GTTT	2	8	11710	11717	0 %	75 %	25 %	0 %	379703859
21	NC_016820	TCCA	2	8	14758	14765	25 %	25 %	0 %	50 %	379703861
22	NC_016820	TAAT	2	8	15288	15295	50 %	50 %	0 %	0 %	379703861
23	NC_016820	TAAA	2	8	16326	16333	75 %	25 %	0 %	0 %	379703862
24	NC_016820	CACG	2	8	16488	16495	25 %	0 %	25 %	50 %	379703862
25	NC_016820	GTCA	2	8	16725	16732	25 %	25 %	25 %	25 %	379703863
26	NC_016820	TTCA	2	8	17541	17548	25 %	50 %	0 %	25 %	379703864
27	NC_016820	TTGG	2	8	17613	17620	0 %	50 %	50 %	0 %	379703864
28	NC_016820	AGTT	2	8	19163	19170	25 %	50 %	25 %	0 %	379703866
29	NC_016820	GAAA	2	8	19410	19417	75 %	0 %	25 %	0 %	379703866
30	NC_016820	GAAC	2	8	19480	19487	50 %	0 %	25 %	25 %	379703866
31	NC_016820	AGGC	2	8	19745	19752	25 %	0 %	50 %	25 %	379703866
32	NC_016820	TTTG	2	8	20001	20008	0 %	75 %	25 %	0 %	379703866
33	NC_016820	GTTT	2	8	21364	21371	0 %	75 %	25 %	0 %	379703868
34	NC_016820	GGCT	2	8	22507	22514	0 %	25 %	50 %	25 %	379703870
35	NC_016820	GATA	2	8	24604	24611	50 %	25 %	25 %	0 %	379703871
36	NC_016820	AAAC	2	8	24683	24690	75 %	0 %	0 %	25 %	379703871
37	NC_016820	AAGG	2	8	24833	24840	50 %	0 %	50 %	0 %	379703871
38	NC_016820	ATTA	2	8	25396	25403	50 %	50 %	0 %	0 %	379703872
39	NC_016820	AAAC	2	8	25849	25856	75 %	0 %	0 %	25 %	379703873
40	NC_016820	CAAT	2	8	26398	26405	50 %	25 %	0 %	25 %	379703874
41	NC_016820	TCGG	2	8	26930	26937	0 %	25 %	50 %	25 %	379703875
42	NC_016820	CAAT	2	8	27043	27050	50 %	25 %	0 %	25 %	379703875
43	NC_016820	CATT	2	8	27084	27091	25 %	50 %	0 %	25 %	379703875
44	NC_016820	CTTG	2	8	28188	28195	0 %	50 %	25 %	25 %	379703877
45	NC_016820	TAAG	2	8	28209	28216	50 %	25 %	25 %	0 %	379703877
46	NC_016820	TCAC	2	8	28599	28606	25 %	25 %	0 %	50 %	379703877
47	NC_016820	GACT	2	8	29086	29093	25 %	25 %	25 %	25 %	379703878
48	NC_016820	TGGT	2	8	29119	29126	0 %	50 %	50 %	0 %	379703878
49	NC_016820	CACG	2	8	29149	29156	25 %	0 %	25 %	50 %	379703878
50	NC_016820	AGCC	2	8	29252	29259	25 %	0 %	25 %	50 %	379703878
51	NC_016820	GTTC	2	8	29939	29946	0 %	50 %	25 %	25 %	379703879
52	NC_016820	GATC	2	8	30531	30538	25 %	25 %	25 %	25 %	379703880
53	NC_016820	AACT	2	8	31008	31015	50 %	25 %	0 %	25 %	379703881
54	NC_016820	AATT	2	8	31544	31551	50 %	50 %	0 %	0 %	379703882
55	NC_016820	TAAT	2	8	31601	31608	50 %	50 %	0 %	0 %	379703882
56	NC_016820	AATC	2	8	31759	31766	50 %	25 %	0 %	25 %	379703882
57	NC_016820	AATT	2	8	32391	32398	50 %	50 %	0 %	0 %	379703883
58	NC_016820	TTTG	2	8	32587	32594	0 %	75 %	25 %	0 %	379703883
59	NC_016820	AATG	2	8	33063	33070	50 %	25 %	25 %	0 %	379703884
60	NC_016820	TGAC	2	8	33123	33130	25 %	25 %	25 %	25 %	379703884
61	NC_016820	AGAA	2	8	33174	33181	75 %	0 %	25 %	0 %	379703885
62	NC_016820	CAAT	2	8	34367	34374	50 %	25 %	0 %	25 %	379703887
63	NC_016820	ACCA	2	8	34675	34682	50 %	0 %	0 %	50 %	379703888
64	NC_016820	TGAA	2	8	34748	34755	50 %	25 %	25 %	0 %	379703888

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.