MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides J18 plasmid pKLE02

Total Repeats: 186

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016820	TAA	2	6	408	413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016820	ACT	2	6	1160	1165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_016820	TAA	2	6	1182	1187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016820	TGG	2	6	1259	1264	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016820	TTG	2	6	1291	1296	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016820	GTT	2	6	1371	1376	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016820	AGT	2	6	1388	1393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016820	ACT	2	6	1397	1402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_016820	TTA	2	6	1493	1498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016820	AAC	2	6	1506	1511	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_016820	ATT	2	6	1610	1615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016820	GTA	2	6	2047	2052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016820	ATG	2	6	2090	2095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016820	ATT	2	6	2106	2111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016820	TGT	2	6	3116	3121	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016820	AAT	2	6	4743	4748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016820	AAT	2	6	4771	4776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016820	AAG	2	6	4910	4915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016820	ATG	2	6	4925	4930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016820	TAA	2	6	5016	5021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016820	ATA	2	6	5088	5093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016820	AAT	2	6	5113	5118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016820	TAA	2	6	6968	6973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016820	GTG	2	6	7706	7711	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016820	ATT	2	6	7723	7728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016820	ATT	2	6	7769	7774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016820	AAG	2	6	7825	7830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016820	TGG	2	6	7989	7994	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016820	TCA	2	6	8013	8018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_016820	ATT	3	9	8125	8133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016820	ATA	2	6	8138	8143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016820	GAA	2	6	8242	8247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016820	AAG	2	6	8258	8263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016820	TGA	2	6	8280	8285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016820	GAG	2	6	8349	8354	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016820	ATG	2	6	8357	8362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016820	ATA	2	6	8404	8409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016820	ACT	2	6	8454	8459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_016820	ACC	2	6	8525	8530	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_016820	GCT	2	6	8536	8541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_016820	CCT	2	6	8578	8583	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_016820	TGC	2	6	8613	8618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_016820	AAT	2	6	8699	8704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016820	GGA	2	6	9067	9072	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016820	TCA	2	6	9162	9167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_016820	CTA	2	6	9235	9240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_016820	CGT	2	6	9341	9346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_016820	AGC	2	6	9379	9384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_016820	TAT	2	6	9512	9517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016820	TTA	2	6	9553	9558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016820	GAA	2	6	9583	9588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016820	ATA	2	6	10257	10262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016820	TAA	3	9	10271	10279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016820	GTT	2	6	10283	10288	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016820	TGG	2	6	10289	10294	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016820	GGT	3	9	10307	10315	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016820	GTT	2	6	10501	10506	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016820	TTG	2	6	10510	10515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016820	GAC	2	6	10541	10546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_016820	TTG	2	6	10618	10623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016820	TAT	2	6	10645	10650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016820	ATT	2	6	10668	10673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016820	TAT	2	6	12122	12127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016820	TAT	2	6	12130	12135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016820	TAC	2	6	12143	12148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_016820	GTA	2	6	12160	12165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016820	TAC	2	6	12209	12214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_016820	TAC	2	6	12217	12222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_016820	TAC	2	6	12249	12254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_016820	TAC	2	6	12273	12278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_016820	GTT	2	6	12292	12297	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016820	ATT	2	6	12344	12349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016820	CCA	2	6	12387	12392	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_016820	TGT	2	6	12469	12474	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016820	ACT	2	6	12628	12633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_016820	GTA	2	6	12679	12684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016820	CAA	2	6	13008	13013	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_016820	ATA	3	9	13072	13080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016820	TGT	2	6	13099	13104	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016820	TGG	2	6	13138	13143	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016820	ATC	2	6	13178	13183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_016820	TGT	2	6	13193	13198	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016820	TCT	2	6	13239	13244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_016820	CAA	2	6	13248	13253	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_016820	TAT	2	6	13258	13263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016820	TTG	2	6	13595	13600	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016820	AAC	2	6	13682	13687	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_016820	ATC	2	6	13718	13723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_016820	TCT	2	6	13887	13892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_016820	TAA	2	6	13974	13979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016820	ATT	2	6	14020	14025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016820	TAA	2	6	14029	14034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016820	CTT	2	6	14076	14081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_016820	AAC	2	6	14087	14092	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_016820	TTC	2	6	14119	14124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_016820	ATT	2	6	14191	14196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016820	GAG	2	6	14229	14234	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016820	ACT	2	6	14275	14280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_016820	AAC	2	6	15917	15922	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_016820	CCT	2	6	17997	18002	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_016820	CTG	2	6	18133	18138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_016820	CGG	2	6	18186	18191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_016820	AAT	2	6	18478	18483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016820	TTG	2	6	18537	18542	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016820	AAT	2	6	18544	18549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016820	ATT	2	6	18581	18586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016820	ATT	2	6	18621	18626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016820	ATT	2	6	18662	18667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016820	GCT	2	6	20100	20105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_016820	TAT	2	6	20140	20145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016820	TCT	2	6	20177	20182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_016820	TAA	2	6	20432	20437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016820	ATA	2	6	20477	20482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_016820	TTA	2	6	20930	20935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016820	TGA	2	6	21024	21029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016820	AAT	2	6	21111	21116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016820	TTA	2	6	21125	21130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016820	TCA	2	6	21143	21148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_016820	TTA	2	6	21180	21185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016820	TGT	2	6	21430	21435	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_016820	TAA	2	6	21465	21470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016820	AAT	2	6	21475	21480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_016820	CCA	2	6	21641	21646	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_016820	TTG	2	6	21726	21731	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_016820	TGA	2	6	21848	21853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016820	AGA	2	6	21899	21904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_016820	ATT	2	6	21907	21912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_016820	CAA	2	6	21921	21926	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_016820	TCG	2	6	22150	22155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_016820	AAT	2	6	22273	22278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016820	ATG	2	6	22288	22293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_016820	TAT	2	6	22321	22326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_016820	CAT	2	6	22352	22357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_016820	CTA	2	6	22409	22414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_016820	ATA	2	6	22705	22710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_016820	TAT	2	6	22817	22822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_016820	GAA	2	6	22947	22952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_016820	AAC	2	6	22995	23000	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_016820	TGA	2	6	23104	23109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_016820	AGA	2	6	23113	23118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_016820	ACT	2	6	23174	23179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_016820	TAT	2	6	23266	23271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_016820	ATT	2	6	23333	23338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_016820	AGA	2	6	23347	23352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_016820	ATT	2	6	23672	23677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_016820	TAT	2	6	23678	23683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_016820	AGG	3	9	23694	23702	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
148	NC_016820	ATC	2	6	23739	23744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_016820	TGA	2	6	23905	23910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
150	NC_016820	TAT	2	6	24075	24080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_016820	GAC	2	6	24183	24188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_016820	GTT	2	6	24206	24211	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
153	NC_016820	TAA	2	6	24417	24422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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156	NC_016820	TCC	2	6	26189	26194	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
157	NC_016820	GCG	2	6	26229	26234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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166	NC_016820	AAT	2	6	27517	27522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_016820	CTG	2	6	27671	27676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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169	NC_016820	AAT	2	6	28753	28758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
170	NC_016820	ATT	2	6	28807	28812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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174	NC_016820	TAA	2	6	30744	30749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
175	NC_016820	AAC	2	6	30854	30859	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
176	NC_016820	CTT	2	6	30968	30973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
177	NC_016820	ATA	2	6	31448	31453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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180	NC_016820	TTA	2	6	33264	33269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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184	NC_016820	CTC	2	6	34553	34558	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
185	NC_016820	TAG	2	6	34574	34579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
186	NC_016820	ACG	2	6	35239	35244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.