MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides J18 plasmid pKLE02

Total Repeats: 301

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016820	TCC	2	6	88	93	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379703844
2	NC_016820	CTT	2	6	242	247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379703844
3	NC_016820	CTG	2	6	582	587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379703845
4	NC_016820	CTT	2	6	663	668	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379703845
5	NC_016820	AGA	2	6	839	844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379703845
6	NC_016820	TCA	2	6	845	850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379703845
7	NC_016820	TAA	2	6	1683	1688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379703846
8	NC_016820	TTG	2	6	1802	1807	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379703846
9	NC_016820	TCA	2	6	1843	1848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379703846
10	NC_016820	CTG	2	6	2237	2242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379703847
11	NC_016820	GTA	2	6	2255	2260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379703847
12	NC_016820	CTA	2	6	2294	2299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379703847
13	NC_016820	AGT	2	6	2324	2329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379703847
14	NC_016820	TAG	2	6	2340	2345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379703847
15	NC_016820	TCA	2	6	2346	2351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379703847
16	NC_016820	TTC	2	6	2366	2371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379703847
17	NC_016820	ACA	2	6	2462	2467	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379703847
18	NC_016820	TAT	2	6	2524	2529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379703847
19	NC_016820	GTT	2	6	2567	2572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379703847
20	NC_016820	GCT	2	6	2647	2652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379703848
21	NC_016820	ATT	2	6	2737	2742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379703848
22	NC_016820	TAT	2	6	2762	2767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379703848
23	NC_016820	ATT	3	9	2797	2805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379703848
24	NC_016820	GGC	2	6	2821	2826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379703848
25	NC_016820	GAC	2	6	2829	2834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379703848
26	NC_016820	ATG	2	6	2845	2850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379703848
27	NC_016820	AGT	2	6	3174	3179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379703849
28	NC_016820	GTT	2	6	3217	3222	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379703849
29	NC_016820	TAT	2	6	3413	3418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379703849
30	NC_016820	TGG	2	6	3439	3444	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379703849
31	NC_016820	CAT	2	6	3557	3562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379703849
32	NC_016820	GTG	2	6	3605	3610	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379703849
33	NC_016820	ATC	2	6	3624	3629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379703849
34	NC_016820	GGA	2	6	3669	3674	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379703849
35	NC_016820	TTG	2	6	3823	3828	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379703849
36	NC_016820	TAT	2	6	3837	3842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379703849
37	NC_016820	AAG	2	6	4019	4024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379703849
38	NC_016820	ATC	2	6	4045	4050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379703849
39	NC_016820	ATT	2	6	4273	4278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379703849
40	NC_016820	TAG	2	6	4337	4342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379703849
41	NC_016820	TAG	2	6	4349	4354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379703849
42	NC_016820	TTA	2	6	4390	4395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379703849
43	NC_016820	TCC	2	6	4435	4440	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379703849
44	NC_016820	TGG	2	6	4470	4475	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379703849
45	NC_016820	AGA	2	6	4482	4487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379703849
46	NC_016820	CAA	2	6	4489	4494	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379703849
47	NC_016820	AGA	2	6	4540	4545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379703849
48	NC_016820	ATT	2	6	4597	4602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379703849
49	NC_016820	AAC	2	6	4657	4662	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379703849
50	NC_016820	AAT	2	6	5227	5232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379703850
51	NC_016820	GTT	2	6	5312	5317	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379703850
52	NC_016820	TAC	3	9	5502	5510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379703850
53	NC_016820	CGG	2	6	5670	5675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379703850
54	NC_016820	TAG	2	6	5727	5732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379703850
55	NC_016820	TAC	2	6	5790	5795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379703850
56	NC_016820	TAT	2	6	5929	5934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379703850
57	NC_016820	TTG	2	6	5967	5972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379703850
58	NC_016820	ATT	2	6	6068	6073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379703850
59	NC_016820	ATC	2	6	6085	6090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379703850
60	NC_016820	ATT	2	6	6095	6100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379703850
61	NC_016820	GAT	2	6	6101	6106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379703850
62	NC_016820	TTG	2	6	6126	6131	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379703850
63	NC_016820	CAA	2	6	6144	6149	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379703850
64	NC_016820	TAG	2	6	6150	6155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379703850
65	NC_016820	ATT	2	6	6422	6427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379703851
66	NC_016820	GTA	2	6	6450	6455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379703851
67	NC_016820	ACC	2	6	6481	6486	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379703851
68	NC_016820	ATG	2	6	6504	6509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379703851
69	NC_016820	CAT	2	6	6585	6590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379703851
70	NC_016820	TCA	2	6	6594	6599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379703851
71	NC_016820	GTT	2	6	6642	6647	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379703851
72	NC_016820	ATA	2	6	6649	6654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379703851
73	NC_016820	TCA	2	6	6665	6670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379703851
74	NC_016820	GAC	2	6	6817	6822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379703851
75	NC_016820	TAT	2	6	6825	6830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379703851
76	NC_016820	CCA	2	6	6869	6874	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379703851
77	NC_016820	ATA	2	6	6875	6880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379703851
78	NC_016820	AAT	2	6	6910	6915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379703851
79	NC_016820	GAC	2	6	7114	7119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379703852
80	NC_016820	CAT	2	6	7183	7188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379703852
81	NC_016820	AGC	2	6	7198	7203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379703852
82	NC_016820	ATC	2	6	7222	7227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379703852
83	NC_016820	TTG	2	6	7285	7290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379703852
84	NC_016820	CTT	2	6	7356	7361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379703852
85	NC_016820	ATT	2	6	7369	7374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379703852
86	NC_016820	CTT	2	6	7385	7390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379703852
87	NC_016820	TTG	2	6	7476	7481	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379703852
88	NC_016820	AAC	2	6	7540	7545	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379703852
89	NC_016820	ATA	2	6	7559	7564	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379703852
90	NC_016820	CGT	2	6	7566	7571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379703852
91	NC_016820	AAT	2	6	7837	7842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379703853
92	NC_016820	ATT	2	6	8869	8874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379703854
93	NC_016820	AAG	2	6	8911	8916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379703854
94	NC_016820	AGA	2	6	8939	8944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379703854
95	NC_016820	TAA	2	6	9690	9695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379703855
96	NC_016820	ATT	2	6	9835	9840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379703855
97	NC_016820	AAC	2	6	9947	9952	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379703855
98	NC_016820	TTA	2	6	10087	10092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379703856
99	NC_016820	TGC	2	6	10112	10117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379703856
100	NC_016820	TTG	2	6	10126	10131	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379703856
101	NC_016820	CAA	2	6	10141	10146	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379703856
102	NC_016820	ATG	2	6	10147	10152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379703856
103	NC_016820	TGT	3	9	10429	10437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379703857
104	NC_016820	TGA	2	6	10934	10939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379703858
105	NC_016820	ATC	2	6	10944	10949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379703858
106	NC_016820	TAT	2	6	11072	11077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379703858
107	NC_016820	TCC	2	6	11146	11151	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379703858
108	NC_016820	TGT	2	6	11304	11309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379703859
109	NC_016820	ATG	2	6	11358	11363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379703859
110	NC_016820	TTC	2	6	11378	11383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379703859
111	NC_016820	TGT	2	6	11491	11496	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379703859
112	NC_016820	GTT	2	6	11545	11550	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379703859
113	NC_016820	ATG	2	6	11565	11570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379703859
114	NC_016820	TGG	2	6	11618	11623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379703859
115	NC_016820	ATT	2	6	11793	11798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379703859
116	NC_016820	CAT	2	6	11840	11845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379703859
117	NC_016820	TAA	2	6	11897	11902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379703859
118	NC_016820	GTA	3	9	13271	13279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379703860
119	NC_016820	ATT	2	6	13360	13365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379703860
120	NC_016820	CTT	2	6	13422	13427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379703860
121	NC_016820	TCT	2	6	13442	13447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379703860
122	NC_016820	AAT	2	6	13452	13457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379703860
123	NC_016820	TGT	2	6	13544	13549	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379703860
124	NC_016820	TGA	2	6	14332	14337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379703861
125	NC_016820	ATG	2	6	14355	14360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379703861
126	NC_016820	AAT	2	6	14384	14389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379703861
127	NC_016820	ACC	2	6	14413	14418	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379703861
128	NC_016820	CTA	2	6	14455	14460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379703861
129	NC_016820	TAT	2	6	14551	14556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379703861
130	NC_016820	GAA	2	6	14590	14595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379703861
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255	NC_016820	GGA	2	6	30488	30493	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379703880
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257	NC_016820	ATT	2	6	30988	30993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379703881
258	NC_016820	CAT	2	6	31236	31241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379703881
259	NC_016820	TTA	2	6	31242	31247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379703881
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263	NC_016820	ACA	2	6	31735	31740	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379703882
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283	NC_016820	ATT	2	6	33394	33399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379703886
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.