MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Rahnella aquatilis CIP 78.65 = ATCC 33071 plasmid pRahaq202

Total Repeats: 16

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016819	TTCTTT	2	12	11558	11569	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	383192322
2	NC_016819	ACGGTT	2	12	14942	14953	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	383192324
3	NC_016819	CAGTGT	2	12	18416	18427	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	383192328
4	NC_016819	ACGCTG	2	12	20221	20232	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	383192329
5	NC_016819	GCTGAA	2	12	25204	25215	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	383192333
6	NC_016819	GCGCCT	2	12	62384	62395	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	383192371
7	NC_016819	CAAATT	2	12	72880	72891	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	383192378
8	NC_016819	GGATTA	2	12	74936	74947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383192380
9	NC_016819	TTCGGT	2	12	75209	75220	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	383192380
10	NC_016819	ATCGTC	2	12	79554	79565	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	383192385
11	NC_016819	GTCGCA	2	12	88050	88061	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	383192394
12	NC_016819	AAGGGC	2	12	94049	94060	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	383192397
13	NC_016819	CGTCAC	2	12	97182	97193	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	383192400
14	NC_016819	ATGGTG	2	12	107679	107690	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	383192411
15	NC_016819	CATGTC	2	12	112660	112671	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	383192416
16	NC_016819	AAATCC	2	12	114636	114647	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	383192417

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.