MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Rahnella aquatilis CIP 78.65 = ATCC 33071 plasmid pRahaq202

Total Repeats: 62

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016819	TAAAA	2	10	2301	2310	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016819	GGGGA	2	10	2361	2370	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016819	ACATC	2	10	2819	2828	40 %	20 %	0 %	40 %	383192315
4	NC_016819	CTGGG	2	10	3749	3758	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
5	NC_016819	ATCCC	2	10	8189	8198	20 %	20 %	0 %	60 %	383192319
6	NC_016819	TTTGT	2	10	8863	8872	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016819	AAATT	2	10	12005	12014	60 %	40 %	0 %	0 %	383192322
8	NC_016819	TCTGG	2	10	12032	12041	0 %	40 %	40 %	20 %	383192322
9	NC_016819	CATGC	2	10	12086	12095	20 %	20 %	20 %	40 %	383192322
10	NC_016819	ACCGG	2	10	15254	15263	20 %	0 %	40 %	40 %	383192324
11	NC_016819	TGTGT	2	10	16882	16891	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016819	GCGCG	2	10	18786	18795	0 %	0 %	60 %	40 %	383192328
13	NC_016819	GATTG	2	10	19196	19205	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016819	ATTGC	2	10	20152	20161	20 %	40 %	20 %	20 %	383192329
15	NC_016819	CCGGC	2	10	25472	25481	0 %	0 %	40 %	60 %	383192334
16	NC_016819	TCAAA	2	10	26007	26016	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_016819	TATTT	2	10	29262	29271	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016819	AAGGA	2	10	30305	30314	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016819	CTGCA	2	10	34809	34818	20 %	20 %	20 %	40 %	383192344
20	NC_016819	GCGCG	2	10	37024	37033	0 %	0 %	60 %	40 %	383192346
21	NC_016819	AATTT	2	10	39629	39638	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016819	ATTTT	2	10	39740	39749	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016819	CTGAC	2	10	43782	43791	20 %	20 %	20 %	40 %	383192352
24	NC_016819	ACCAC	2	10	44631	44640	40 %	0 %	0 %	60 %	383192352
25	NC_016819	AAAGA	2	10	46689	46698	80 %	0 %	20 %	0 %	383192355
26	NC_016819	ACGCC	2	10	48882	48891	20 %	0 %	20 %	60 %	383192358
27	NC_016819	GAAGA	2	10	50757	50766	60 %	0 %	40 %	0 %	383192359
28	NC_016819	ATTTA	2	10	56532	56541	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016819	CAATC	2	10	59636	59645	40 %	20 %	0 %	40 %	383192368
30	NC_016819	TCCCA	2	10	63408	63417	20 %	20 %	0 %	60 %	383192372
31	NC_016819	TGACC	2	10	64192	64201	20 %	20 %	20 %	40 %	383192372
32	NC_016819	TGGGC	2	10	67417	67426	0 %	20 %	60 %	20 %	383192374
33	NC_016819	ACCAC	2	10	71438	71447	40 %	0 %	0 %	60 %	383192378
34	NC_016819	CTGAT	2	10	71742	71751	20 %	40 %	20 %	20 %	383192378
35	NC_016819	TCTGG	2	10	71914	71923	0 %	40 %	40 %	20 %	383192378
36	NC_016819	TGGTC	2	10	75199	75208	0 %	40 %	40 %	20 %	383192380
37	NC_016819	GGTAA	2	10	75849	75858	40 %	20 %	40 %	0 %	383192381
38	NC_016819	CCTGA	2	10	77540	77549	20 %	20 %	20 %	40 %	383192384
39	NC_016819	GACCC	2	10	77972	77981	20 %	0 %	20 %	60 %	383192384
40	NC_016819	TTTAT	2	10	79233	79242	20 %	80 %	0 %	0 %	383192385
41	NC_016819	TCTTT	2	10	80083	80092	0 %	80 %	0 %	20 %	383192385
42	NC_016819	GATGA	2	10	86815	86824	40 %	20 %	40 %	0 %	383192393
43	NC_016819	CGGCC	2	10	88889	88898	0 %	0 %	40 %	60 %	383192394
44	NC_016819	CAGGT	2	10	90629	90638	20 %	20 %	40 %	20 %	383192396
45	NC_016819	AAGGC	2	10	93752	93761	40 %	0 %	40 %	20 %	383192397
46	NC_016819	CGACA	2	10	97431	97440	40 %	0 %	20 %	40 %	383192400
47	NC_016819	ACGGG	2	10	97602	97611	20 %	0 %	60 %	20 %	383192400
48	NC_016819	TCAGA	2	10	97841	97850	40 %	20 %	20 %	20 %	383192401
49	NC_016819	CGCAC	2	10	98177	98186	20 %	0 %	20 %	60 %	383192401
50	NC_016819	ACCGG	2	10	98826	98835	20 %	0 %	40 %	40 %	383192401
51	NC_016819	CAGAT	2	10	99753	99762	40 %	20 %	20 %	20 %	383192402
52	NC_016819	CCCAG	2	10	101425	101434	20 %	0 %	20 %	60 %	383192403
53	NC_016819	CGGCC	2	10	102507	102516	0 %	0 %	40 %	60 %	383192405
54	NC_016819	GCCCG	2	10	105045	105054	0 %	0 %	40 %	60 %	383192407
55	NC_016819	GCCAG	2	10	105288	105297	20 %	0 %	40 %	40 %	383192408
56	NC_016819	CTGTT	2	10	106162	106171	0 %	60 %	20 %	20 %	383192409
57	NC_016819	GATCG	2	10	108224	108233	20 %	20 %	40 %	20 %	383192411
58	NC_016819	GCAGC	2	10	110084	110093	20 %	0 %	40 %	40 %	383192413
59	NC_016819	GCCAG	2	10	110585	110594	20 %	0 %	40 %	40 %	383192413
60	NC_016819	CTGTC	2	10	111294	111303	0 %	40 %	20 %	40 %	383192415
61	NC_016819	TCGCC	2	10	112435	112444	0 %	20 %	20 %	60 %	383192415
62	NC_016819	GCCGG	2	10	115248	115257	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.