MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Rahnella aquatilis CIP 78.65 = ATCC 33071 plasmid pRahaq202

Total Repeats: 68

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016819	TAAT	2	8	1990	1997	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016819	CATA	2	8	2044	2051	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_016819	CATA	2	8	2435	2442	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_016819	TAAT	2	8	3449	3456	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016819	ATTT	2	8	7674	7681	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016819	ACTC	2	8	7741	7748	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_016819	TCAC	2	8	7762	7769	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_016819	GTCC	2	8	9817	9824	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9	NC_016819	TAAA	2	8	9825	9832	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016819	CCTG	2	8	11273	11280	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_016819	AACT	2	8	11303	11310	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_016819	ATAA	2	8	14298	14305	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016819	ATAA	2	8	16333	16340	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016819	TAAT	2	8	16688	16695	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016819	TAAA	2	8	16795	16802	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016819	TGAG	2	8	16934	16941	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016819	AAGT	2	8	18062	18069	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016819	AACA	2	8	23865	23872	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_016819	TTCT	2	8	23992	23999	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_016819	TCAT	2	8	24109	24116	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_016819	TAAG	2	8	31078	31085	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016819	ACCC	2	8	34517	34524	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
23	NC_016819	TGAT	2	8	37513	37520	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016819	ATGG	2	8	37866	37873	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016819	TTAA	2	8	39253	39260	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016819	AGTA	2	8	39696	39703	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016819	CCCA	2	8	39772	39779	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
28	NC_016819	TTGT	2	8	40115	40122	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016819	TTTG	2	8	40170	40177	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016819	GCTG	2	8	40468	40475	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
31	NC_016819	GCTG	2	8	43616	43623	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
32	NC_016819	TTCA	2	8	45216	45223	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_016819	CATT	2	8	47398	47405	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_016819	CATT	2	8	47815	47822	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_016819	TTAA	2	8	47863	47870	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016819	ATCT	2	8	51722	51729	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_016819	CTTT	2	8	52369	52376	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_016819	CTGG	2	8	54575	54582	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
39	NC_016819	GGTC	2	8	54662	54669	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
40	NC_016819	ATTG	2	8	54678	54685	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016819	CGGA	2	8	57449	57456	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
42	NC_016819	CTCC	2	8	57510	57517	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
43	NC_016819	TAAA	2	8	58273	58280	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016819	TTTA	2	8	60984	60991	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016819	GCTG	2	8	61019	61026	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_016819	CGGT	2	8	66336	66343	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
47	NC_016819	TACG	2	8	66421	66428	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_016819	TTCG	2	8	68661	68668	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_016819	GGAA	2	8	69390	69397	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016819	ATTT	2	8	76707	76714	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016819	AATA	2	8	76835	76842	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016819	AATG	2	8	81918	81925	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016819	TACC	2	8	85530	85537	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_016819	TGCA	2	8	85591	85598	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_016819	CACC	2	8	85645	85652	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
56	NC_016819	CTGC	2	8	89016	89023	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
57	NC_016819	GTTA	2	8	90055	90062	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016819	CACT	2	8	90065	90072	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_016819	CCGA	2	8	90919	90926	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
60	NC_016819	ACTG	2	8	90952	90959	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_016819	GCAG	2	8	91271	91278	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
62	NC_016819	TCTG	2	8	91410	91417	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_016819	CTGG	2	8	95651	95658	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
64	NC_016819	TTAT	2	8	97728	97735	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016819	AACC	2	8	100934	100941	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_016819	TGTT	2	8	105211	105218	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016819	ACAA	2	8	115159	115166	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_016819	CTGG	2	8	115284	115291	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.