MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Rahnella aquatilis CIP 78.65 = ATCC 33071 plasmid pRahaq202

Total Repeats: 262

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016819	ACT	2	6	198	203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_016819	CAT	2	6	204	209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_016819	AGC	2	6	394	399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_016819	TGG	2	6	513	518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016819	CGC	2	6	545	550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_016819	ATG	2	6	559	564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016819	GCA	3	9	570	578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_016819	GAT	2	6	1816	1821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016819	TAA	2	6	1868	1873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016819	TTA	2	6	1881	1886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016819	TCA	2	6	1973	1978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_016819	TAA	2	6	2057	2062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016819	TTA	2	6	2128	2133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016819	CAA	3	9	2163	2171	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_016819	GAA	2	6	2183	2188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016819	TTA	2	6	2236	2241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016819	TTA	2	6	2250	2255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016819	CAT	2	6	2256	2261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_016819	TGG	2	6	2380	2385	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016819	GCA	2	6	2428	2433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_016819	ATA	2	6	3410	3415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016819	TTA	2	6	3473	3478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016819	GCC	2	6	3493	3498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_016819	AAT	2	6	3535	3540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016819	AAT	2	6	3563	3568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016819	ATT	2	6	3628	3633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016819	ACA	2	6	3638	3643	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_016819	GTT	2	6	3785	3790	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016819	CGG	2	6	3897	3902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_016819	CGT	2	6	3928	3933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_016819	CAG	2	6	4009	4014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_016819	GAG	2	6	4651	4656	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016819	AGC	2	6	5788	5793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_016819	TAA	2	6	5809	5814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016819	ACT	2	6	6033	6038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_016819	AAC	2	6	6063	6068	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_016819	CAG	2	6	6094	6099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_016819	CTG	2	6	6200	6205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_016819	ACA	2	6	6211	6216	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_016819	GTT	2	6	7419	7424	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016819	TTA	2	6	7525	7530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016819	CAT	2	6	7637	7642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_016819	TGA	2	6	7729	7734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016819	GAT	2	6	7910	7915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016819	TTA	2	6	7928	7933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016819	GAG	2	6	7990	7995	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016819	ATG	2	6	8039	8044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016819	TTG	2	6	8820	8825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016819	TTA	2	6	8829	8834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016819	CCG	2	6	8840	8845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_016819	TAT	2	6	9290	9295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016819	ACT	2	6	9397	9402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_016819	GTT	2	6	9433	9438	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016819	TAT	2	6	9528	9533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016819	AAT	2	6	9646	9651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016819	TAT	2	6	9689	9694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016819	TTA	2	6	9709	9714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016819	AGT	2	6	9736	9741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016819	AAG	2	6	9749	9754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016819	TGA	2	6	9773	9778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016819	TAT	2	6	9802	9807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016819	GAT	2	6	10119	10124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016819	ACA	2	6	10148	10153	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_016819	TGA	2	6	14232	14237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016819	TTA	2	6	14246	14251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016819	AAG	2	6	14307	14312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016819	ATC	2	6	16804	16809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_016819	GTA	2	6	16861	16866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016819	ACT	2	6	17884	17889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_016819	ATA	2	6	17922	17927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016819	GGC	2	6	17929	17934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_016819	CCG	2	6	17940	17945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_016819	AAT	2	6	18002	18007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_016819	GCC	2	6	18042	18047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_016819	TAT	2	6	18050	18055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016819	GAC	2	6	18101	18106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_016819	TCA	2	6	18927	18932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_016819	GAA	2	6	19019	19024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016819	GAT	2	6	19073	19078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016819	TGC	2	6	19086	19091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_016819	TGA	2	6	19167	19172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016819	CAG	2	6	23483	23488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_016819	CAG	2	6	23500	23505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_016819	TCC	2	6	23803	23808	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_016819	TAA	2	6	23855	23860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016819	ATA	2	6	23919	23924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016819	AAT	2	6	24073	24078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016819	TAA	2	6	24084	24089	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016819	ATC	2	6	25261	25266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_016819	ATG	2	6	25810	25815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016819	TCT	2	6	25878	25883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_016819	TCA	2	6	25896	25901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_016819	TAA	2	6	25986	25991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016819	AAT	2	6	26017	26022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016819	ATT	2	6	26040	26045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016819	TAA	2	6	26131	26136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016819	ATA	2	6	26199	26204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016819	CGT	2	6	29276	29281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_016819	CGC	2	6	31041	31046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_016819	CGG	2	6	31828	31833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_016819	CAT	2	6	33445	33450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_016819	GCG	2	6	33457	33462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_016819	AAT	2	6	35711	35716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016819	AAG	2	6	36200	36205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016819	TCA	2	6	37562	37567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_016819	TAA	2	6	37579	37584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016819	CCG	2	6	37649	37654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_016819	ATC	2	6	37661	37666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_016819	CAT	2	6	37804	37809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_016819	AAC	2	6	37853	37858	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_016819	ATT	2	6	37859	37864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016819	TGA	2	6	37911	37916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016819	TGT	2	6	39336	39341	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_016819	ATT	2	6	39419	39424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016819	AAG	2	6	39441	39446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016819	TCA	2	6	39468	39473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_016819	AAT	2	6	39536	39541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016819	ATT	2	6	39579	39584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016819	GAA	2	6	39598	39603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016819	ATT	2	6	39666	39671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_016819	CTC	2	6	39750	39755	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_016819	TCT	2	6	39782	39787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_016819	ATT	2	6	39832	39837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_016819	TTA	2	6	40137	40142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_016819	CTT	2	6	40283	40288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_016819	TAA	3	9	40307	40315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_016819	GTC	2	6	40511	40516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_016819	TAT	2	6	41545	41550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016819	ATC	2	6	45306	45311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_016819	TTA	2	6	45315	45320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016819	AGT	2	6	45354	45359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_016819	AAG	2	6	45403	45408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_016819	CCT	2	6	46222	46227	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_016819	GGA	2	6	46316	46321	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_016819	ACA	2	6	46329	46334	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_016819	ATC	2	6	46439	46444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_016819	TCC	2	6	46791	46796	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_016819	AAC	2	6	47407	47412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_016819	TAA	2	6	47796	47801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_016819	GAC	2	6	47919	47924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_016819	AAT	2	6	47943	47948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_016819	GAA	2	6	48221	48226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.