MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Rahnella aquatilis CIP 78.65 = ATCC 33071 plasmid pRahaq202

Total Repeats: 141

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016819	AG	3	6	595	600	50 %	0 %	50 %	0 %	383192312
2	NC_016819	CG	4	8	763	770	0 %	0 %	50 %	50 %	383192312
3	NC_016819	GC	3	6	1268	1273	0 %	0 %	50 %	50 %	383192312
4	NC_016819	GA	3	6	4853	4858	50 %	0 %	50 %	0 %	383192317
5	NC_016819	GC	3	6	5008	5013	0 %	0 %	50 %	50 %	383192317
6	NC_016819	AC	3	6	5280	5285	50 %	0 %	0 %	50 %	383192317
7	NC_016819	TG	3	6	5383	5388	0 %	50 %	50 %	0 %	383192317
8	NC_016819	AG	4	8	5588	5595	50 %	0 %	50 %	0 %	383192317
9	NC_016819	GC	3	6	6323	6328	0 %	0 %	50 %	50 %	383192318
10	NC_016819	AG	3	6	6641	6646	50 %	0 %	50 %	0 %	383192318
11	NC_016819	AG	3	6	6859	6864	50 %	0 %	50 %	0 %	383192318
12	NC_016819	CG	3	6	6898	6903	0 %	0 %	50 %	50 %	383192318
13	NC_016819	CT	3	6	8294	8299	0 %	50 %	0 %	50 %	383192319
14	NC_016819	AT	3	6	8517	8522	50 %	50 %	0 %	0 %	383192319
15	NC_016819	GC	3	6	10344	10349	0 %	0 %	50 %	50 %	383192321
16	NC_016819	CA	3	6	10834	10839	50 %	0 %	0 %	50 %	383192321
17	NC_016819	GA	3	6	10919	10924	50 %	0 %	50 %	0 %	383192321
18	NC_016819	CG	3	6	10997	11002	0 %	0 %	50 %	50 %	383192321
19	NC_016819	CG	3	6	12973	12978	0 %	0 %	50 %	50 %	383192323
20	NC_016819	GC	3	6	13292	13297	0 %	0 %	50 %	50 %	383192323
21	NC_016819	GC	3	6	14448	14453	0 %	0 %	50 %	50 %	383192324
22	NC_016819	GC	5	10	15826	15835	0 %	0 %	50 %	50 %	383192325
23	NC_016819	TG	3	6	16004	16009	0 %	50 %	50 %	0 %	383192325
24	NC_016819	CA	3	6	17554	17559	50 %	0 %	0 %	50 %	383192327
25	NC_016819	CG	3	6	19741	19746	0 %	0 %	50 %	50 %	383192329
26	NC_016819	AC	3	6	20652	20657	50 %	0 %	0 %	50 %	383192330
27	NC_016819	TC	3	6	21783	21788	0 %	50 %	0 %	50 %	383192330
28	NC_016819	GC	3	6	22104	22109	0 %	0 %	50 %	50 %	383192330
29	NC_016819	CT	3	6	22857	22862	0 %	50 %	0 %	50 %	383192330
30	NC_016819	CA	3	6	26924	26929	50 %	0 %	0 %	50 %	383192336
31	NC_016819	CA	3	6	27222	27227	50 %	0 %	0 %	50 %	383192336
32	NC_016819	GA	3	6	29592	29597	50 %	0 %	50 %	0 %	383192338
33	NC_016819	GA	3	6	29923	29928	50 %	0 %	50 %	0 %	383192338
34	NC_016819	CA	3	6	30414	30419	50 %	0 %	0 %	50 %	383192339
35	NC_016819	AG	3	6	30477	30482	50 %	0 %	50 %	0 %	383192339
36	NC_016819	TA	3	6	30594	30599	50 %	50 %	0 %	0 %	383192339
37	NC_016819	GC	3	6	31514	31519	0 %	0 %	50 %	50 %	383192341
38	NC_016819	GC	3	6	32715	32720	0 %	0 %	50 %	50 %	383192342
39	NC_016819	AG	3	6	33098	33103	50 %	0 %	50 %	0 %	383192342
40	NC_016819	AT	3	6	33163	33168	50 %	50 %	0 %	0 %	383192342
41	NC_016819	TA	3	6	35968	35973	50 %	50 %	0 %	0 %	383192345
42	NC_016819	GC	3	6	38943	38948	0 %	0 %	50 %	50 %	383192347
43	NC_016819	AG	3	6	40773	40778	50 %	0 %	50 %	0 %	383192349
44	NC_016819	AG	3	6	41120	41125	50 %	0 %	50 %	0 %	383192349
45	NC_016819	TC	3	6	41378	41383	0 %	50 %	0 %	50 %	383192349
46	NC_016819	GC	3	6	41386	41391	0 %	0 %	50 %	50 %	383192349
47	NC_016819	CG	3	6	41433	41438	0 %	0 %	50 %	50 %	383192349
48	NC_016819	AG	3	6	42763	42768	50 %	0 %	50 %	0 %	383192351
49	NC_016819	CT	3	6	43329	43334	0 %	50 %	0 %	50 %	383192351
50	NC_016819	GT	3	6	43552	43557	0 %	50 %	50 %	0 %	383192351
51	NC_016819	GA	3	6	44804	44809	50 %	0 %	50 %	0 %	383192352
52	NC_016819	AT	4	8	47785	47792	50 %	50 %	0 %	0 %	383192357
53	NC_016819	CT	3	6	48736	48741	0 %	50 %	0 %	50 %	383192358
54	NC_016819	CG	3	6	50227	50232	0 %	0 %	50 %	50 %	383192359
55	NC_016819	AG	3	6	50307	50312	50 %	0 %	50 %	0 %	383192359
56	NC_016819	TA	4	8	51526	51533	50 %	50 %	0 %	0 %	383192360
57	NC_016819	TC	3	6	53228	53233	0 %	50 %	0 %	50 %	383192361
58	NC_016819	GC	3	6	54356	54361	0 %	0 %	50 %	50 %	383192363
59	NC_016819	GC	3	6	54451	54456	0 %	0 %	50 %	50 %	383192363
60	NC_016819	GA	3	6	55053	55058	50 %	0 %	50 %	0 %	383192364
61	NC_016819	TC	3	6	55953	55958	0 %	50 %	0 %	50 %	383192365
62	NC_016819	TG	3	6	59077	59082	0 %	50 %	50 %	0 %	383192368
63	NC_016819	AG	4	8	60103	60110	50 %	0 %	50 %	0 %	383192369
64	NC_016819	AG	3	6	60252	60257	50 %	0 %	50 %	0 %	383192369
65	NC_016819	GC	3	6	60517	60522	0 %	0 %	50 %	50 %	383192369
66	NC_016819	CG	3	6	60581	60586	0 %	0 %	50 %	50 %	383192369
67	NC_016819	TC	4	8	60674	60681	0 %	50 %	0 %	50 %	383192369
68	NC_016819	GC	3	6	60805	60810	0 %	0 %	50 %	50 %	383192369
69	NC_016819	TA	4	8	63491	63498	50 %	50 %	0 %	0 %	383192372
70	NC_016819	CT	3	6	63725	63730	0 %	50 %	0 %	50 %	383192372
71	NC_016819	GT	3	6	64085	64090	0 %	50 %	50 %	0 %	383192372
72	NC_016819	GT	3	6	64493	64498	0 %	50 %	50 %	0 %	383192372
73	NC_016819	AT	3	6	64651	64656	50 %	50 %	0 %	0 %	383192372
74	NC_016819	CT	3	6	65990	65995	0 %	50 %	0 %	50 %	383192372
75	NC_016819	CG	4	8	67356	67363	0 %	0 %	50 %	50 %	383192374
76	NC_016819	CG	3	6	67512	67517	0 %	0 %	50 %	50 %	383192374
77	NC_016819	GT	3	6	67575	67580	0 %	50 %	50 %	0 %	383192374
78	NC_016819	GC	3	6	69447	69452	0 %	0 %	50 %	50 %	383192376
79	NC_016819	GC	3	6	69983	69988	0 %	0 %	50 %	50 %	383192377
80	NC_016819	TG	3	6	70630	70635	0 %	50 %	50 %	0 %	383192378
81	NC_016819	GC	3	6	70723	70728	0 %	0 %	50 %	50 %	383192378
82	NC_016819	CG	3	6	71010	71015	0 %	0 %	50 %	50 %	383192378
83	NC_016819	CA	3	6	71674	71679	50 %	0 %	0 %	50 %	383192378
84	NC_016819	CG	3	6	74086	74091	0 %	0 %	50 %	50 %	383192380
85	NC_016819	GT	3	6	75138	75143	0 %	50 %	50 %	0 %	383192380
86	NC_016819	GC	3	6	77444	77449	0 %	0 %	50 %	50 %	383192384
87	NC_016819	CG	3	6	77861	77866	0 %	0 %	50 %	50 %	383192384
88	NC_016819	GC	3	6	78252	78257	0 %	0 %	50 %	50 %	383192384
89	NC_016819	TG	3	6	79897	79902	0 %	50 %	50 %	0 %	383192385
90	NC_016819	TA	3	6	80539	80544	50 %	50 %	0 %	0 %	383192386
91	NC_016819	GT	3	6	80990	80995	0 %	50 %	50 %	0 %	383192386
92	NC_016819	AT	3	6	81472	81477	50 %	50 %	0 %	0 %	383192387
93	NC_016819	TG	3	6	81636	81641	0 %	50 %	50 %	0 %	383192387
94	NC_016819	TA	4	8	82741	82748	50 %	50 %	0 %	0 %	383192388
95	NC_016819	GA	3	6	83620	83625	50 %	0 %	50 %	0 %	383192390
96	NC_016819	AG	3	6	84135	84140	50 %	0 %	50 %	0 %	383192390
97	NC_016819	GC	3	6	84186	84191	0 %	0 %	50 %	50 %	383192390
98	NC_016819	CG	3	6	84366	84371	0 %	0 %	50 %	50 %	383192390
99	NC_016819	CG	3	6	84416	84421	0 %	0 %	50 %	50 %	383192390
100	NC_016819	CG	3	6	84677	84682	0 %	0 %	50 %	50 %	383192390
101	NC_016819	GC	3	6	84753	84758	0 %	0 %	50 %	50 %	383192390
102	NC_016819	GC	3	6	84843	84848	0 %	0 %	50 %	50 %	383192390
103	NC_016819	TC	3	6	86662	86667	0 %	50 %	0 %	50 %	383192392
104	NC_016819	AG	3	6	88848	88853	50 %	0 %	50 %	0 %	383192394
105	NC_016819	TG	3	6	89318	89323	0 %	50 %	50 %	0 %	383192395
106	NC_016819	CG	3	6	92639	92644	0 %	0 %	50 %	50 %	383192397
107	NC_016819	CG	3	6	93209	93214	0 %	0 %	50 %	50 %	383192397
108	NC_016819	TG	3	6	93531	93536	0 %	50 %	50 %	0 %	383192397
109	NC_016819	CA	3	6	94149	94154	50 %	0 %	0 %	50 %	383192397
110	NC_016819	GC	3	6	94761	94766	0 %	0 %	50 %	50 %	383192397
111	NC_016819	GA	3	6	95006	95011	50 %	0 %	50 %	0 %	383192397
112	NC_016819	GC	3	6	95183	95188	0 %	0 %	50 %	50 %	383192398
113	NC_016819	GC	3	6	96246	96251	0 %	0 %	50 %	50 %	383192399
114	NC_016819	GC	4	8	96689	96696	0 %	0 %	50 %	50 %	383192400
115	NC_016819	AC	3	6	99226	99231	50 %	0 %	0 %	50 %	383192401
116	NC_016819	GC	4	8	99287	99294	0 %	0 %	50 %	50 %	383192401
117	NC_016819	GA	3	6	99475	99480	50 %	0 %	50 %	0 %	383192402
118	NC_016819	GC	3	6	99815	99820	0 %	0 %	50 %	50 %	383192402
119	NC_016819	GC	3	6	100749	100754	0 %	0 %	50 %	50 %	383192402
120	NC_016819	GC	3	6	101516	101521	0 %	0 %	50 %	50 %	383192403
121	NC_016819	CA	3	6	101967	101972	50 %	0 %	0 %	50 %	383192403
122	NC_016819	CG	3	6	102932	102937	0 %	0 %	50 %	50 %	383192406
123	NC_016819	AG	3	6	103004	103009	50 %	0 %	50 %	0 %	383192406
124	NC_016819	AC	3	6	103525	103530	50 %	0 %	0 %	50 %	383192406
125	NC_016819	AT	3	6	104279	104284	50 %	50 %	0 %	0 %	383192407
126	NC_016819	GC	3	6	104802	104807	0 %	0 %	50 %	50 %	383192407
127	NC_016819	TA	3	6	105250	105255	50 %	50 %	0 %	0 %	383192408
128	NC_016819	GC	3	6	105654	105659	0 %	0 %	50 %	50 %	383192408
129	NC_016819	GC	3	6	107021	107026	0 %	0 %	50 %	50 %	383192410
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131	NC_016819	GC	3	6	107959	107964	0 %	0 %	50 %	50 %	383192411
132	NC_016819	GC	3	6	108280	108285	0 %	0 %	50 %	50 %	383192411
133	NC_016819	GC	3	6	108930	108935	0 %	0 %	50 %	50 %	383192412
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135	NC_016819	GC	3	6	109700	109705	0 %	0 %	50 %	50 %	383192412
136	NC_016819	GC	3	6	110043	110048	0 %	0 %	50 %	50 %	383192413
137	NC_016819	GC	3	6	112129	112134	0 %	0 %	50 %	50 %	383192415
138	NC_016819	CA	3	6	112262	112267	50 %	0 %	0 %	50 %	383192415
139	NC_016819	GC	3	6	112312	112317	0 %	0 %	50 %	50 %	383192415
140	NC_016819	GC	3	6	112459	112464	0 %	0 %	50 %	50 %	383192415
141	NC_016819	AC	3	6	113484	113489	50 %	0 %	0 %	50 %	383192416

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.