MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Rahnella aquatilis CIP 78.65 = ATCC 33071 plasmid pRahaq202

Total Repeats: 170

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016819	A	6	6	418	423	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016819	T	7	7	1215	1221	0 %	100 %	0 %	0 %	383192312
3	NC_016819	A	7	7	1622	1628	100 %	0 %	0 %	0 %	383192313
4	NC_016819	A	6	6	1639	1644	100 %	0 %	0 %	0 %	383192313
5	NC_016819	A	6	6	1733	1738	100 %	0 %	0 %	0 %	383192313
6	NC_016819	T	6	6	2471	2476	0 %	100 %	0 %	0 %	383192314
7	NC_016819	T	7	7	2725	2731	0 %	100 %	0 %	0 %	383192314
8	NC_016819	G	6	6	3702	3707	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016819	T	6	6	3818	3823	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016819	A	6	6	4501	4506	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016819	G	6	6	6040	6045	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016819	A	7	7	6191	6197	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016819	T	6	6	7279	7284	0 %	100 %	0 %	0 %	383192318
14	NC_016819	T	6	6	8724	8729	0 %	100 %	0 %	0 %	383192319
15	NC_016819	T	6	6	9110	9115	0 %	100 %	0 %	0 %	383192320
16	NC_016819	T	6	6	9208	9213	0 %	100 %	0 %	0 %	383192320
17	NC_016819	T	6	6	9283	9288	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016819	A	6	6	9344	9349	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016819	T	8	8	9787	9794	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016819	T	7	7	11103	11109	0 %	100 %	0 %	0 %	383192321
21	NC_016819	T	6	6	11652	11657	0 %	100 %	0 %	0 %	383192322
22	NC_016819	T	6	6	11763	11768	0 %	100 %	0 %	0 %	383192322
23	NC_016819	T	7	7	11827	11833	0 %	100 %	0 %	0 %	383192322
24	NC_016819	G	7	7	12109	12115	0 %	0 %	100 %	0 %	383192322
25	NC_016819	G	6	6	12951	12956	0 %	0 %	100 %	0 %	383192323
26	NC_016819	C	6	6	14503	14508	0 %	0 %	0 %	100 %	383192324
27	NC_016819	A	6	6	15765	15770	100 %	0 %	0 %	0 %	383192325
28	NC_016819	G	6	6	16163	16168	0 %	0 %	100 %	0 %	383192325
29	NC_016819	G	7	7	16264	16270	0 %	0 %	100 %	0 %	383192325
30	NC_016819	G	6	6	16327	16332	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016819	T	7	7	16829	16835	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016819	T	7	7	17039	17045	0 %	100 %	0 %	0 %	383192327
33	NC_016819	T	6	6	17683	17688	0 %	100 %	0 %	0 %	383192327
34	NC_016819	T	8	8	17773	17780	0 %	100 %	0 %	0 %	383192327
35	NC_016819	A	6	6	17986	17991	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016819	A	6	6	19140	19145	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016819	T	6	6	20448	20453	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016819	A	6	6	20607	20612	100 %	0 %	0 %	0 %	383192330
39	NC_016819	T	6	6	21838	21843	0 %	100 %	0 %	0 %	383192330
40	NC_016819	T	6	6	23714	23719	0 %	100 %	0 %	0 %	383192331
41	NC_016819	T	6	6	23727	23732	0 %	100 %	0 %	0 %	383192331
42	NC_016819	T	6	6	23825	23830	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016819	A	8	8	24060	24067	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016819	A	6	6	24514	24519	100 %	0 %	0 %	0 %	383192332
45	NC_016819	A	6	6	24569	24574	100 %	0 %	0 %	0 %	383192332
46	NC_016819	A	6	6	25990	25995	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016819	T	6	6	26101	26106	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016819	T	7	7	26294	26300	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016819	T	6	6	26343	26348	0 %	100 %	0 %	0 %	383192335
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51	NC_016819	A	6	6	28085	28090	100 %	0 %	0 %	0 %	383192336
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54	NC_016819	A	8	8	31382	31389	100 %	0 %	0 %	0 %	383192341
55	NC_016819	G	6	6	31798	31803	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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60	NC_016819	G	6	6	33328	33333	0 %	0 %	100 %	0 %	383192342
61	NC_016819	T	6	6	33381	33386	0 %	100 %	0 %	0 %	383192342
62	NC_016819	T	6	6	33513	33518	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016819	T	6	6	33627	33632	0 %	100 %	0 %	0 %	383192343
64	NC_016819	C	6	6	34368	34373	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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69	NC_016819	G	6	6	37167	37172	0 %	0 %	100 %	0 %	383192346
70	NC_016819	T	6	6	37585	37590	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016819	A	8	8	37837	37844	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016819	A	6	6	40045	40050	100 %	0 %	0 %	0 %	383192348
73	NC_016819	A	6	6	40151	40156	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.