MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Rahnella aquatilis CIP 78.65 = ATCC 33071 plasmid pRahaq202

Total Repeats: 121

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016819	T	7	7	1215	1221	0 %	100 %	0 %	0 %	383192312
2	NC_016819	A	7	7	1622	1628	100 %	0 %	0 %	0 %	383192313
3	NC_016819	A	6	6	1639	1644	100 %	0 %	0 %	0 %	383192313
4	NC_016819	A	6	6	1733	1738	100 %	0 %	0 %	0 %	383192313
5	NC_016819	T	6	6	2471	2476	0 %	100 %	0 %	0 %	383192314
6	NC_016819	T	7	7	2725	2731	0 %	100 %	0 %	0 %	383192314
7	NC_016819	T	6	6	7279	7284	0 %	100 %	0 %	0 %	383192318
8	NC_016819	T	6	6	8724	8729	0 %	100 %	0 %	0 %	383192319
9	NC_016819	T	6	6	9110	9115	0 %	100 %	0 %	0 %	383192320
10	NC_016819	T	6	6	9208	9213	0 %	100 %	0 %	0 %	383192320
11	NC_016819	T	7	7	11103	11109	0 %	100 %	0 %	0 %	383192321
12	NC_016819	T	6	6	11652	11657	0 %	100 %	0 %	0 %	383192322
13	NC_016819	T	6	6	11763	11768	0 %	100 %	0 %	0 %	383192322
14	NC_016819	T	7	7	11827	11833	0 %	100 %	0 %	0 %	383192322
15	NC_016819	G	7	7	12109	12115	0 %	0 %	100 %	0 %	383192322
16	NC_016819	G	6	6	12951	12956	0 %	0 %	100 %	0 %	383192323
17	NC_016819	C	6	6	14503	14508	0 %	0 %	0 %	100 %	383192324
18	NC_016819	A	6	6	15765	15770	100 %	0 %	0 %	0 %	383192325
19	NC_016819	G	6	6	16163	16168	0 %	0 %	100 %	0 %	383192325
20	NC_016819	G	7	7	16264	16270	0 %	0 %	100 %	0 %	383192325
21	NC_016819	T	7	7	17039	17045	0 %	100 %	0 %	0 %	383192327
22	NC_016819	T	6	6	17683	17688	0 %	100 %	0 %	0 %	383192327
23	NC_016819	T	8	8	17773	17780	0 %	100 %	0 %	0 %	383192327
24	NC_016819	A	6	6	20607	20612	100 %	0 %	0 %	0 %	383192330
25	NC_016819	T	6	6	21838	21843	0 %	100 %	0 %	0 %	383192330
26	NC_016819	T	6	6	23714	23719	0 %	100 %	0 %	0 %	383192331
27	NC_016819	T	6	6	23727	23732	0 %	100 %	0 %	0 %	383192331
28	NC_016819	A	6	6	24514	24519	100 %	0 %	0 %	0 %	383192332
29	NC_016819	A	6	6	24569	24574	100 %	0 %	0 %	0 %	383192332
30	NC_016819	T	6	6	26343	26348	0 %	100 %	0 %	0 %	383192335
31	NC_016819	T	7	7	26671	26677	0 %	100 %	0 %	0 %	383192336
32	NC_016819	A	6	6	28085	28090	100 %	0 %	0 %	0 %	383192336
33	NC_016819	T	6	6	30822	30827	0 %	100 %	0 %	0 %	383192340
34	NC_016819	T	6	6	30831	30836	0 %	100 %	0 %	0 %	383192340
35	NC_016819	A	8	8	31382	31389	100 %	0 %	0 %	0 %	383192341
36	NC_016819	A	6	6	32797	32802	100 %	0 %	0 %	0 %	383192342
37	NC_016819	T	6	6	32874	32879	0 %	100 %	0 %	0 %	383192342
38	NC_016819	C	6	6	32948	32953	0 %	0 %	0 %	100 %	383192342
39	NC_016819	G	6	6	33328	33333	0 %	0 %	100 %	0 %	383192342
40	NC_016819	T	6	6	33381	33386	0 %	100 %	0 %	0 %	383192342
41	NC_016819	T	6	6	33627	33632	0 %	100 %	0 %	0 %	383192343
42	NC_016819	T	6	6	35956	35961	0 %	100 %	0 %	0 %	383192345
43	NC_016819	G	6	6	36656	36661	0 %	0 %	100 %	0 %	383192346
44	NC_016819	T	6	6	36871	36876	0 %	100 %	0 %	0 %	383192346
45	NC_016819	T	6	6	37135	37140	0 %	100 %	0 %	0 %	383192346
46	NC_016819	G	6	6	37167	37172	0 %	0 %	100 %	0 %	383192346
47	NC_016819	A	6	6	40045	40050	100 %	0 %	0 %	0 %	383192348
48	NC_016819	A	6	6	40640	40645	100 %	0 %	0 %	0 %	383192349
49	NC_016819	T	6	6	43323	43328	0 %	100 %	0 %	0 %	383192351
50	NC_016819	T	6	6	43635	43640	0 %	100 %	0 %	0 %	383192352
51	NC_016819	A	7	7	44603	44609	100 %	0 %	0 %	0 %	383192352
52	NC_016819	T	6	6	46198	46203	0 %	100 %	0 %	0 %	383192354
53	NC_016819	A	6	6	47002	47007	100 %	0 %	0 %	0 %	383192356
54	NC_016819	T	7	7	47363	47369	0 %	100 %	0 %	0 %	383192356
55	NC_016819	T	6	6	47419	47424	0 %	100 %	0 %	0 %	383192357
56	NC_016819	A	7	7	47600	47606	100 %	0 %	0 %	0 %	383192357
57	NC_016819	T	6	6	47637	47642	0 %	100 %	0 %	0 %	383192357
58	NC_016819	C	7	7	48655	48661	0 %	0 %	0 %	100 %	383192358
59	NC_016819	G	7	7	49609	49615	0 %	0 %	100 %	0 %	383192358
60	NC_016819	T	6	6	50813	50818	0 %	100 %	0 %	0 %	383192359
61	NC_016819	A	6	6	51125	51130	100 %	0 %	0 %	0 %	383192359
62	NC_016819	A	6	6	53619	53624	100 %	0 %	0 %	0 %	383192361
63	NC_016819	A	6	6	53645	53650	100 %	0 %	0 %	0 %	383192361
64	NC_016819	T	6	6	54479	54484	0 %	100 %	0 %	0 %	383192363
65	NC_016819	T	6	6	56666	56671	0 %	100 %	0 %	0 %	383192366
66	NC_016819	T	6	6	56991	56996	0 %	100 %	0 %	0 %	383192366
67	NC_016819	T	6	6	57292	57297	0 %	100 %	0 %	0 %	383192366
68	NC_016819	A	6	6	57919	57924	100 %	0 %	0 %	0 %	383192367
69	NC_016819	C	6	6	58923	58928	0 %	0 %	0 %	100 %	383192368
70	NC_016819	T	7	7	59243	59249	0 %	100 %	0 %	0 %	383192368
71	NC_016819	T	6	6	60245	60250	0 %	100 %	0 %	0 %	383192369
72	NC_016819	T	7	7	60857	60863	0 %	100 %	0 %	0 %	383192369
73	NC_016819	T	7	7	61626	61632	0 %	100 %	0 %	0 %	383192370
74	NC_016819	A	7	7	62002	62008	100 %	0 %	0 %	0 %	383192370
75	NC_016819	G	6	6	62828	62833	0 %	0 %	100 %	0 %	383192371
76	NC_016819	T	6	6	63305	63310	0 %	100 %	0 %	0 %	383192372
77	NC_016819	T	6	6	64289	64294	0 %	100 %	0 %	0 %	383192372
78	NC_016819	G	6	6	65101	65106	0 %	0 %	100 %	0 %	383192372
79	NC_016819	A	6	6	65746	65751	100 %	0 %	0 %	0 %	383192372
80	NC_016819	A	6	6	65862	65867	100 %	0 %	0 %	0 %	383192372
81	NC_016819	T	6	6	65914	65919	0 %	100 %	0 %	0 %	383192372
82	NC_016819	A	6	6	66555	66560	100 %	0 %	0 %	0 %	383192373
83	NC_016819	A	6	6	66906	66911	100 %	0 %	0 %	0 %	383192373
84	NC_016819	C	6	6	68212	68217	0 %	0 %	0 %	100 %	383192375
85	NC_016819	A	6	6	70574	70579	100 %	0 %	0 %	0 %	383192378
86	NC_016819	A	6	6	71106	71111	100 %	0 %	0 %	0 %	383192378
87	NC_016819	A	6	6	71604	71609	100 %	0 %	0 %	0 %	383192378
88	NC_016819	T	6	6	73551	73556	0 %	100 %	0 %	0 %	383192379
89	NC_016819	G	6	6	74209	74214	0 %	0 %	100 %	0 %	383192380
90	NC_016819	T	7	7	74254	74260	0 %	100 %	0 %	0 %	383192380
91	NC_016819	T	6	6	75884	75889	0 %	100 %	0 %	0 %	383192381
92	NC_016819	A	6	6	76542	76547	100 %	0 %	0 %	0 %	383192382
93	NC_016819	A	6	6	76936	76941	100 %	0 %	0 %	0 %	383192383
94	NC_016819	A	6	6	76949	76954	100 %	0 %	0 %	0 %	383192383
95	NC_016819	A	6	6	77002	77007	100 %	0 %	0 %	0 %	383192383
96	NC_016819	T	7	7	80692	80698	0 %	100 %	0 %	0 %	383192386
97	NC_016819	A	7	7	80828	80834	100 %	0 %	0 %	0 %	383192386
98	NC_016819	T	6	6	81251	81256	0 %	100 %	0 %	0 %	383192386
99	NC_016819	C	6	6	81484	81489	0 %	0 %	0 %	100 %	383192387
100	NC_016819	T	6	6	83017	83022	0 %	100 %	0 %	0 %	383192389
101	NC_016819	T	6	6	83270	83275	0 %	100 %	0 %	0 %	383192389
102	NC_016819	A	6	6	83277	83282	100 %	0 %	0 %	0 %	383192389
103	NC_016819	T	6	6	84537	84542	0 %	100 %	0 %	0 %	383192390
104	NC_016819	A	7	7	85108	85114	100 %	0 %	0 %	0 %	383192391
105	NC_016819	T	6	6	85699	85704	0 %	100 %	0 %	0 %	383192392
106	NC_016819	C	6	6	85992	85997	0 %	0 %	0 %	100 %	383192392
107	NC_016819	G	6	6	88285	88290	0 %	0 %	100 %	0 %	383192394
108	NC_016819	A	8	8	91624	91631	100 %	0 %	0 %	0 %	383192397
109	NC_016819	A	6	6	94987	94992	100 %	0 %	0 %	0 %	383192397
110	NC_016819	T	8	8	95089	95096	0 %	100 %	0 %	0 %	383192398
111	NC_016819	T	6	6	97148	97153	0 %	100 %	0 %	0 %	383192400
112	NC_016819	T	6	6	99157	99162	0 %	100 %	0 %	0 %	383192401
113	NC_016819	A	6	6	100167	100172	100 %	0 %	0 %	0 %	383192402
114	NC_016819	T	6	6	103839	103844	0 %	100 %	0 %	0 %	383192406
115	NC_016819	T	6	6	105522	105527	0 %	100 %	0 %	0 %	383192408
116	NC_016819	T	6	6	105747	105752	0 %	100 %	0 %	0 %	383192408
117	NC_016819	A	7	7	106018	106024	100 %	0 %	0 %	0 %	383192408
118	NC_016819	C	6	6	106342	106347	0 %	0 %	0 %	100 %	383192409
119	NC_016819	T	6	6	106827	106832	0 %	100 %	0 %	0 %	383192410
120	NC_016819	T	7	7	107232	107238	0 %	100 %	0 %	0 %	383192411
121	NC_016819	T	6	6	112037	112042	0 %	100 %	0 %	0 %	383192415

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.