MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Rahnella aquatilis CIP 78.65 = ATCC 33071 chromosome

Total Repeats: 3111

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016818	CTTTT	2	10	452	461	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_016818	CTATC	2	10	852	861	20 %	40 %	0 %	40 %	383187968
3	NC_016818	GTTGC	2	10	4862	4871	0 %	40 %	40 %	20 %	383187971
4	NC_016818	CCGCG	2	10	6461	6470	0 %	0 %	40 %	60 %	383187971
5	NC_016818	AAAAG	2	10	10596	10605	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016818	TGGCT	2	10	11445	11454	0 %	40 %	40 %	20 %	383187978
7	NC_016818	GGCAG	2	10	11958	11967	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
8	NC_016818	TAATG	2	10	12161	12170	40 %	40 %	20 %	0 %	383187979
9	NC_016818	GGCGC	2	10	14218	14227	0 %	0 %	60 %	40 %	383187980
10	NC_016818	GGAAA	2	10	17976	17985	60 %	0 %	40 %	0 %	383187984
11	NC_016818	GAACA	2	10	18238	18247	60 %	0 %	20 %	20 %	383187984
12	NC_016818	TGCTG	2	10	19651	19660	0 %	40 %	40 %	20 %	383187985
13	NC_016818	GTGGC	2	10	19668	19677	0 %	20 %	60 %	20 %	383187985
14	NC_016818	AATGC	2	10	21891	21900	40 %	20 %	20 %	20 %	383187986
15	NC_016818	TCTGG	2	10	27345	27354	0 %	40 %	40 %	20 %	383187991
16	NC_016818	CAGCG	2	10	30580	30589	20 %	0 %	40 %	40 %	383187993
17	NC_016818	GTGCG	2	10	31519	31528	0 %	20 %	60 %	20 %	383187994
18	NC_016818	ACCAC	2	10	33656	33665	40 %	0 %	0 %	60 %	383187996
19	NC_016818	ATCCG	2	10	33906	33915	20 %	20 %	20 %	40 %	383187996
20	NC_016818	AAAAG	2	10	37206	37215	80 %	0 %	20 %	0 %	383188001
21	NC_016818	AGACG	2	10	37615	37624	40 %	0 %	40 %	20 %	383188001
22	NC_016818	AGAAA	2	10	38044	38053	80 %	0 %	20 %	0 %	383188001
23	NC_016818	GTGTA	2	10	38297	38306	20 %	40 %	40 %	0 %	383188001
24	NC_016818	TTTCC	2	10	38705	38714	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
25	NC_016818	TAAGC	2	10	42073	42082	40 %	20 %	20 %	20 %	383188003
26	NC_016818	TTCCA	2	10	43234	43243	20 %	40 %	0 %	40 %	383188006
27	NC_016818	CGGGC	2	10	43695	43704	0 %	0 %	60 %	40 %	383188006
28	NC_016818	TTTTG	2	10	47599	47608	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016818	CAGCG	2	10	51156	51165	20 %	0 %	40 %	40 %	383188013
30	NC_016818	AAGAA	2	10	51456	51465	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016818	GCCCG	2	10	53303	53312	0 %	0 %	40 %	60 %	383188015
32	NC_016818	GCTGG	2	10	55483	55492	0 %	20 %	60 %	20 %	383188016
33	NC_016818	GCAAT	2	10	57320	57329	40 %	20 %	20 %	20 %	383188017
34	NC_016818	GAATG	2	10	57467	57476	40 %	20 %	40 %	0 %	383188017
35	NC_016818	CTGCA	2	10	59502	59511	20 %	20 %	20 %	40 %	383188019
36	NC_016818	TCTGT	2	10	61221	61230	0 %	60 %	20 %	20 %	383188021
37	NC_016818	CACCG	2	10	66283	66292	20 %	0 %	20 %	60 %	383188025
38	NC_016818	CGAAT	2	10	67017	67026	40 %	20 %	20 %	20 %	383188025
39	NC_016818	GGTGA	2	10	67144	67153	20 %	20 %	60 %	0 %	383188025
40	NC_016818	ATGCG	2	10	72848	72857	20 %	20 %	40 %	20 %	383188030
41	NC_016818	TGGGT	2	10	74052	74061	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016818	GCGCC	2	10	81741	81750	0 %	0 %	40 %	60 %	383188039
43	NC_016818	CCACA	2	10	84154	84163	40 %	0 %	0 %	60 %	383188041
44	NC_016818	AAAAT	2	10	86675	86684	80 %	20 %	0 %	0 %	383188046
45	NC_016818	TGTTT	2	10	87155	87164	0 %	80 %	20 %	0 %	383188047
46	NC_016818	ACCAA	2	10	87366	87375	60 %	0 %	0 %	40 %	383188047
47	NC_016818	GCCAG	2	10	89199	89208	20 %	0 %	40 %	40 %	383188050
48	NC_016818	CAGAC	2	10	89297	89306	40 %	0 %	20 %	40 %	383188050
49	NC_016818	GGTTT	2	10	93025	93034	0 %	60 %	40 %	0 %	383188057
50	NC_016818	ATCGG	2	10	93181	93190	20 %	20 %	40 %	20 %	383188057
51	NC_016818	CGAGC	2	10	95188	95197	20 %	0 %	40 %	40 %	383188059
52	NC_016818	GCTTC	2	10	95697	95706	0 %	40 %	20 %	40 %	383188059
53	NC_016818	TGGGG	2	10	96004	96013	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016818	CAGCG	2	10	100615	100624	20 %	0 %	40 %	40 %	383188062
55	NC_016818	AAAAT	2	10	100972	100981	80 %	20 %	0 %	0 %	383188062
56	NC_016818	TGAAG	2	10	104185	104194	40 %	20 %	40 %	0 %	383188064
57	NC_016818	CTGGT	2	10	107285	107294	0 %	40 %	40 %	20 %	383188067
58	NC_016818	AAAGA	2	10	107609	107618	80 %	0 %	20 %	0 %	383188067
59	NC_016818	TGAGC	2	10	108713	108722	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
60	NC_016818	AGCGA	2	10	108885	108894	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
61	NC_016818	TTCTG	2	10	109039	109048	0 %	60 %	20 %	20 %	383188068
62	NC_016818	CTTCA	2	10	109939	109948	20 %	40 %	0 %	40 %	383188070
63	NC_016818	TGCCA	2	10	111616	111625	20 %	20 %	20 %	40 %	383188072
64	NC_016818	GCACG	2	10	111922	111931	20 %	0 %	40 %	40 %	383188072
65	NC_016818	AATCA	2	10	113207	113216	60 %	20 %	0 %	20 %	383188074
66	NC_016818	GGTCG	2	10	115724	115733	0 %	20 %	60 %	20 %	383188076
67	NC_016818	TGACC	2	10	116540	116549	20 %	20 %	20 %	40 %	383188077
68	NC_016818	TGGGG	2	10	117502	117511	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016818	GCCAC	2	10	119461	119470	20 %	0 %	20 %	60 %	383188079
70	NC_016818	CGGAA	2	10	119744	119753	40 %	0 %	40 %	20 %	383188079
71	NC_016818	ACACA	2	10	120890	120899	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
72	NC_016818	TGCTC	2	10	122621	122630	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
73	NC_016818	GCACA	2	10	125403	125412	40 %	0 %	20 %	40 %	383188083
74	NC_016818	GCGCC	2	10	125472	125481	0 %	0 %	40 %	60 %	383188083
75	NC_016818	CTGCG	2	10	125647	125656	0 %	20 %	40 %	40 %	383188083
76	NC_016818	CTTGT	2	10	127467	127476	0 %	60 %	20 %	20 %	383188086
77	NC_016818	TTTCA	2	10	127824	127833	20 %	60 %	0 %	20 %	383188086
78	NC_016818	CTGGT	2	10	128576	128585	0 %	40 %	40 %	20 %	383188087
79	NC_016818	CAGCG	2	10	129152	129161	20 %	0 %	40 %	40 %	383188088
80	NC_016818	GTGTG	2	10	129516	129525	0 %	40 %	60 %	0 %	383188088
81	NC_016818	GCTTT	2	10	129632	129641	0 %	60 %	20 %	20 %	383188089
82	NC_016818	AACGG	2	10	130053	130062	40 %	0 %	40 %	20 %	383188089
83	NC_016818	GACGT	2	10	130833	130842	20 %	20 %	40 %	20 %	383188089
84	NC_016818	ACCGT	2	10	131093	131102	20 %	20 %	20 %	40 %	383188089
85	NC_016818	GCCGC	2	10	132833	132842	0 %	0 %	40 %	60 %	383188089
86	NC_016818	GCGCG	2	10	134993	135002	0 %	0 %	60 %	40 %	383188090
87	NC_016818	CGGCG	2	10	136028	136037	0 %	0 %	60 %	40 %	383188090
88	NC_016818	GCGGT	2	10	137106	137115	0 %	20 %	60 %	20 %	383188091
89	NC_016818	CGGCG	2	10	139317	139326	0 %	0 %	60 %	40 %	383188093
90	NC_016818	TGCTG	2	10	141408	141417	0 %	40 %	40 %	20 %	383188094
91	NC_016818	ACCTG	2	10	143362	143371	20 %	20 %	20 %	40 %	383188095
92	NC_016818	CCCGG	2	10	145271	145280	0 %	0 %	40 %	60 %	383188096
93	NC_016818	TGGTG	2	10	145537	145546	0 %	40 %	60 %	0 %	383188096
94	NC_016818	TGGGG	2	10	145864	145873	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016818	CGTAA	2	10	146762	146771	40 %	20 %	20 %	20 %	383188097
96	NC_016818	GAAAG	2	10	146952	146961	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016818	GAATT	2	10	147780	147789	40 %	40 %	20 %	0 %	383188099
98	NC_016818	ACCTG	2	10	148426	148435	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
99	NC_016818	GCCGT	2	10	152072	152081	0 %	20 %	40 %	40 %	383188102
100	NC_016818	GCCGC	2	10	152462	152471	0 %	0 %	40 %	60 %	383188102
101	NC_016818	CGTTG	2	10	155591	155600	0 %	40 %	40 %	20 %	383188106
102	NC_016818	GCTTT	2	10	156206	156215	0 %	60 %	20 %	20 %	383188107
103	NC_016818	CGTCA	2	10	159662	159671	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
104	NC_016818	GCGCC	2	10	162535	162544	0 %	0 %	40 %	60 %	383188114
105	NC_016818	CGCGC	2	10	163322	163331	0 %	0 %	40 %	60 %	383188114
106	NC_016818	ACGGC	2	10	163942	163951	20 %	0 %	40 %	40 %	383188114
107	NC_016818	GACCG	2	10	166746	166755	20 %	0 %	40 %	40 %	383188119
108	NC_016818	AAAAT	2	10	167131	167140	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016818	TGGCG	2	10	167922	167931	0 %	20 %	60 %	20 %	383188121
110	NC_016818	TTCCC	2	10	169363	169372	0 %	40 %	0 %	60 %	383188122
111	NC_016818	TTGCC	2	10	170148	170157	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
112	NC_016818	CCAGC	2	10	173748	173757	20 %	0 %	20 %	60 %	383188124
113	NC_016818	GCATT	2	10	176324	176333	20 %	40 %	20 %	20 %	383188128
114	NC_016818	TGGGG	2	10	177097	177106	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016818	ATGAC	2	10	178984	178993	40 %	20 %	20 %	20 %	383188129
116	NC_016818	GCTTT	2	10	179614	179623	0 %	60 %	20 %	20 %	383188130
117	NC_016818	TGTTT	2	10	181149	181158	0 %	80 %	20 %	0 %	383188131
118	NC_016818	TCGGT	2	10	183191	183200	0 %	40 %	40 %	20 %	383188133
119	NC_016818	GTGAT	2	10	183302	183311	20 %	40 %	40 %	0 %	383188133
120	NC_016818	TGGCG	2	10	184152	184161	0 %	20 %	60 %	20 %	383188133
121	NC_016818	ATGCC	2	10	186591	186600	20 %	20 %	20 %	40 %	383188135
122	NC_016818	CAAAA	2	10	189411	189420	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_016818	GCGCC	2	10	189951	189960	0 %	0 %	40 %	60 %	383188140
124	NC_016818	CCGCA	2	10	191395	191404	20 %	0 %	20 %	60 %	383188141
125	NC_016818	CATAT	2	10	191797	191806	40 %	40 %	0 %	20 %	383188142
126	NC_016818	TAAAA	2	10	191988	191997	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_016818	AAACC	2	10	192454	192463	60 %	0 %	0 %	40 %	383188143
128	NC_016818	CGGCA	2	10	193435	193444	20 %	0 %	40 %	40 %	383188144
129	NC_016818	GTGCG	2	10	195010	195019	0 %	20 %	60 %	20 %	383188146
130	NC_016818	CGGTG	2	10	196560	196569	0 %	20 %	60 %	20 %	383188147
131	NC_016818	AGGCG	2	10	198427	198436	20 %	0 %	60 %	20 %	383188149
132	NC_016818	CCCCA	2	10	199754	199763	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
133	NC_016818	ATGCT	2	10	206564	206573	20 %	40 %	20 %	20 %	383188156
134	NC_016818	CCATG	2	10	209472	209481	20 %	20 %	20 %	40 %	383188161
135	NC_016818	AGAAC	2	10	210833	210842	60 %	0 %	20 %	20 %	383188161
136	NC_016818	GGGGA	2	10	210962	210971	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
137	NC_016818	CCGGC	2	10	211926	211935	0 %	0 %	40 %	60 %	383188162
138	NC_016818	CGGCC	2	10	213541	213550	0 %	0 %	40 %	60 %	383188164
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140	NC_016818	CCGGC	2	10	218054	218063	0 %	0 %	40 %	60 %	383188167
141	NC_016818	AATGT	2	10	220144	220153	40 %	40 %	20 %	0 %	383188170
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145	NC_016818	TCACT	2	10	221889	221898	20 %	40 %	0 %	40 %	383188171
146	NC_016818	GACTA	2	10	223974	223983	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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150	NC_016818	CGATC	2	10	227072	227081	20 %	20 %	20 %	40 %	383188175
151	NC_016818	CTGGG	2	10	227838	227847	0 %	20 %	60 %	20 %	383188175
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154	NC_016818	TGCGA	2	10	229859	229868	20 %	20 %	40 %	20 %	383188177
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246	NC_016818	GTTCT	2	10	366735	366744	0 %	60 %	20 %	20 %	383188298
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249	NC_016818	ATGAA	2	10	373107	373116	60 %	20 %	20 %	0 %	383188302
250	NC_016818	AACTG	2	10	373363	373372	40 %	20 %	20 %	20 %	383188302
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252	NC_016818	TGCGC	2	10	377226	377235	0 %	20 %	40 %	40 %	383188307
253	NC_016818	ATTTG	2	10	377776	377785	20 %	60 %	20 %	0 %	383188308
254	NC_016818	CTTTT	2	10	384015	384024	0 %	80 %	0 %	20 %	383188314
255	NC_016818	TGATT	2	10	386101	386110	20 %	60 %	20 %	0 %	383188315
256	NC_016818	GAAGA	2	10	386712	386721	60 %	0 %	40 %	0 %	383188316
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258	NC_016818	GGAAT	2	10	387955	387964	40 %	20 %	40 %	0 %	383188319
259	NC_016818	GTAAA	2	10	392549	392558	60 %	20 %	20 %	0 %	383188329
260	NC_016818	TGCAG	2	10	397595	397604	20 %	20 %	40 %	20 %	383188339
261	NC_016818	TTGGG	2	10	398279	398288	0 %	40 %	60 %	0 %	383188341
262	NC_016818	GCGCT	2	10	398359	398368	0 %	20 %	40 %	40 %	383188341
263	NC_016818	GCCCC	2	10	403103	403112	0 %	0 %	20 %	80 %	383188349
264	NC_016818	GAAAA	2	10	408976	408985	80 %	0 %	20 %	0 %	383188355
265	NC_016818	TCGGG	2	10	411098	411107	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
266	NC_016818	AGGCT	2	10	415120	415129	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
267	NC_016818	CTTTT	2	10	417240	417249	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
268	NC_016818	TTAAA	2	10	421640	421649	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
269	NC_016818	TTTTA	2	10	425316	425325	20 %	80 %	0 %	0 %	383188364
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284	NC_016818	CTTTT	2	10	449702	449711	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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392	NC_016818	CAGTT	2	10	635357	635366	20 %	40 %	20 %	20 %	383188542
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395	NC_016818	TCAGG	2	10	641673	641682	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
396	NC_016818	CCCCA	2	10	641956	641965	20 %	0 %	0 %	80 %	383188547
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