MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Rahnella aquatilis CIP 78.65 = ATCC 33071 chromosome

Total Repeats: 546

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016818	CTTTT	2	10	452	461	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_016818	AAAAG	2	10	10596	10605	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016818	GGCAG	2	10	11958	11967	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
4	NC_016818	TTTCC	2	10	38705	38714	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
5	NC_016818	TTTTG	2	10	47599	47608	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016818	AAGAA	2	10	51456	51465	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016818	TGGGT	2	10	74052	74061	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016818	TGGGG	2	10	96004	96013	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016818	TGAGC	2	10	108713	108722	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
10	NC_016818	AGCGA	2	10	108885	108894	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
11	NC_016818	TGGGG	2	10	117502	117511	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016818	ACACA	2	10	120890	120899	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
13	NC_016818	TGCTC	2	10	122621	122630	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
14	NC_016818	TGGGG	2	10	145864	145873	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016818	GAAAG	2	10	146952	146961	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016818	ACCTG	2	10	148426	148435	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
17	NC_016818	CGTCA	2	10	159662	159671	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
18	NC_016818	AAAAT	2	10	167131	167140	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016818	TTGCC	2	10	170148	170157	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
20	NC_016818	TGGGG	2	10	177097	177106	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016818	CAAAA	2	10	189411	189420	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_016818	TAAAA	2	10	191988	191997	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016818	CCCCA	2	10	199754	199763	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
24	NC_016818	GGGGA	2	10	210962	210971	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016818	GACTA	2	10	223974	223983	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_016818	TGAAC	2	10	231641	231650	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
27	NC_016818	TGGGG	2	10	247122	247131	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016818	AGGGA	2	10	252671	252680	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016818	TCCCC	2	10	259718	259727	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
30	NC_016818	AAAAG	2	10	279502	279511	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016818	TAACT	2	10	296527	296536	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_016818	TCATT	2	10	296688	296697	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_016818	GGCGG	2	10	313151	313160	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
34	NC_016818	AAATG	2	10	326157	326166	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016818	GTTCT	2	10	334223	334232	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
36	NC_016818	TCGGG	2	10	411098	411107	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
37	NC_016818	AGGCT	2	10	415120	415129	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
38	NC_016818	CTTTT	2	10	417240	417249	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_016818	TTAAA	2	10	421640	421649	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016818	TCATG	2	10	428507	428516	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
41	NC_016818	TCAAT	2	10	429781	429790	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_016818	GCAGA	2	10	435361	435370	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
43	NC_016818	CTTTT	2	10	449702	449711	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_016818	CTTCG	2	10	502513	502522	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
45	NC_016818	CCTGG	2	10	514002	514011	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
46	NC_016818	TTTGA	2	10	540112	540121	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016818	AGCTA	2	10	551703	551712	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
48	NC_016818	TTGGG	2	10	570967	570976	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016818	TTTAT	2	10	578445	578454	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016818	AGCGT	2	10	579629	579638	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
51	NC_016818	GAGTT	2	10	579685	579694	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016818	TTTAA	2	10	604802	604811	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016818	GATGA	2	10	607308	607317	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016818	ATCGA	2	10	607598	607607	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
55	NC_016818	AATTC	2	10	607656	607665	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_016818	ATTTT	2	10	613982	613991	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016818	AATCC	2	10	627364	627373	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
58	NC_016818	ACCCC	2	10	631482	631491	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
59	NC_016818	TCAGG	2	10	641673	641682	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
60	NC_016818	AGGGA	2	10	664193	664202	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016818	GGGCC	2	10	664410	664419	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
62	NC_016818	AATTA	2	10	665391	665400	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016818	AGGGT	2	10	675777	675786	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016818	GATTT	2	10	683224	683233	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016818	CTTTT	2	10	684734	684743	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_016818	TGCTC	2	10	686471	686480	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
67	NC_016818	GTTTT	2	10	701440	701449	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016818	GCGCG	2	10	708276	708285	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
69	NC_016818	TTAAC	2	10	708309	708318	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_016818	AATCA	2	10	713170	713179	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_016818	TATTT	2	10	719768	719777	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016818	CCTGT	2	10	721139	721148	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
73	NC_016818	CTTTT	2	10	727626	727635	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_016818	AACCT	2	10	728803	728812	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
75	NC_016818	GTTCA	2	10	751811	751820	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
76	NC_016818	GTTTT	2	10	762890	762899	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016818	TTATC	2	10	769641	769650	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_016818	GGCGA	2	10	773601	773610	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
79	NC_016818	TGTGC	2	10	773993	774002	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
80	NC_016818	GGGCG	2	10	794839	794848	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
81	NC_016818	TACAT	2	10	797801	797810	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_016818	AGGCT	2	10	812431	812440	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
83	NC_016818	CTGAA	2	10	826971	826980	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
84	NC_016818	AGGTT	2	10	841116	841125	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
85	NC_016818	CTTCC	2	10	847259	847268	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
86	NC_016818	CAGAT	2	10	853483	853492	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
87	NC_016818	CAAAA	2	10	853500	853509	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_016818	CACAT	2	10	857680	857689	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
89	NC_016818	CGCTC	2	10	865994	866003	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
90	NC_016818	TTTGA	2	10	867428	867437	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016818	AACCA	2	10	870498	870507	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
92	NC_016818	AACTG	2	10	874699	874708	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
93	NC_016818	TGGGG	2	10	876700	876709	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016818	GTCGC	2	10	877069	877078	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
95	NC_016818	TTAAG	2	10	893074	893083	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016818	GTGCA	2	10	901223	901232	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
97	NC_016818	ACCCC	2	10	906852	906861	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
98	NC_016818	ACCCC	2	10	912702	912711	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
99	NC_016818	CGCCC	2	10	918914	918923	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
100	NC_016818	AGATG	2	10	938048	938057	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
101	NC_016818	CGATT	2	10	942141	942150	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
102	NC_016818	TTAGG	2	10	976879	976888	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016818	TCCTT	2	10	999734	999743	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
104	NC_016818	ATAAA	2	10	1002381	1002390	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016818	AGGCT	2	10	1006063	1006072	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
106	NC_016818	TGGGG	2	10	1035924	1035933	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016818	TTCAC	2	10	1036463	1036472	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
108	NC_016818	CGTTG	2	10	1040947	1040956	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
109	NC_016818	GAAGC	2	10	1049335	1049344	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
110	NC_016818	AAATT	2	10	1055620	1055629	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016818	AATTT	2	10	1059039	1059048	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016818	ACCCC	2	10	1066915	1066924	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
113	NC_016818	CTTTT	2	10	1094904	1094913	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_016818	ATCCA	2	10	1114564	1114573	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
115	NC_016818	TAAAA	2	10	1125824	1125833	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016818	TTTTC	2	10	1134257	1134266	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_016818	TGTTT	2	10	1147721	1147730	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016818	ATTAA	2	10	1147858	1147867	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016818	GTCAG	2	10	1148496	1148505	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
120	NC_016818	TTTAC	2	10	1184592	1184601	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_016818	AAAAC	2	10	1188531	1188540	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_016818	AAAAG	2	10	1192492	1192501	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_016818	GGGAC	2	10	1200960	1200969	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
124	NC_016818	TGCCT	2	10	1212796	1212805	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
125	NC_016818	GCAGG	2	10	1239821	1239830	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
126	NC_016818	GCATG	2	10	1239993	1240002	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
127	NC_016818	GCATG	2	10	1240140	1240149	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
128	NC_016818	TGGGG	2	10	1251604	1251613	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016818	TGAAC	2	10	1251695	1251704	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
130	NC_016818	GTTCA	2	10	1253099	1253108	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
131	NC_016818	TGGGG	2	10	1253198	1253207	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
132	NC_016818	AAGGG	2	10	1253289	1253298	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
133	NC_016818	CGGTG	2	10	1254104	1254113	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
134	NC_016818	CCCTG	2	10	1262881	1262890	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
135	NC_016818	ATTTT	2	10	1262950	1262959	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_016818	TGGGG	2	10	1268581	1268590	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
137	NC_016818	ATTTT	2	10	1271563	1271572	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_016818	ATGTC	2	10	1271606	1271615	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
139	NC_016818	TAAGT	2	10	1280012	1280021	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_016818	AGAAA	2	10	1304040	1304049	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_016818	CGTCA	2	10	1337259	1337268	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
142	NC_016818	ACCCC	2	10	1345595	1345604	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
143	NC_016818	TGGGG	2	10	1355114	1355123	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
144	NC_016818	ACAAA	2	10	1363394	1363403	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
145	NC_016818	CGGGG	2	10	1375171	1375180	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
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147	NC_016818	TTCAT	2	10	1401042	1401051	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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149	NC_016818	CTGAA	2	10	1403190	1403199	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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189	NC_016818	CGGGG	2	10	1863156	1863165	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
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281	NC_016818	CATGC	2	10	2701924	2701933	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
282	NC_016818	ACCCC	2	10	2715378	2715387	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
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285	NC_016818	TTATT	2	10	2725281	2725290	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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419	NC_016818	GTTAA	2	10	3700890	3700899	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
420	NC_016818	GGTTT	2	10	3739752	3739761	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
421	NC_016818	TAATT	2	10	3745496	3745505	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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467	NC_016818	TTTAT	2	10	4149569	4149578	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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500	NC_016818	GGCAA	2	10	4406384	4406393	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding

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