MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Rahnella aquatilis CIP 78.65 = ATCC 33071 chromosome

Total Repeats: 10196

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016818	GCTT	2	8	670	677	0 %	50 %	25 %	25 %	383187968
2	NC_016818	GTCA	2	8	747	754	25 %	25 %	25 %	25 %	383187968
3	NC_016818	CAGC	2	8	763	770	25 %	0 %	25 %	50 %	383187968
4	NC_016818	TGCA	2	8	1021	1028	25 %	25 %	25 %	25 %	383187968
5	NC_016818	TTCG	2	8	1548	1555	0 %	50 %	25 %	25 %	383187968
6	NC_016818	GCCC	2	8	1686	1693	0 %	0 %	25 %	75 %	383187968
7	NC_016818	ACCA	2	8	1728	1735	50 %	0 %	0 %	50 %	383187968
8	NC_016818	CGTT	2	8	2334	2341	0 %	50 %	25 %	25 %	383187969
9	NC_016818	CGAC	2	8	2396	2403	25 %	0 %	25 %	50 %	383187969
10	NC_016818	GCGT	2	8	2723	2730	0 %	25 %	50 %	25 %	383187969
11	NC_016818	GGTC	2	8	3078	3085	0 %	25 %	50 %	25 %	383187970
12	NC_016818	TTTC	2	8	3650	3657	0 %	75 %	0 %	25 %	383187970
13	NC_016818	GCGG	2	8	3875	3882	0 %	0 %	75 %	25 %	383187970
14	NC_016818	CCGA	2	8	3926	3933	25 %	0 %	25 %	50 %	383187970
15	NC_016818	CTGG	2	8	5300	5307	0 %	25 %	50 %	25 %	383187971
16	NC_016818	GCGG	2	8	5384	5391	0 %	0 %	75 %	25 %	383187971
17	NC_016818	TGGA	2	8	5987	5994	25 %	25 %	50 %	0 %	383187971
18	NC_016818	CGTG	2	8	6052	6059	0 %	25 %	50 %	25 %	383187971
19	NC_016818	AATT	2	8	6684	6691	50 %	50 %	0 %	0 %	383187972
20	NC_016818	ATGG	2	8	6701	6708	25 %	25 %	50 %	0 %	383187972
21	NC_016818	CAGT	2	8	7583	7590	25 %	25 %	25 %	25 %	383187973
22	NC_016818	GCCC	2	8	7736	7743	0 %	0 %	25 %	75 %	383187973
23	NC_016818	TGGG	2	8	8157	8164	0 %	25 %	75 %	0 %	383187973
24	NC_016818	CTGC	2	8	8343	8350	0 %	25 %	25 %	50 %	383187973
25	NC_016818	CGGA	2	8	8575	8582	25 %	0 %	50 %	25 %	383187973
26	NC_016818	TTTA	2	8	9630	9637	25 %	75 %	0 %	0 %	383187975
27	NC_016818	GTTG	2	8	9693	9700	0 %	50 %	50 %	0 %	383187975
28	NC_016818	TTCT	2	8	11640	11647	0 %	75 %	0 %	25 %	383187978
29	NC_016818	TCAT	2	8	11836	11843	25 %	50 %	0 %	25 %	383187978
30	NC_016818	GGCG	2	8	12203	12210	0 %	0 %	75 %	25 %	383187979
31	NC_016818	ATTG	2	8	12770	12777	25 %	50 %	25 %	0 %	383187979
32	NC_016818	CTTC	2	8	13005	13012	0 %	50 %	0 %	50 %	383187979
33	NC_016818	GAAA	2	8	13094	13101	75 %	0 %	25 %	0 %	383187979
34	NC_016818	ATTT	2	8	13437	13444	25 %	75 %	0 %	0 %	383187980
35	NC_016818	GCAG	2	8	13517	13524	25 %	0 %	50 %	25 %	383187980
36	NC_016818	GCTG	2	8	13879	13886	0 %	25 %	50 %	25 %	383187980
37	NC_016818	CAGC	2	8	15109	15116	25 %	0 %	25 %	50 %	383187981
38	NC_016818	GCCA	2	8	15204	15211	25 %	0 %	25 %	50 %	383187981
39	NC_016818	AGGC	2	8	15839	15846	25 %	0 %	50 %	25 %	383187982
40	NC_016818	GTCA	2	8	16763	16770	25 %	25 %	25 %	25 %	383187983
41	NC_016818	CGCC	2	8	16864	16871	0 %	0 %	25 %	75 %	383187983
42	NC_016818	GCGA	2	8	16949	16956	25 %	0 %	50 %	25 %	383187983
43	NC_016818	TCAA	2	8	17277	17284	50 %	25 %	0 %	25 %	383187983
44	NC_016818	TCCT	2	8	17444	17451	0 %	50 %	0 %	50 %	383187983
45	NC_016818	AGAA	2	8	19021	19028	75 %	0 %	25 %	0 %	383187984
46	NC_016818	GCCA	2	8	19233	19240	25 %	0 %	25 %	50 %	383187985
47	NC_016818	GCTG	2	8	19417	19424	0 %	25 %	50 %	25 %	383187985
48	NC_016818	AAAT	2	8	20376	20383	75 %	25 %	0 %	0 %	383187985
49	NC_016818	TGCG	2	8	20769	20776	0 %	25 %	50 %	25 %	383187985
50	NC_016818	CGCC	2	8	21451	21458	0 %	0 %	25 %	75 %	383187986
51	NC_016818	GTAC	2	8	22640	22647	25 %	25 %	25 %	25 %	383187987
52	NC_016818	CTTT	2	8	23973	23980	0 %	75 %	0 %	25 %	383187989
53	NC_016818	GGCA	2	8	24629	24636	25 %	0 %	50 %	25 %	383187990
54	NC_016818	GTGA	2	8	25092	25099	25 %	25 %	50 %	0 %	383187990
55	NC_016818	GGCG	2	8	25391	25398	0 %	0 %	75 %	25 %	383187990
56	NC_016818	GTCC	2	8	25855	25862	0 %	25 %	25 %	50 %	383187990
57	NC_016818	GGAT	2	8	25909	25916	25 %	25 %	50 %	0 %	383187990
58	NC_016818	GCTC	2	8	26083	26090	0 %	25 %	25 %	50 %	383187990
59	NC_016818	ACGG	2	8	26154	26161	25 %	0 %	50 %	25 %	383187990
60	NC_016818	TGGC	2	8	26345	26352	0 %	25 %	50 %	25 %	383187990
61	NC_016818	ACTT	2	8	27235	27242	25 %	50 %	0 %	25 %	383187991
62	NC_016818	ACCG	2	8	28816	28823	25 %	0 %	25 %	50 %	383187992
63	NC_016818	CTGG	2	8	28838	28845	0 %	25 %	50 %	25 %	383187992
64	NC_016818	GAAC	2	8	29013	29020	50 %	0 %	25 %	25 %	383187992
65	NC_016818	GCTG	2	8	29457	29464	0 %	25 %	50 %	25 %	383187992
66	NC_016818	GATG	2	8	29694	29701	25 %	25 %	50 %	0 %	383187992
67	NC_016818	GCTG	2	8	30287	30294	0 %	25 %	50 %	25 %	383187993
68	NC_016818	GAAA	2	8	31406	31413	75 %	0 %	25 %	0 %	383187994
69	NC_016818	AATT	2	8	31722	31729	50 %	50 %	0 %	0 %	383187994
70	NC_016818	TATT	2	8	31955	31962	25 %	75 %	0 %	0 %	383187995
71	NC_016818	ATTT	2	8	32420	32427	25 %	75 %	0 %	0 %	383187995
72	NC_016818	CATT	2	8	32527	32534	25 %	50 %	0 %	25 %	383187995
73	NC_016818	GCGG	2	8	32606	32613	0 %	0 %	75 %	25 %	383187995
74	NC_016818	GCGG	2	8	33700	33707	0 %	0 %	75 %	25 %	383187996
75	NC_016818	TTGC	2	8	33718	33725	0 %	50 %	25 %	25 %	383187996
76	NC_016818	GGCT	2	8	33821	33828	0 %	25 %	50 %	25 %	383187996
77	NC_016818	TTAT	2	8	34274	34281	25 %	75 %	0 %	0 %	383187996
78	NC_016818	TTCC	2	8	34600	34607	0 %	50 %	0 %	50 %	383187997
79	NC_016818	ATGG	2	8	35234	35241	25 %	25 %	50 %	0 %	383187998
80	NC_016818	CTGG	2	8	35260	35267	0 %	25 %	50 %	25 %	383187998
81	NC_016818	CTGA	2	8	35546	35553	25 %	25 %	25 %	25 %	383187998
82	NC_016818	GTCA	2	8	35981	35988	25 %	25 %	25 %	25 %	383187999
83	NC_016818	GAAA	2	8	36286	36293	75 %	0 %	25 %	0 %	383187999
84	NC_016818	TGAT	2	8	36938	36945	25 %	50 %	25 %	0 %	383188000
85	NC_016818	AATT	2	8	37157	37164	50 %	50 %	0 %	0 %	383188001
86	NC_016818	AATT	2	8	37310	37317	50 %	50 %	0 %	0 %	383188001
87	NC_016818	AGAA	2	8	37596	37603	75 %	0 %	25 %	0 %	383188001
88	NC_016818	GGTA	2	8	38220	38227	25 %	25 %	50 %	0 %	383188001
89	NC_016818	GCGG	2	8	39850	39857	0 %	0 %	75 %	25 %	383188002
90	NC_016818	ATTT	2	8	39895	39902	25 %	75 %	0 %	0 %	383188002
91	NC_016818	TGGC	2	8	40229	40236	0 %	25 %	50 %	25 %	383188002
92	NC_016818	CCTG	2	8	40377	40384	0 %	25 %	25 %	50 %	383188002
93	NC_016818	CTGA	2	8	40417	40424	25 %	25 %	25 %	25 %	383188002
94	NC_016818	AGCC	2	8	40530	40537	25 %	0 %	25 %	50 %	383188002
95	NC_016818	CAGT	2	8	41557	41564	25 %	25 %	25 %	25 %	383188003
96	NC_016818	AAAG	2	8	42360	42367	75 %	0 %	25 %	0 %	383188004
97	NC_016818	AAAT	2	8	43005	43012	75 %	25 %	0 %	0 %	383188004
98	NC_016818	GTTG	2	8	43041	43048	0 %	50 %	50 %	0 %	383188005
99	NC_016818	ACTT	2	8	43067	43074	25 %	50 %	0 %	25 %	383188005
100	NC_016818	TGAC	2	8	43897	43904	25 %	25 %	25 %	25 %	383188007
101	NC_016818	CCGT	2	8	43998	44005	0 %	25 %	25 %	50 %	383188007
102	NC_016818	GTCA	2	8	44027	44034	25 %	25 %	25 %	25 %	383188007
103	NC_016818	ATAA	2	8	45382	45389	75 %	25 %	0 %	0 %	383188007
104	NC_016818	GGAT	2	8	45419	45426	25 %	25 %	50 %	0 %	383188008
105	NC_016818	CTGC	2	8	45443	45450	0 %	25 %	25 %	50 %	383188008
106	NC_016818	TGCC	2	8	45578	45585	0 %	25 %	25 %	50 %	383188008
107	NC_016818	GCCA	2	8	46052	46059	25 %	0 %	25 %	50 %	383188009
108	NC_016818	GAAA	2	8	46069	46076	75 %	0 %	25 %	0 %	383188009
109	NC_016818	AAGA	2	8	46175	46182	75 %	0 %	25 %	0 %	383188009
110	NC_016818	ATGC	2	8	46454	46461	25 %	25 %	25 %	25 %	383188010
111	NC_016818	CTTT	2	8	46473	46480	0 %	75 %	0 %	25 %	383188010
112	NC_016818	CTGC	2	8	48574	48581	0 %	25 %	25 %	50 %	383188012
113	NC_016818	CTGC	2	8	48868	48875	0 %	25 %	25 %	50 %	383188012
114	NC_016818	TTTG	2	8	50143	50150	0 %	75 %	25 %	0 %	383188012
115	NC_016818	CTGA	2	8	50252	50259	25 %	25 %	25 %	25 %	383188012
116	NC_016818	CAGG	2	8	51143	51150	25 %	0 %	50 %	25 %	383188013
117	NC_016818	GTCA	2	8	52218	52225	25 %	25 %	25 %	25 %	383188014
118	NC_016818	CATT	2	8	52793	52800	25 %	50 %	0 %	25 %	383188014
119	NC_016818	CGTG	2	8	53583	53590	0 %	25 %	50 %	25 %	383188015
120	NC_016818	GCGG	2	8	53691	53698	0 %	0 %	75 %	25 %	383188015
121	NC_016818	GCTC	2	8	54040	54047	0 %	25 %	25 %	50 %	383188015
122	NC_016818	TACT	2	8	54406	54413	25 %	50 %	0 %	25 %	383188016
123	NC_016818	GCTG	2	8	54726	54733	0 %	25 %	50 %	25 %	383188016
124	NC_016818	GCTG	2	8	56148	56155	0 %	25 %	50 %	25 %	383188016
125	NC_016818	AGAA	2	8	56250	56257	75 %	0 %	25 %	0 %	383188016
126	NC_016818	CAAC	2	8	57354	57361	50 %	0 %	0 %	50 %	383188017
127	NC_016818	GCTG	2	8	58093	58100	0 %	25 %	50 %	25 %	383188017
128	NC_016818	GGAA	2	8	58192	58199	50 %	0 %	50 %	0 %	383188017
129	NC_016818	TGTT	2	8	58415	58422	0 %	75 %	25 %	0 %	383188018
130	NC_016818	ACCA	2	8	58513	58520	50 %	0 %	0 %	50 %	383188018
131	NC_016818	TGCG	2	8	58993	59000	0 %	25 %	50 %	25 %	383188019
132	NC_016818	CGGG	2	8	59399	59406	0 %	0 %	75 %	25 %	383188019
133	NC_016818	GCGT	2	8	61027	61034	0 %	25 %	50 %	25 %	383188021
134	NC_016818	CTGC	2	8	61257	61264	0 %	25 %	25 %	50 %	383188021
135	NC_016818	GCGG	2	8	61290	61297	0 %	0 %	75 %	25 %	383188021
136	NC_016818	ATCT	2	8	61568	61575	25 %	50 %	0 %	25 %	383188021
137	NC_016818	AAGA	2	8	61713	61720	75 %	0 %	25 %	0 %	383188021
138	NC_016818	GGGC	2	8	61927	61934	0 %	0 %	75 %	25 %	383188021
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