MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Rahnella aquatilis CIP 78.65 = ATCC 33071 chromosome

Total Repeats: 62087

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016818	TGC	2	6	221	226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383187967
2	NC_016818	GGA	2	6	261	266	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383187967
3	NC_016818	CGC	2	6	366	371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383187967
4	NC_016818	GTG	2	6	379	384	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383187967
5	NC_016818	CCG	2	6	484	489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383187968
6	NC_016818	GCA	2	6	506	511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383187968
7	NC_016818	TGC	2	6	706	711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383187968
8	NC_016818	GCA	2	6	724	729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383187968
9	NC_016818	GCG	3	9	930	938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383187968
10	NC_016818	TGG	2	6	989	994	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383187968
11	NC_016818	CAT	2	6	1040	1045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383187968
12	NC_016818	GTG	2	6	1068	1073	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383187968
13	NC_016818	AAC	2	6	1122	1127	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383187968
14	NC_016818	TAC	2	6	1149	1154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383187968
15	NC_016818	TAA	2	6	1199	1204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383187968
16	NC_016818	GAA	2	6	1218	1223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383187968
17	NC_016818	TTC	2	6	1224	1229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383187968
18	NC_016818	CTG	2	6	1245	1250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383187968
19	NC_016818	CAG	2	6	1260	1265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383187968
20	NC_016818	ATC	2	6	1266	1271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383187968
21	NC_016818	GCC	2	6	1361	1366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383187968
22	NC_016818	TGA	2	6	1393	1398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383187968
23	NC_016818	CTT	2	6	1442	1447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383187968
24	NC_016818	ATA	2	6	1606	1611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383187968
25	NC_016818	GGT	2	6	1764	1769	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383187968
26	NC_016818	GAA	2	6	1821	1826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383187968
27	NC_016818	AGA	2	6	1841	1846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383187968
28	NC_016818	TTG	2	6	1895	1900	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383187969
29	NC_016818	GAC	2	6	1952	1957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383187969
30	NC_016818	TTA	2	6	1984	1989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383187969
31	NC_016818	TGG	2	6	2042	2047	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383187969
32	NC_016818	CCA	2	6	2084	2089	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383187969
33	NC_016818	CGA	2	6	2241	2246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383187969
34	NC_016818	ATT	2	6	2342	2347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383187969
35	NC_016818	GCT	2	6	2499	2504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383187969
36	NC_016818	CGG	2	6	2508	2513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383187969
37	NC_016818	GCA	2	6	2540	2545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383187969
38	NC_016818	CGC	2	6	2617	2622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383187969
39	NC_016818	GAA	2	6	2782	2787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383187969
40	NC_016818	AGA	2	6	2790	2795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383187969
41	NC_016818	TCT	2	6	2895	2900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383187969
42	NC_016818	TGC	2	6	2937	2942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383187969
43	NC_016818	GCG	2	6	2953	2958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383187969
44	NC_016818	GGC	2	6	3039	3044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383187970
45	NC_016818	CGG	2	6	3222	3227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383187970
46	NC_016818	TGC	2	6	3329	3334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383187970
47	NC_016818	CGG	2	6	3391	3396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383187970
48	NC_016818	GTT	2	6	3413	3418	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383187970
49	NC_016818	TCA	2	6	3420	3425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383187970
50	NC_016818	AGC	2	6	3473	3478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383187970
51	NC_016818	CGC	2	6	3483	3488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383187970
52	NC_016818	TCT	2	6	3894	3899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383187970
53	NC_016818	ATG	2	6	4015	4020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383187970
54	NC_016818	CTC	2	6	4120	4125	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383187971
55	NC_016818	CAC	2	6	4211	4216	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383187971
56	NC_016818	CGA	2	6	4246	4251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383187971
57	NC_016818	GAT	2	6	4319	4324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383187971
58	NC_016818	GAA	2	6	4352	4357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383187971
59	NC_016818	CTG	2	6	4368	4373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383187971
60	NC_016818	TCA	2	6	4380	4385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383187971
61	NC_016818	TTC	2	6	4392	4397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383187971
62	NC_016818	CGA	2	6	4414	4419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383187971
63	NC_016818	CGG	2	6	4438	4443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383187971
64	NC_016818	CGT	2	6	4465	4470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383187971
65	NC_016818	CCG	2	6	4504	4509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383187971
66	NC_016818	CAC	2	6	4594	4599	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383187971
67	NC_016818	CTG	2	6	4715	4720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383187971
68	NC_016818	ATG	2	6	4878	4883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383187971
69	NC_016818	CAA	2	6	4912	4917	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383187971
70	NC_016818	AAG	2	6	4998	5003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383187971
71	NC_016818	TGT	2	6	5065	5070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383187971
72	NC_016818	TCT	2	6	5126	5131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383187971
73	NC_016818	TGA	2	6	5157	5162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383187971
74	NC_016818	TGG	2	6	5172	5177	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383187971
75	NC_016818	ATC	2	6	5225	5230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383187971
76	NC_016818	TGC	2	6	5233	5238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383187971
77	NC_016818	CCG	2	6	5278	5283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383187971
78	NC_016818	CAT	4	12	5578	5589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383187971
79	NC_016818	TCT	2	6	5640	5645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383187971
80	NC_016818	GCC	2	6	5695	5700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383187971
81	NC_016818	CGT	2	6	5897	5902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383187971
82	NC_016818	GCT	2	6	5914	5919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383187971
83	NC_016818	AAC	2	6	5921	5926	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383187971
84	NC_016818	AGC	2	6	6024	6029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383187971
85	NC_016818	GAA	2	6	6206	6211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383187971
86	NC_016818	GTG	2	6	6228	6233	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383187971
87	NC_016818	CGT	2	6	6293	6298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383187971
88	NC_016818	ACC	2	6	6359	6364	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383187971
89	NC_016818	AAC	2	6	6375	6380	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383187971
90	NC_016818	TGC	2	6	6415	6420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383187971
91	NC_016818	GTT	2	6	6427	6432	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383187971
92	NC_016818	CAC	2	6	6433	6438	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383187971
93	NC_016818	GCA	2	6	6724	6729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383187972
94	NC_016818	CAG	2	6	6851	6856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383187972
95	NC_016818	AAT	2	6	6878	6883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383187972
96	NC_016818	CAC	2	6	7066	7071	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383187972
97	NC_016818	TGA	3	9	7134	7142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383187972
98	NC_016818	TGA	2	6	7144	7149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383187972
99	NC_016818	CTG	2	6	7157	7162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383187972
100	NC_016818	CGG	2	6	7185	7190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383187972
101	NC_016818	CAT	2	6	7210	7215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383187972
102	NC_016818	TGA	2	6	7317	7322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383187972
103	NC_016818	GTG	2	6	7713	7718	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383187973
104	NC_016818	TCA	2	6	7799	7804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383187973
105	NC_016818	CCG	2	6	7885	7890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383187973
106	NC_016818	CAT	2	6	8049	8054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383187973
107	NC_016818	GAA	2	6	8148	8153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383187973
108	NC_016818	GCC	2	6	8191	8196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383187973
109	NC_016818	GTG	2	6	8268	8273	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383187973
110	NC_016818	TGA	2	6	8461	8466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383187973
111	NC_016818	GGC	2	6	8511	8516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383187973
112	NC_016818	GCA	2	6	8710	8715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383187973
113	NC_016818	GTC	2	6	8859	8864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383187974
114	NC_016818	TTC	2	6	8915	8920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383187974
115	NC_016818	GCA	2	6	8977	8982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383187974
116	NC_016818	AGT	2	6	9024	9029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383187974
117	NC_016818	TCA	2	6	9061	9066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383187974
118	NC_016818	AAT	2	6	9091	9096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383187974
119	NC_016818	CAC	2	6	9106	9111	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383187974
120	NC_016818	TCG	2	6	9142	9147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383187974
121	NC_016818	TCA	2	6	9166	9171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383187974
122	NC_016818	GCG	2	6	9172	9177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383187974
123	NC_016818	TCA	2	6	9190	9195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383187974
124	NC_016818	GCG	2	6	9665	9670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383187975
125	NC_016818	ACA	2	6	9773	9778	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383187975
126	NC_016818	GCC	2	6	9898	9903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383187975
127	NC_016818	CGT	2	6	9942	9947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383187975
128	NC_016818	ATC	2	6	9954	9959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383187975
129	NC_016818	CGG	2	6	10020	10025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383187976
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500	NC_016818	TGA	2	6	35817	35822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383187999

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