MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Sinorhizobium fredii HH103 plasmid pSfHH103c complete sequence

Total Repeats: 40

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016814	TCGATC	2	12	458	469	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_016814	GCAGAA	2	12	4760	4771	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	378775799
3	NC_016814	GAACCG	2	12	9136	9147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378775802
4	NC_016814	GGCCCT	2	12	9156	9167	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	378775802
5	NC_016814	CGGCGT	2	12	9882	9893	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	378775802
6	NC_016814	GCTCGC	2	12	11056	11067	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	378775804
7	NC_016814	GAGAAT	2	12	15186	15197	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	378775811
8	NC_016814	CTATGC	2	12	15389	15400	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	378775811
9	NC_016814	CATGCC	2	12	15906	15917	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	378775811
10	NC_016814	GAAATG	2	12	16023	16034	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	378775811
11	NC_016814	AAGGGG	2	12	17421	17432	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378775811
12	NC_016814	TTGGAA	2	12	20412	20423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378775814
13	NC_016814	CATGCG	2	12	22659	22670	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	378775818
14	NC_016814	CGCAAA	2	12	22719	22730	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	378775818
15	NC_016814	CGCTGG	2	12	33006	33017	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	378775828
16	NC_016814	AGATCG	2	12	33704	33715	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	378775828
17	NC_016814	GATCGA	2	12	35414	35425	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	378775829
18	NC_016814	CGTTGC	2	12	36509	36520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378775830
19	NC_016814	CCGCTC	2	12	51025	51036	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	378775849
20	NC_016814	TTCGAG	2	12	57470	57481	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	378775855
21	NC_016814	TCTGCC	2	12	65797	65808	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	378775863
22	NC_016814	TTTTGC	2	12	67635	67646	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	378775865
23	NC_016814	GCCCGA	2	12	77683	77694	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	378775874
24	NC_016814	GGGCGT	2	12	88349	88360	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	378775893
25	NC_016814	CGCCGG	2	12	91884	91895	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_016814	CTCGAA	2	12	98284	98295	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	378775905
27	NC_016814	GACCAA	2	12	107929	107940	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	378775918
28	NC_016814	GCAGCC	2	12	108279	108290	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	378775918
29	NC_016814	GAACTC	2	12	108801	108812	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	378775919
30	NC_016814	CATCGT	2	12	112711	112722	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	378775924
31	NC_016814	GATCGG	2	12	112914	112925	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	378775925
32	NC_016814	GTCGAT	2	12	114083	114094	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	378775926
33	NC_016814	GGCGCG	2	12	115151	115162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378775926
34	NC_016814	CCTCTT	2	12	118814	118825	0 %	50 %	0 %	50 %	378775933
35	NC_016814	CGAAGC	2	12	119248	119259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_016814	GCGATT	2	12	122924	122935	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	378775938
37	NC_016814	TTTTCA	2	12	124089	124100	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	378775939
38	NC_016814	GCACTT	2	12	133242	133253	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_016814	ACGGCG	2	12	139201	139212	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	378775953
40	NC_016814	GCCCGC	2	12	139896	139907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378775953

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.