MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Sinorhizobium fredii HH103 plasmid pSfHH103c complete sequence

Total Repeats: 20

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016814	TAAGC	2	10	3709	3718	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_016814	AGGGA	2	10	3817	3826	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016814	GGTAA	2	10	3874	3883	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016814	GAGCA	2	10	11424	11433	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
5	NC_016814	GTGCG	2	10	14016	14025	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
6	NC_016814	TTTCG	3	15	52842	52856	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_016814	CAGGG	2	10	53536	53545	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
8	NC_016814	AGACG	2	10	64564	64573	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
9	NC_016814	TTATG	2	10	67739	67748	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016814	TTCAC	2	10	70084	70093	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
11	NC_016814	TGTTC	2	10	75702	75711	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_016814	CAAAA	2	10	85095	85104	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_016814	CAGCC	2	10	87195	87204	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
14	NC_016814	CATCA	2	10	100904	100913	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
15	NC_016814	GTCCG	2	10	104715	104724	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
16	NC_016814	CGGGC	2	10	115512	115521	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
17	NC_016814	ATGTT	2	10	120887	120896	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016814	TGCGC	2	10	133271	133280	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
19	NC_016814	CCCCT	2	10	138372	138381	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
20	NC_016814	AGAAA	2	10	138665	138674	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.