MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Sinorhizobium fredii HH103 plasmid pSfHH103c complete sequence

Total Repeats: 65

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016814	GTAC	2	8	321	328	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_016814	GCTC	2	8	1004	1011	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_016814	GGTT	2	8	5432	5439	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016814	TCGA	2	8	14358	14365	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_016814	ACTG	2	8	20757	20764	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_016814	AACG	2	8	24595	24602	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_016814	GGTT	2	8	24979	24986	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016814	TCGC	2	8	25057	25064	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9	NC_016814	AGCG	2	8	29507	29514	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_016814	GGCA	2	8	32521	32528	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11	NC_016814	AGGG	2	8	49532	49539	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016814	CACC	2	8	49616	49623	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
13	NC_016814	TCAA	2	8	52878	52885	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_016814	GTCG	2	8	54566	54573	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_016814	TGAA	2	8	56433	56440	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016814	ATAC	2	8	56652	56659	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_016814	GCCC	2	8	60507	60514	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
18	NC_016814	GGCT	2	8	64638	64645	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
19	NC_016814	GCAC	2	8	67443	67450	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
20	NC_016814	CATT	2	8	69879	69886	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_016814	TCGT	2	8	70031	70038	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_016814	CTTC	2	8	71834	71841	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_016814	CCGG	2	8	75741	75748	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_016814	TTCC	2	8	75858	75865	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_016814	TTGC	2	8	75901	75908	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_016814	ATCG	2	8	78360	78367	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_016814	CCGA	2	8	78388	78395	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
28	NC_016814	TCCT	2	8	80042	80049	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_016814	AGCC	2	8	81850	81857	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
30	NC_016814	ATCG	2	8	82333	82340	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_016814	CGGC	2	8	84571	84578	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_016814	GGCG	2	8	86680	86687	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
33	NC_016814	GCCT	2	8	86695	86702	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
34	NC_016814	AGGC	2	8	86764	86771	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
35	NC_016814	GGCA	2	8	86887	86894	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
36	NC_016814	ATGA	2	8	86993	87000	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016814	CCGC	2	8	87023	87030	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
38	NC_016814	CAGA	2	8	87567	87574	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_016814	AGGG	2	8	87784	87791	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016814	GCCG	2	8	91823	91830	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_016814	GTTC	2	8	91959	91966	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_016814	AAGC	2	8	92714	92721	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_016814	ACCT	2	8	96335	96342	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_016814	GGGA	2	8	103909	103916	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016814	TCCG	2	8	104028	104035	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
46	NC_016814	ATCG	2	8	106720	106727	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_016814	ATCC	2	8	106861	106868	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_016814	GACT	2	8	106941	106948	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_016814	GGTG	2	8	108466	108473	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016814	GGCC	2	8	109394	109401	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_016814	GCTG	2	8	109460	109467	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_016814	CACG	2	8	119373	119380	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
53	NC_016814	ACCG	2	8	119440	119447	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
54	NC_016814	CTGT	2	8	122203	122210	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_016814	GTTC	2	8	129101	129108	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_016814	AAGA	2	8	130075	130082	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016814	GAAA	2	8	130162	130169	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016814	AAGA	2	8	133337	133344	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016814	TCCT	2	8	136104	136111	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_016814	CGGG	2	8	136181	136188	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
61	NC_016814	CCCG	2	8	138394	138401	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
62	NC_016814	AAGC	2	8	138457	138464	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_016814	TGCG	2	8	138544	138551	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
64	NC_016814	ATAA	2	8	138717	138724	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016814	CCCT	2	8	138745	138752	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.