MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Sinorhizobium fredii HH103 plasmid pSfHH103c complete sequence

Total Repeats: 2110

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016814	CCG	2	6	112	117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_016814	AGA	2	6	125	130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016814	GAC	2	6	396	401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_016814	GAC	2	6	550	555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_016814	AAG	2	6	583	588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016814	ATG	2	6	674	679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016814	GTC	2	6	704	709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_016814	ACG	2	6	743	748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_016814	TCA	2	6	752	757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_016814	CGC	2	6	767	772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_016814	GTC	2	6	801	806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_016814	CTG	2	6	871	876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_016814	ATG	2	6	877	882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016814	AGC	2	6	1016	1021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_016814	GAT	2	6	1199	1204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378775796
16	NC_016814	CCT	2	6	1217	1222	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378775796
17	NC_016814	AGC	2	6	1379	1384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378775796
18	NC_016814	GTG	2	6	1422	1427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378775796
19	NC_016814	TCG	2	6	1459	1464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378775796
20	NC_016814	TGA	2	6	1478	1483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378775796
21	NC_016814	GAA	2	6	1497	1502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378775796
22	NC_016814	TCG	2	6	1504	1509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378775796
23	NC_016814	GTT	2	6	1644	1649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378775796
24	NC_016814	GAT	2	6	1820	1825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378775796
25	NC_016814	AGC	2	6	1881	1886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378775796
26	NC_016814	CGG	2	6	1928	1933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378775796
27	NC_016814	CTG	2	6	1981	1986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378775796
28	NC_016814	AGA	2	6	2041	2046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378775796
29	NC_016814	CGT	2	6	2105	2110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378775796
30	NC_016814	AAC	2	6	2187	2192	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378775796
31	NC_016814	GGC	2	6	2369	2374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_016814	GAC	2	6	2427	2432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378775797
33	NC_016814	GCG	2	6	2442	2447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378775797
34	NC_016814	CGG	2	6	2510	2515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378775797
35	NC_016814	GCT	2	6	2598	2603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378775797
36	NC_016814	GAG	2	6	2632	2637	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378775797
37	NC_016814	TCG	2	6	2645	2650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378775797
38	NC_016814	GCG	2	6	2709	2714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378775797
39	NC_016814	CGC	2	6	2721	2726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378775797
40	NC_016814	TCG	2	6	2729	2734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378775797
41	NC_016814	GCG	2	6	2798	2803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378775797
42	NC_016814	GAG	2	6	2809	2814	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378775797
43	NC_016814	GCT	2	6	2838	2843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378775797
44	NC_016814	GCA	2	6	2874	2879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378775797
45	NC_016814	GGC	2	6	2883	2888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378775797
46	NC_016814	AGG	2	6	2972	2977	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378775797
47	NC_016814	GAG	2	6	3004	3009	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378775797
48	NC_016814	TGC	2	6	3089	3094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378775797
49	NC_016814	TGC	2	6	3153	3158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378775797
50	NC_016814	CGA	2	6	3263	3268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378775797
51	NC_016814	TGC	2	6	3302	3307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378775797
52	NC_016814	GGT	2	6	3381	3386	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378775797
53	NC_016814	AGG	2	6	3425	3430	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378775797
54	NC_016814	CGC	3	9	3456	3464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378775797
55	NC_016814	CAA	2	6	3501	3506	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378775797
56	NC_016814	CGG	2	6	3510	3515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378775797
57	NC_016814	TTG	2	6	3632	3637	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016814	GGC	2	6	3758	3763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_016814	CAT	2	6	4019	4024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378775798
60	NC_016814	GAG	2	6	4446	4451	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378775798
61	NC_016814	CGG	2	6	4529	4534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378775798
62	NC_016814	TGG	2	6	4583	4588	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378775798
63	NC_016814	TGC	2	6	4790	4795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378775799
64	NC_016814	TGG	2	6	4961	4966	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378775799
65	NC_016814	AAG	2	6	5007	5012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378775799
66	NC_016814	TTC	2	6	5027	5032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378775799
67	NC_016814	CTT	2	6	5054	5059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378775799
68	NC_016814	AGC	2	6	5146	5151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378775799
69	NC_016814	TTG	2	6	5256	5261	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378775799
70	NC_016814	AGC	2	6	5309	5314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378775799
71	NC_016814	TAC	2	6	5505	5510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_016814	GAG	2	6	5584	5589	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378775800
73	NC_016814	TGA	2	6	5631	5636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378775800
74	NC_016814	TAT	2	6	5668	5673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378775800
75	NC_016814	GGA	2	6	5716	5721	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378775800
76	NC_016814	AGA	2	6	5813	5818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378775800
77	NC_016814	TCA	2	6	5837	5842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378775800
78	NC_016814	AGC	2	6	5853	5858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378775800
79	NC_016814	GAT	3	9	5875	5883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378775800
80	NC_016814	GAT	2	6	5958	5963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378775800
81	NC_016814	GGA	2	6	6001	6006	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378775800
82	NC_016814	GTC	2	6	6114	6119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378775800
83	NC_016814	CGA	2	6	6338	6343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378775801
84	NC_016814	GTG	2	6	6378	6383	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378775801
85	NC_016814	TCT	2	6	6470	6475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378775801
86	NC_016814	TCG	2	6	6484	6489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378775801
87	NC_016814	TGA	2	6	6682	6687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378775801
88	NC_016814	GTC	2	6	6832	6837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378775801
89	NC_016814	AAC	2	6	6970	6975	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378775801
90	NC_016814	ATG	2	6	7010	7015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378775802
91	NC_016814	CGT	2	6	7020	7025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378775802
92	NC_016814	TCG	2	6	7085	7090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378775802
93	NC_016814	GCA	2	6	7155	7160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378775802
94	NC_016814	TCT	2	6	7181	7186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378775802
95	NC_016814	CGG	2	6	7473	7478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378775802
96	NC_016814	CAG	2	6	7540	7545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378775802
97	NC_016814	CGG	2	6	7563	7568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378775802
98	NC_016814	GAA	2	6	7624	7629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378775802
99	NC_016814	AGG	2	6	7883	7888	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378775802
100	NC_016814	GCG	2	6	8039	8044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378775802
101	NC_016814	TGA	2	6	8072	8077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378775802
102	NC_016814	CGG	2	6	8191	8196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378775802
103	NC_016814	CGA	2	6	8295	8300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378775802
104	NC_016814	GCC	2	6	8411	8416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378775802
105	NC_016814	CTT	2	6	8425	8430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378775802
106	NC_016814	GAA	2	6	8473	8478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378775802
107	NC_016814	GCG	2	6	8563	8568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378775802
108	NC_016814	CGG	2	6	8635	8640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378775802
109	NC_016814	GCC	2	6	8789	8794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378775802
110	NC_016814	CGC	2	6	8809	8814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378775802
111	NC_016814	TTG	2	6	8831	8836	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378775802
112	NC_016814	CCG	2	6	8900	8905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378775802
113	NC_016814	GCC	2	6	8922	8927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378775802
114	NC_016814	CGA	2	6	8937	8942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378775802
115	NC_016814	CGA	2	6	8970	8975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378775802
116	NC_016814	CGG	2	6	9072	9077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378775802
117	NC_016814	CTG	2	6	9094	9099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378775802
118	NC_016814	TGA	2	6	9111	9116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378775802
119	NC_016814	GGA	2	6	9207	9212	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378775802
120	NC_016814	GTC	2	6	9256	9261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378775802
121	NC_016814	GTC	2	6	9361	9366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378775802
122	NC_016814	AAG	2	6	9371	9376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378775802
123	NC_016814	ACG	2	6	9405	9410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378775802
124	NC_016814	GGC	2	6	9552	9557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378775802
125	NC_016814	GGC	2	6	9622	9627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378775802
126	NC_016814	AGT	2	6	9641	9646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378775802
127	NC_016814	CGT	2	6	9690	9695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378775802
128	NC_016814	GTG	2	6	9765	9770	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378775802
129	NC_016814	TCC	2	6	9812	9817	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378775802
130	NC_016814	TGG	2	6	9830	9835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378775802
131	NC_016814	GCC	2	6	10152	10157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378775803
132	NC_016814	GCA	2	6	10214	10219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378775803
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135	NC_016814	GGC	2	6	10468	10473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378775803
136	NC_016814	CGG	2	6	10495	10500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378775803
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138	NC_016814	CGA	2	6	10676	10681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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152	NC_016814	GCG	2	6	11608	11613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378775805
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256	NC_016814	GAA	2	6	19507	19512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378775814
257	NC_016814	TGC	2	6	19523	19528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378775814
258	NC_016814	GCC	2	6	19557	19562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378775814
259	NC_016814	GCA	2	6	19572	19577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378775814
260	NC_016814	CGA	2	6	19621	19626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378775814
261	NC_016814	GGC	2	6	19753	19758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378775814
262	NC_016814	CTT	2	6	19775	19780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378775814
263	NC_016814	CGA	2	6	19786	19791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378775814
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265	NC_016814	CTG	2	6	20068	20073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378775814
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271	NC_016814	ATC	2	6	20486	20491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378775814
272	NC_016814	CGA	2	6	20578	20583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378775814
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282	NC_016814	ATC	2	6	21336	21341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378775817
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287	NC_016814	ATT	2	6	21520	21525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
288	NC_016814	GCT	2	6	21617	21622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378775818
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372	NC_016814	TCC	2	6	27619	27624	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378775824
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