MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Sinorhizobium fredii HH103 plasmid pSfHH103c complete sequence

Total Repeats: 41

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016814	GA	3	6	5493	5498	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016814	GC	3	6	5533	5538	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_016814	GC	3	6	6248	6253	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_016814	CG	3	6	13759	13764	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_016814	TC	3	6	18958	18963	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_016814	CG	3	6	24758	24763	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_016814	AC	3	6	32242	32247	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_016814	GT	4	8	32423	32430	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016814	GC	3	6	32444	32449	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_016814	TC	3	6	44656	44661	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_016814	AG	3	6	49582	49587	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016814	GA	3	6	49705	49710	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016814	TC	5	10	49795	49804	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_016814	CG	4	8	54587	54594	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_016814	GC	3	6	54636	54641	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_016814	CA	4	8	55727	55734	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_016814	GC	3	6	56617	56622	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_016814	GT	3	6	64750	64755	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016814	AT	3	6	67755	67760	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016814	CG	3	6	67924	67929	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_016814	TA	3	6	69892	69897	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016814	GC	3	6	80475	80480	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_016814	CG	3	6	80495	80500	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_016814	CT	3	6	83358	83363	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_016814	GC	3	6	85041	85046	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_016814	CT	3	6	86627	86632	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_016814	AC	3	6	87659	87664	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_016814	CG	3	6	91148	91153	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_016814	GC	3	6	91431	91436	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_016814	GC	3	6	91831	91836	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_016814	CG	3	6	101077	101082	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_016814	AC	3	6	101841	101846	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_016814	GC	3	6	103935	103940	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_016814	GC	3	6	104131	104136	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_016814	GA	3	6	120985	120990	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016814	CG	3	6	122236	122241	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_016814	CG	3	6	130096	130101	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_016814	CT	3	6	130114	130119	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_016814	GC	3	6	135238	135243	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_016814	CG	3	6	136237	136242	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_016814	GC	3	6	138527	138532	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.