MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Sinorhizobium fredii HH103 plasmid pSfHH103c complete sequence

Total Repeats: 226

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016814	CG	3	6	1860	1865	0 %	0 %	50 %	50 %	378775796
2	NC_016814	CG	3	6	2575	2580	0 %	0 %	50 %	50 %	378775797
3	NC_016814	CG	3	6	2680	2685	0 %	0 %	50 %	50 %	378775797
4	NC_016814	CG	3	6	5324	5329	0 %	0 %	50 %	50 %	378775799
5	NC_016814	GC	3	6	5596	5601	0 %	0 %	50 %	50 %	378775800
6	NC_016814	AT	3	6	7303	7308	50 %	50 %	0 %	0 %	378775802
7	NC_016814	GC	3	6	7574	7579	0 %	0 %	50 %	50 %	378775802
8	NC_016814	GA	3	6	7643	7648	50 %	0 %	50 %	0 %	378775802
9	NC_016814	CT	3	6	7796	7801	0 %	50 %	0 %	50 %	378775802
10	NC_016814	TC	3	6	8232	8237	0 %	50 %	0 %	50 %	378775802
11	NC_016814	GC	3	6	8443	8448	0 %	0 %	50 %	50 %	378775802
12	NC_016814	CG	3	6	8573	8578	0 %	0 %	50 %	50 %	378775802
13	NC_016814	GC	3	6	8909	8914	0 %	0 %	50 %	50 %	378775802
14	NC_016814	CG	3	6	9447	9452	0 %	0 %	50 %	50 %	378775802
15	NC_016814	CG	3	6	9922	9927	0 %	0 %	50 %	50 %	378775802
16	NC_016814	GC	3	6	9931	9936	0 %	0 %	50 %	50 %	378775802
17	NC_016814	CG	3	6	10081	10086	0 %	0 %	50 %	50 %	378775803
18	NC_016814	GC	3	6	10894	10899	0 %	0 %	50 %	50 %	378775804
19	NC_016814	CG	3	6	11779	11784	0 %	0 %	50 %	50 %	378775805
20	NC_016814	CG	3	6	12708	12713	0 %	0 %	50 %	50 %	378775808
21	NC_016814	CG	3	6	15163	15168	0 %	0 %	50 %	50 %	378775811
22	NC_016814	GC	3	6	16958	16963	0 %	0 %	50 %	50 %	378775811
23	NC_016814	TC	3	6	17141	17146	0 %	50 %	0 %	50 %	378775811
24	NC_016814	CG	3	6	17512	17517	0 %	0 %	50 %	50 %	378775811
25	NC_016814	GA	3	6	17605	17610	50 %	0 %	50 %	0 %	378775811
26	NC_016814	GC	3	6	20154	20159	0 %	0 %	50 %	50 %	378775814
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28	NC_016814	GC	3	6	21825	21830	0 %	0 %	50 %	50 %	378775818
29	NC_016814	CG	3	6	22835	22840	0 %	0 %	50 %	50 %	378775818
30	NC_016814	GC	3	6	22895	22900	0 %	0 %	50 %	50 %	378775818
31	NC_016814	GC	3	6	23018	23023	0 %	0 %	50 %	50 %	378775818
32	NC_016814	AC	3	6	23229	23234	50 %	0 %	0 %	50 %	378775818
33	NC_016814	CG	3	6	23494	23499	0 %	0 %	50 %	50 %	378775820
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35	NC_016814	CA	3	6	24409	24414	50 %	0 %	0 %	50 %	378775821
36	NC_016814	TG	3	6	25245	25250	0 %	50 %	50 %	0 %	378775822
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39	NC_016814	CG	3	6	26777	26782	0 %	0 %	50 %	50 %	378775823
40	NC_016814	GC	3	6	28339	28344	0 %	0 %	50 %	50 %	378775824
41	NC_016814	CT	3	6	29372	29377	0 %	50 %	0 %	50 %	378775825
42	NC_016814	CG	3	6	29757	29762	0 %	0 %	50 %	50 %	378775826
43	NC_016814	GC	3	6	29970	29975	0 %	0 %	50 %	50 %	378775826
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51	NC_016814	GA	3	6	40203	40208	50 %	0 %	50 %	0 %	378775835
52	NC_016814	TG	3	6	41388	41393	0 %	50 %	50 %	0 %	378775836
53	NC_016814	GA	3	6	41685	41690	50 %	0 %	50 %	0 %	378775837
54	NC_016814	CG	3	6	41697	41702	0 %	0 %	50 %	50 %	378775837
55	NC_016814	CT	3	6	41808	41813	0 %	50 %	0 %	50 %	378775837
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61	NC_016814	CT	3	6	43736	43741	0 %	50 %	0 %	50 %	378775837
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65	NC_016814	GC	3	6	46833	46838	0 %	0 %	50 %	50 %	378775842
66	NC_016814	CG	3	6	47602	47607	0 %	0 %	50 %	50 %	378775843
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111	NC_016814	CG	3	6	78198	78203	0 %	0 %	50 %	50 %	378775874
112	NC_016814	GA	3	6	79432	79437	50 %	0 %	50 %	0 %	378775875
113	NC_016814	CG	3	6	79627	79632	0 %	0 %	50 %	50 %	378775875
114	NC_016814	GC	3	6	79895	79900	0 %	0 %	50 %	50 %	378775875
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123	NC_016814	AG	3	6	91998	92003	50 %	0 %	50 %	0 %	378775899
124	NC_016814	GC	4	8	92062	92069	0 %	0 %	50 %	50 %	378775899
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126	NC_016814	GC	3	6	92433	92438	0 %	0 %	50 %	50 %	378775899
127	NC_016814	AG	3	6	92607	92612	50 %	0 %	50 %	0 %	378775899
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.