MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Sinorhizobium fredii HH103 plasmid pSfHH103c complete sequence

Total Repeats: 53

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016814	T	7	7	695	701	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016814	T	6	6	3864	3869	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016814	C	6	6	5401	5406	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4	NC_016814	G	6	6	7126	7131	0 %	0 %	100 %	0 %	378775802
5	NC_016814	T	7	7	11947	11953	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016814	T	6	6	13073	13078	0 %	100 %	0 %	0 %	378775809
7	NC_016814	G	6	6	15884	15889	0 %	0 %	100 %	0 %	378775811
8	NC_016814	C	6	6	31601	31606	0 %	0 %	0 %	100 %	378775827
9	NC_016814	T	6	6	31736	31741	0 %	100 %	0 %	0 %	378775827
10	NC_016814	C	6	6	33043	33048	0 %	0 %	0 %	100 %	378775828
11	NC_016814	C	6	6	36844	36849	0 %	0 %	0 %	100 %	378775830
12	NC_016814	C	6	6	40169	40174	0 %	0 %	0 %	100 %	378775835
13	NC_016814	C	6	6	45345	45350	0 %	0 %	0 %	100 %	378775840
14	NC_016814	G	6	6	45359	45364	0 %	0 %	100 %	0 %	378775840
15	NC_016814	T	6	6	45629	45634	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016814	A	7	7	49045	49051	100 %	0 %	0 %	0 %	378775846
17	NC_016814	G	6	6	49946	49951	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016814	A	7	7	50846	50852	100 %	0 %	0 %	0 %	378775849
19	NC_016814	A	7	7	51782	51788	100 %	0 %	0 %	0 %	378775850
20	NC_016814	A	6	6	53882	53887	100 %	0 %	0 %	0 %	378775852
21	NC_016814	C	6	6	55551	55556	0 %	0 %	0 %	100 %	378775853
22	NC_016814	C	6	6	58302	58307	0 %	0 %	0 %	100 %	378775856
23	NC_016814	C	6	6	58973	58978	0 %	0 %	0 %	100 %	378775857
24	NC_016814	A	6	6	59276	59281	100 %	0 %	0 %	0 %	378775857
25	NC_016814	C	6	6	59658	59663	0 %	0 %	0 %	100 %	378775858
26	NC_016814	C	6	6	63369	63374	0 %	0 %	0 %	100 %	378775860
27	NC_016814	A	6	6	72929	72934	100 %	0 %	0 %	0 %	378775869
28	NC_016814	T	6	6	80342	80347	0 %	100 %	0 %	0 %	378775876
29	NC_016814	T	6	6	80550	80555	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016814	A	6	6	84324	84329	100 %	0 %	0 %	0 %	378775886
31	NC_016814	A	6	6	85101	85106	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016814	G	6	6	86608	86613	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016814	A	6	6	89405	89410	100 %	0 %	0 %	0 %	378775894
34	NC_016814	T	6	6	92119	92124	0 %	100 %	0 %	0 %	378775899
35	NC_016814	G	6	6	96243	96248	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016814	T	6	6	100151	100156	0 %	100 %	0 %	0 %	378775907
37	NC_016814	A	6	6	102642	102647	100 %	0 %	0 %	0 %	378775911
38	NC_016814	A	6	6	103444	103449	100 %	0 %	0 %	0 %	378775913
39	NC_016814	G	6	6	109626	109631	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016814	G	6	6	110473	110478	0 %	0 %	100 %	0 %	378775921
41	NC_016814	A	6	6	114012	114017	100 %	0 %	0 %	0 %	378775926
42	NC_016814	A	6	6	121005	121010	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016814	C	6	6	121221	121226	0 %	0 %	0 %	100 %	378775937
44	NC_016814	A	6	6	126481	126486	100 %	0 %	0 %	0 %	378775942
45	NC_016814	A	6	6	130060	130065	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016814	T	7	7	130131	130137	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016814	T	6	6	131043	131048	0 %	100 %	0 %	0 %	378775945
48	NC_016814	A	6	6	131568	131573	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016814	C	7	7	133715	133721	0 %	0 %	0 %	100 %	378775950
50	NC_016814	T	6	6	134439	134444	0 %	100 %	0 %	0 %	378775950
51	NC_016814	C	6	6	136216	136221	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
52	NC_016814	T	6	6	141713	141718	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016814	T	6	6	142969	142974	0 %	100 %	0 %	0 %	378775960

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.