MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Sinorhizobium fredii HH103 plasmid pSfHH103a complete sequence

Total Repeats: 13

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016813	CGGAT	2	10	1262	1271	20 %	20 %	40 %	20 %	378828554
2	NC_016813	AGGGG	2	10	1645	1654	20 %	0 %	80 %	0 %	378828554
3	NC_016813	CAGGA	2	10	3892	3901	40 %	0 %	40 %	20 %	378828556
4	NC_016813	ACCAA	2	10	5128	5137	60 %	0 %	0 %	40 %	378828556
5	NC_016813	GGGCC	2	10	5925	5934	0 %	0 %	60 %	40 %	378828557
6	NC_016813	ACCGG	2	10	11027	11036	20 %	0 %	40 %	40 %	378828562
7	NC_016813	GATCA	2	10	13223	13232	40 %	20 %	20 %	20 %	378828562
8	NC_016813	TCCAC	2	10	18756	18765	20 %	20 %	0 %	60 %	378828567
9	NC_016813	CGCGC	2	10	21799	21808	0 %	0 %	40 %	60 %	378828569
10	NC_016813	AGCCG	2	10	22014	22023	20 %	0 %	40 %	40 %	378828569
11	NC_016813	TCATC	2	10	22203	22212	20 %	40 %	0 %	40 %	378828569
12	NC_016813	CGTGG	2	10	23767	23776	0 %	20 %	60 %	20 %	378828571
13	NC_016813	ATGAA	2	10	23838	23847	60 %	20 %	20 %	0 %	378828571

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.