MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Sinorhizobium fredii HH103 plasmid pSfHH103a complete sequence

Total Repeats: 46

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016813	GC	3	6	53	58	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_016813	GC	4	8	185	192	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_016813	GC	3	6	531	536	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_016813	AG	3	6	573	578	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016813	GA	3	6	702	707	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016813	GA	3	6	1452	1457	50 %	0 %	50 %	0 %	378828554
7	NC_016813	CG	3	6	1608	1613	0 %	0 %	50 %	50 %	378828554
8	NC_016813	AT	3	6	1896	1901	50 %	50 %	0 %	0 %	378828555
9	NC_016813	GC	3	6	2104	2109	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_016813	AC	3	6	3983	3988	50 %	0 %	0 %	50 %	378828556
11	NC_016813	GC	3	6	4517	4522	0 %	0 %	50 %	50 %	378828556
12	NC_016813	CA	3	6	5109	5114	50 %	0 %	0 %	50 %	378828556
13	NC_016813	GC	3	6	5208	5213	0 %	0 %	50 %	50 %	378828556
14	NC_016813	GC	3	6	5472	5477	0 %	0 %	50 %	50 %	378828557
15	NC_016813	GA	3	6	5951	5956	50 %	0 %	50 %	0 %	378828557
16	NC_016813	CG	4	8	6383	6390	0 %	0 %	50 %	50 %	378828558
17	NC_016813	CT	3	6	6637	6642	0 %	50 %	0 %	50 %	378828558
18	NC_016813	CG	3	6	7219	7224	0 %	0 %	50 %	50 %	378828558
19	NC_016813	CG	3	6	7769	7774	0 %	0 %	50 %	50 %	378828560
20	NC_016813	GC	3	6	7943	7948	0 %	0 %	50 %	50 %	378828560
21	NC_016813	CG	3	6	8360	8365	0 %	0 %	50 %	50 %	378828560
22	NC_016813	TG	3	6	9600	9605	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016813	CG	3	6	9644	9649	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_016813	GA	3	6	9759	9764	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016813	CG	3	6	10984	10989	0 %	0 %	50 %	50 %	378828562
26	NC_016813	GC	3	6	11388	11393	0 %	0 %	50 %	50 %	378828562
27	NC_016813	CG	3	6	12697	12702	0 %	0 %	50 %	50 %	378828562
28	NC_016813	AT	4	8	14260	14267	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016813	AG	3	6	14608	14613	50 %	0 %	50 %	0 %	378828563
30	NC_016813	TC	3	6	14990	14995	0 %	50 %	0 %	50 %	378828564
31	NC_016813	CA	3	6	15811	15816	50 %	0 %	0 %	50 %	378828565
32	NC_016813	TA	3	6	17847	17852	50 %	50 %	0 %	0 %	378828566
33	NC_016813	TC	3	6	18264	18269	0 %	50 %	0 %	50 %	378828566
34	NC_016813	CG	3	6	19927	19932	0 %	0 %	50 %	50 %	378828568
35	NC_016813	GC	3	6	19965	19970	0 %	0 %	50 %	50 %	378828568
36	NC_016813	GC	3	6	20067	20072	0 %	0 %	50 %	50 %	378828568
37	NC_016813	GC	3	6	20664	20669	0 %	0 %	50 %	50 %	378828568
38	NC_016813	GA	3	6	21435	21440	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016813	CG	3	6	22264	22269	0 %	0 %	50 %	50 %	378828569
40	NC_016813	CG	3	6	22279	22284	0 %	0 %	50 %	50 %	378828569
41	NC_016813	GA	3	6	22390	22395	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016813	TC	3	6	22595	22600	0 %	50 %	0 %	50 %	378828570
43	NC_016813	CG	3	6	22755	22760	0 %	0 %	50 %	50 %	378828570
44	NC_016813	CG	3	6	23560	23565	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_016813	GC	3	6	23669	23674	0 %	0 %	50 %	50 %	378828571
46	NC_016813	AG	3	6	23677	23682	50 %	0 %	50 %	0 %	378828571

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.