MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Legionella pneumophila subsp. pneumophila ATCC 43290 chromosome

Total Repeats: 138

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016811	AATGCA	2	12	3604	3615	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_016811	TCGAAT	2	12	10456	10467	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_016811	TCCGTG	2	12	29795	29806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_016811	GTTTAT	2	12	31053	31064	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016811	CTTATT	2	12	88842	88853	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_016811	TTAATA	2	12	135087	135098	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016811	TCAACA	2	12	187238	187249	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_016811	AAATGC	2	12	193330	193341	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_016811	TTATTT	2	12	210306	210317	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016811	ACTATT	2	12	228420	228431	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_016811	TAAAAT	2	12	297033	297044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016811	TAGCTT	2	12	308661	308672	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_016811	GCCTTG	2	12	314565	314576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_016811	TGTCCA	2	12	318378	318389	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_016811	AAAATC	2	12	320239	320250	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_016811	CATTTG	3	18	320880	320897	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_016811	CATTTG	2	12	366007	366018	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_016811	TGAAAT	2	12	367877	367888	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016811	AATTTA	2	12	371864	371875	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016811	AATCAA	2	12	389894	389905	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_016811	ATTTTA	2	12	416467	416478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016811	CTTGGT	2	12	515838	515849	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_016811	ATTAAA	2	12	517007	517018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016811	TTAAAT	2	12	518132	518143	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016811	TAAAAT	2	12	533386	533397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016811	ATCCTG	2	12	533942	533953	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_016811	TTTTCA	2	12	563545	563556	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_016811	AATCAA	2	12	593777	593788	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_016811	TTTAAA	2	12	599907	599918	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016811	CATTTG	2	12	614367	614378	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_016811	TGAAAT	2	12	616237	616248	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016811	TAAAAT	2	12	624643	624654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016811	ATTTAT	2	12	627139	627150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016811	TTGTGG	2	12	874233	874244	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016811	AAATGG	2	12	874409	874420	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016811	TTTGTT	2	12	881033	881044	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016811	TACGGT	2	12	923752	923763	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_016811	GCCTGA	2	12	932456	932467	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_016811	TTTTAT	2	12	985457	985468	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016811	AAAGAG	2	12	1002752	1002763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016811	TTTCGT	2	12	1019632	1019643	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_016811	AAGTGC	2	12	1020876	1020887	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_016811	GAAATG	2	12	1021027	1021038	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016811	TTAAAA	2	12	1074054	1074065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016811	ATTTTT	2	12	1084275	1084286	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016811	TTTTTG	2	12	1085699	1085710	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016811	ATTTTC	2	12	1094180	1094191	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_016811	ATTTTA	2	12	1095989	1096000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016811	TATAAA	2	12	1101705	1101716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016811	CTTTAT	2	12	1127296	1127307	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_016811	GACCAA	2	12	1139333	1139344	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_016811	AATGCG	2	12	1149824	1149835	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_016811	ATTTCA	2	12	1151250	1151261	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_016811	AGCGCA	2	12	1165715	1165726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_016811	TGTTTT	2	12	1193028	1193039	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016811	TTTTAT	2	12	1295861	1295872	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016811	GACTTT	2	12	1317195	1317206	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_016811	GAAAAA	2	12	1334640	1334651	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016811	ATCATT	2	12	1379707	1379718	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_016811	AAATTG	2	12	1389141	1389152	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016811	AAAATA	2	12	1391659	1391670	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016811	TATTTG	2	12	1416764	1416775	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016811	TAAAAA	2	12	1421008	1421019	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016811	TTAAAA	2	12	1425242	1425253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016811	TAAAAA	2	12	1429172	1429183	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016811	TTTTTA	2	12	1432969	1432980	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016811	AATCAT	2	12	1453168	1453179	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_016811	TTGATA	2	12	1515704	1515715	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016811	GATTAT	2	12	1533780	1533791	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016811	TAATGC	2	12	1553272	1553283	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_016811	CTATTA	2	12	1553371	1553382	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_016811	GATATT	2	12	1573196	1573207	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016811	AATATT	2	12	1596441	1596452	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_016811	AAAATT	2	12	1612042	1612053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016811	TCATTA	2	12	1649714	1649725	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_016811	TATTTT	2	12	1668994	1669005	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016811	ATCCAT	2	12	1684782	1684793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_016811	AAAAAT	2	12	1755713	1755724	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016811	AGACTT	2	12	1773002	1773013	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_016811	ATCAAC	2	12	1788461	1788472	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_016811	TGGCCT	2	12	1929961	1929972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_016811	AAAAAT	2	12	1948092	1948103	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016811	TCAAAA	2	12	1984963	1984974	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_016811	CTTTTT	2	12	1989912	1989923	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_016811	ATTTAG	2	12	1993562	1993573	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016811	ACTTTT	2	12	2013982	2013993	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_016811	GGACCT	2	12	2015676	2015687	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_016811	TTGCAT	2	12	2124495	2124506	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_016811	CAGCCC	2	12	2124680	2124691	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_016811	TGTAAT	2	12	2146695	2146706	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016811	TTAATT	2	12	2182345	2182356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016811	AATTAT	2	12	2268135	2268146	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016811	ATTGAT	2	12	2268506	2268517	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016811	AAGAAA	2	12	2273138	2273149	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016811	TCAAAT	2	12	2277129	2277140	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_016811	AACATT	2	12	2315851	2315862	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_016811	TATTCA	2	12	2347913	2347924	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_016811	ATTCTG	2	12	2352393	2352404	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_016811	AATTTA	2	12	2360429	2360440	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_016811	ACTTTG	2	12	2383267	2383278	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_016811	CAAGGC	2	12	2385338	2385349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_016811	TTTTAT	2	12	2390879	2390890	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016811	AGAATA	2	12	2391977	2391988	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016811	ATTTTA	2	12	2459030	2459041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016811	CCTTGT	2	12	2487110	2487121	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_016811	CAAAGA	2	12	2494698	2494709	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_016811	AAATGA	2	12	2520222	2520233	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016811	TAAAAA	2	12	2559906	2559917	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016811	CTTTTT	2	12	2593509	2593520	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_016811	TCTTAT	2	12	2631262	2631273	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_016811	AAATTA	2	12	2641036	2641047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016811	GTTAAG	2	12	2642597	2642608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016811	TATTTC	2	12	2662602	2662613	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_016811	TTAGTC	2	12	2697971	2697982	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_016811	ACAAAT	2	12	2723565	2723576	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_016811	CATAAA	2	12	2755917	2755928	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_016811	TTTTTA	2	12	2760540	2760551	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016811	TGAATT	2	12	2806578	2806589	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016811	CATAGA	2	12	2818736	2818747	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_016811	AGAAAC	2	12	2850509	2850520	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_016811	ATATGG	2	12	2858755	2858766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016811	TTTATA	2	12	2858843	2858854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_016811	GAATAA	2	12	2923508	2923519	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_016811	TTCTGA	2	12	3016647	3016658	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_016811	ATAAAA	2	12	3023920	3023931	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016811	ATTTCA	2	12	3059476	3059487	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_016811	CAAATG	2	12	3061346	3061357	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_016811	TTATTT	2	12	3102357	3102368	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016811	CAAGGT	2	12	3153571	3153582	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_016811	CAAGGT	2	12	3224668	3224679	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_016811	GGAATT	2	12	3236504	3236515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_016811	AATTAT	2	12	3242932	3242943	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_016811	TTTAAA	2	12	3257346	3257357	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_016811	TCAACA	2	12	3277534	3277545	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_016811	TAAAAA	2	12	3281491	3281502	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_016811	TACTGA	2	12	3288261	3288272	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
137	NC_016811	CTTATT	2	12	3322468	3322479	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
138	NC_016811	AAATCA	2	12	3358024	3358035	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.