MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Legionella pneumophila subsp. pneumophila ATCC 43290 chromosome

Total Repeats: 940

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016811	AATGGC	2	12	1179	1190	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	378775962
2	NC_016811	TGATAG	2	12	3183	3194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378775964
3	NC_016811	TATTCA	2	12	7652	7663	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	378775966
4	NC_016811	CAATAA	2	12	9046	9057	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	378775967
5	NC_016811	GGAAAT	2	12	9622	9633	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	378775968
6	NC_016811	CAAAGA	2	12	17097	17108	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	378775974
7	NC_016811	TTTATG	2	12	27082	27093	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	378775983
8	NC_016811	TTATTT	2	12	31683	31694	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	378775987
9	NC_016811	TAATGA	2	12	35960	35971	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	378775990
10	NC_016811	TTTAGA	2	12	36158	36169	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	378775990
11	NC_016811	ATTTCA	2	12	45498	45509	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	378775998
12	NC_016811	TTTTGA	2	12	46901	46912	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	378776000
13	NC_016811	AAAATC	2	12	48097	48108	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	378776001
14	NC_016811	TAGATT	2	12	52406	52417	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	378776005
15	NC_016811	TTGTTC	2	12	53557	53568	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	378776006
16	NC_016811	CTTAGT	2	12	55808	55819	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	378776009
17	NC_016811	ATGGAT	2	12	56016	56027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378776010
18	NC_016811	TTGGAG	2	12	57031	57042	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	378776010
19	NC_016811	CTCCTG	2	12	60167	60178	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	378776013
20	NC_016811	TCACTG	2	12	60853	60864	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	378776014
21	NC_016811	GGGTAT	2	12	62670	62681	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	378776016
22	NC_016811	TGCAGC	2	12	65700	65711	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	378776020
23	NC_016811	CCATAA	2	12	70503	70514	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	378776023
24	NC_016811	AAAAAG	2	12	72166	72177	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	378776025
25	NC_016811	TTAGCA	2	12	72519	72530	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	378776025
26	NC_016811	ATGAGT	2	12	73830	73841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378776026
27	NC_016811	TAAAAA	2	12	74474	74485	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	378776027
28	NC_016811	GGATTG	2	12	77364	77375	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	378776030
29	NC_016811	AAAAGT	2	12	78996	79007	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	378776031
30	NC_016811	TTTGAA	2	12	84630	84641	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	378776035
31	NC_016811	AAACCA	2	12	96759	96770	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378776045
32	NC_016811	ATTGGT	2	12	98842	98853	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	378776048
33	NC_016811	ATCCCG	2	12	105198	105209	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	378776051
34	NC_016811	TTGCAA	2	12	108861	108872	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	378776054
35	NC_016811	CAAATC	2	12	113535	113546	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	378776058
36	NC_016811	GTTTCT	2	12	116668	116679	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	378776061
37	NC_016811	TTGCTT	2	12	116867	116878	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	378776061
38	NC_016811	TAAGAA	2	12	121025	121036	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	378776065
39	NC_016811	AGGAAA	2	12	123473	123484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378776068
40	NC_016811	ATGACT	2	12	124540	124551	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	378776068
41	NC_016811	AGTTTT	2	12	125247	125258	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	378776069
42	NC_016811	CAACAG	2	12	132177	132188	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	378776072
43	NC_016811	CATTTC	2	12	134543	134554	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	378776074
44	NC_016811	TTTAAT	2	12	139520	139531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378776079
45	NC_016811	GGTTAT	2	12	142459	142470	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	378776083
46	NC_016811	AAAAAT	2	12	145172	145183	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	378776084
47	NC_016811	ATAAAT	2	12	157144	157155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378776093
48	NC_016811	TGTTTT	2	12	160495	160506	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	378776093
49	NC_016811	TTTTAA	2	12	169296	169307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378776098
50	NC_016811	GAAAAA	2	12	169337	169348	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	378776098
51	NC_016811	GCCATG	2	12	171703	171714	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	378776099
52	NC_016811	TTTCCA	2	12	176995	177006	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	378776105
53	NC_016811	TAAAAA	2	12	178071	178082	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	378776106
54	NC_016811	AAAACA	2	12	178269	178280	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	378776106
55	NC_016811	TGATTA	2	12	180979	180990	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	378776108
56	NC_016811	TCTATA	2	12	182952	182963	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	378776109
57	NC_016811	TGTTCT	2	12	184906	184917	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	378776111
58	NC_016811	GTAATC	2	12	189863	189874	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	378776116
59	NC_016811	ATAAGG	2	12	191050	191061	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	378776118
60	NC_016811	ATTAAT	2	12	196300	196311	50 %	50 %	0 %	0 %	378776124
61	NC_016811	TGACTT	2	12	198564	198575	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	378776127
62	NC_016811	CTTCAA	2	12	200950	200961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378776130
63	NC_016811	TATCAT	2	12	201431	201442	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	378776131
64	NC_016811	GGGGAT	2	12	205366	205377	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	378776134
65	NC_016811	CTTGGG	2	12	206679	206690	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	378776135
66	NC_016811	TAAAAA	2	12	208216	208227	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	378776137
67	NC_016811	GCTCTG	2	12	216632	216643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378776145
68	NC_016811	AATTGA	2	12	224023	224034	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	378776152
69	NC_016811	ATTGAT	2	12	224453	224464	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	378776152
70	NC_016811	TCACTG	2	12	232467	232478	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	378776157
71	NC_016811	TAGCGA	2	12	232621	232632	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	378776157
72	NC_016811	TTATAC	2	12	234075	234086	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	378776158
73	NC_016811	CCCTTG	2	12	236452	236463	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	378776160
74	NC_016811	AGAACA	2	12	238664	238675	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	378776163
75	NC_016811	TTCTAC	2	12	239347	239358	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	378776163
76	NC_016811	ATTCAA	2	12	246520	246531	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	378776169
77	NC_016811	ATTTTT	2	12	250252	250263	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	378776172
78	NC_016811	AGCTTG	2	12	250522	250533	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	378776172
79	NC_016811	CTCCTA	2	12	250891	250902	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	378776173
80	NC_016811	ACATGT	2	12	258474	258485	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	378776182
81	NC_016811	CCAAAA	2	12	259793	259804	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378776182
82	NC_016811	AAAATT	2	12	264003	264014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378776186
83	NC_016811	TGTCAT	2	12	266394	266405	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	378776188
84	NC_016811	AAAAGC	2	12	267289	267300	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	378776188
85	NC_016811	TGCCCA	2	12	273563	273574	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	378776191
86	NC_016811	CACTTC	2	12	273685	273696	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	378776191
87	NC_016811	CACTTT	2	12	277900	277911	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	378776194
88	NC_016811	TGAAAA	2	12	288340	288351	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	378776200
89	NC_016811	CAATAC	2	12	294047	294058	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	378776205
90	NC_016811	AGGGTC	2	12	295722	295733	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	378776205
91	NC_016811	TCTTTA	2	12	300491	300502	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	378776209
92	NC_016811	TTTAAT	2	12	301067	301078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378776210
93	NC_016811	TCCTGT	2	12	302033	302044	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	378776210
94	NC_016811	ATTTAA	2	12	306351	306362	50 %	50 %	0 %	0 %	378776215
95	NC_016811	TTTTTC	2	12	306526	306537	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	378776216
96	NC_016811	GATACC	2	12	308237	308248	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	378776217
97	NC_016811	TCAGTG	2	12	311756	311767	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	378776219
98	NC_016811	TTTATC	2	12	319921	319932	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	378776226
99	NC_016811	ATCAAT	2	12	322626	322637	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	378776229
100	NC_016811	ATAAAA	2	12	324549	324560	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	378776230
101	NC_016811	GAAAAA	2	12	327737	327748	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	378776234
102	NC_016811	ATGGAT	2	12	332646	332657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378776235
103	NC_016811	TGCCAT	2	12	335064	335075	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	378776237
104	NC_016811	AATTCC	2	12	335203	335214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378776237
105	NC_016811	TCATAA	2	12	335996	336007	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	378776237
106	NC_016811	TAAGCT	2	12	341467	341478	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	378776242
107	NC_016811	CAAAAA	2	12	343054	343065	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	378776243
108	NC_016811	TCCGCC	2	12	346275	346286	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	378776246
109	NC_016811	CAAGCT	2	12	351921	351932	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	378776251
110	NC_016811	CAAAAT	2	12	356163	356174	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	378776254
111	NC_016811	ATTTTA	2	12	357271	357282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378776255
112	NC_016811	CAGTTC	2	12	363611	363622	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	378776260
113	NC_016811	TTGAAG	2	12	372372	372383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378776264
114	NC_016811	AAAATT	2	12	380141	380152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378776269
115	NC_016811	GTGCCG	2	12	383437	383448	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	378776271
116	NC_016811	AGCGTT	2	12	384706	384717	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	378776272
117	NC_016811	GGTAAG	2	12	391372	391383	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	378776282
118	NC_016811	GCAAAA	2	12	391483	391494	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	378776282
119	NC_016811	GTAATT	2	12	392480	392491	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	378776286
120	NC_016811	AAAGCC	2	12	394686	394697	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	378776291
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220	NC_016811	AGCTTG	2	12	707500	707511	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	378776597
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226	NC_016811	TATGTT	2	12	725738	725749	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	378776615
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229	NC_016811	AGCAAA	2	12	753908	753919	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	378776634
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344	NC_016811	CCGCAT	2	12	1139253	1139264	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	378776988
345	NC_016811	TTGCTA	2	12	1145922	1145933	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	378776994
346	NC_016811	GATCCT	2	12	1147744	1147755	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	378776995
347	NC_016811	TGCCAT	2	12	1153137	1153148	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	378777000
348	NC_016811	TTGCTG	2	12	1153727	1153738	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	378777000
349	NC_016811	GCAAAA	2	12	1156486	1156497	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	378777001
350	NC_016811	GACCAT	2	12	1157376	1157387	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	378777002
351	NC_016811	TACGAG	2	12	1157509	1157520	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	378777002
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353	NC_016811	GCTGAT	2	12	1173965	1173976	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	378777015
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448	NC_016811	GGCAAA	2	12	1481603	1481614	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	378777282
449	NC_016811	TAAAAC	2	12	1492032	1492043	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	378777291
450	NC_016811	CAATGG	2	12	1494883	1494894	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	378777293
451	NC_016811	AACGCT	2	12	1501291	1501302	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	378777301
452	NC_016811	AAAAGA	2	12	1508703	1508714	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	378777309
453	NC_016811	GATTTT	2	12	1514578	1514589	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	378777314
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455	NC_016811	GACAAA	2	12	1521817	1521828	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	378777320
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