MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. SL1344

Total Repeats: 70613

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016810	CAG	2	6	64	69	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_016810	ACA	2	6	181	186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378697984
3	NC_016810	CAC	3	9	204	212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378697984
4	NC_016810	ACC	2	6	217	222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378697984
5	NC_016810	AAC	2	6	330	335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_016810	CGG	2	6	354	359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378697985
7	NC_016810	TGG	2	6	476	481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378697985
8	NC_016810	CGG	2	6	501	506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378697985
9	NC_016810	CTG	2	6	664	669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378697985
10	NC_016810	CGC	2	6	693	698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378697985
11	NC_016810	CGC	2	6	858	863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378697985
12	NC_016810	CCG	2	6	908	913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378697985
13	NC_016810	TGG	2	6	932	937	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378697985
14	NC_016810	CCG	3	9	965	973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378697985
15	NC_016810	GCC	2	6	979	984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378697985
16	NC_016810	CTG	2	6	999	1004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378697985
17	NC_016810	GCT	2	6	1068	1073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378697985
18	NC_016810	CGA	2	6	1233	1238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378697985
19	NC_016810	AAC	2	6	1273	1278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378697985
20	NC_016810	GAT	2	6	1317	1322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378697985
21	NC_016810	GGC	2	6	1329	1334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378697985
22	NC_016810	CGC	2	6	1344	1349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378697985
23	NC_016810	GGT	2	6	1371	1376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378697985
24	NC_016810	TCC	2	6	1390	1395	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378697985
25	NC_016810	CCG	2	6	1446	1451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378697985
26	NC_016810	GCT	2	6	1491	1496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378697985
27	NC_016810	TGT	2	6	1536	1541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378697985
28	NC_016810	TTC	2	6	1582	1587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378697985
29	NC_016810	TCT	2	6	1636	1641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378697985
30	NC_016810	TGG	2	6	1658	1663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378697985
31	NC_016810	ACG	2	6	1670	1675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378697985
32	NC_016810	CCA	2	6	1679	1684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378697985
33	NC_016810	CGG	2	6	1755	1760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378697985
34	NC_016810	CGG	2	6	1764	1769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378697985
35	NC_016810	GAA	2	6	1809	1814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378697985
36	NC_016810	GCG	2	6	1838	1843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378697985
37	NC_016810	ATC	2	6	1967	1972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378697985
38	NC_016810	TTG	2	6	1988	1993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378697985
39	NC_016810	ACT	2	6	2096	2101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378697985
40	NC_016810	CGC	3	9	2118	2126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378697985
41	NC_016810	CTG	2	6	2200	2205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378697985
42	NC_016810	TGA	2	6	2214	2219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378697985
43	NC_016810	GAC	2	6	2512	2517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378697985
44	NC_016810	GCC	2	6	2524	2529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378697985
45	NC_016810	TGA	2	6	2547	2552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378697985
46	NC_016810	TAT	2	6	2686	2691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378697985
47	NC_016810	TGC	2	6	2708	2713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378697985
48	NC_016810	ATG	2	6	2732	2737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378697985
49	NC_016810	CGG	3	9	2741	2749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378697985
50	NC_016810	AGC	2	6	2917	2922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378697986
51	NC_016810	GCC	2	6	2968	2973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378697986
52	NC_016810	CGT	2	6	3106	3111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378697986
53	NC_016810	CGC	2	6	3112	3117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378697986
54	NC_016810	GCA	2	6	3207	3212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378697986
55	NC_016810	TGA	2	6	3258	3263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378697986
56	NC_016810	GAA	2	6	3266	3271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378697986
57	NC_016810	ATT	2	6	3278	3283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378697986
58	NC_016810	CAG	2	6	3287	3292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378697986
59	NC_016810	TGA	2	6	3304	3309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378697986
60	NC_016810	GCC	2	6	3464	3469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378697986
61	NC_016810	TGA	2	6	3474	3479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378697986
62	NC_016810	CGG	2	6	3705	3710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378697986
63	NC_016810	AGT	2	6	3718	3723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378697986
64	NC_016810	CAG	2	6	3809	3814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378697987
65	NC_016810	TGA	2	6	3862	3867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378697987
66	NC_016810	GCA	2	6	3937	3942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378697987
67	NC_016810	CGG	2	6	4060	4065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378697987
68	NC_016810	GCG	2	6	4098	4103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378697987
69	NC_016810	GTC	2	6	4190	4195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378697987
70	NC_016810	GGC	2	6	4253	4258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378697987
71	NC_016810	TGA	2	6	4324	4329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378697987
72	NC_016810	GAA	2	6	4331	4336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378697987
73	NC_016810	GCC	2	6	4383	4388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378697987
74	NC_016810	CTA	2	6	4405	4410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378697987
75	NC_016810	GCT	2	6	4501	4506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378697987
76	NC_016810	CGC	2	6	4543	4548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378697987
77	NC_016810	GGA	2	6	4669	4674	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378697987
78	NC_016810	CCG	2	6	4681	4686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378697987
79	NC_016810	GCG	2	6	4718	4723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378697987
80	NC_016810	GAT	2	6	4727	4732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378697987
81	NC_016810	CAG	2	6	4742	4747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378697987
82	NC_016810	GCG	2	6	4793	4798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378697987
83	NC_016810	GCT	2	6	4954	4959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378697987
84	NC_016810	CAT	2	6	4964	4969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378697987
85	NC_016810	GCC	2	6	4985	4990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378697987
86	NC_016810	TGA	3	9	5001	5009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378697987
87	NC_016810	GTG	2	6	5062	5067	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016810	TCA	2	6	5163	5168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378697988
89	NC_016810	AAT	2	6	5228	5233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378697988
90	NC_016810	TCA	2	6	5242	5247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378697988
91	NC_016810	ACC	2	6	5277	5282	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378697988
92	NC_016810	TCA	2	6	5301	5306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378697988
93	NC_016810	TTC	2	6	5340	5345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378697988
94	NC_016810	CAC	3	9	5384	5392	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378697988
95	NC_016810	TGT	2	6	5568	5573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378697988
96	NC_016810	CGT	2	6	5593	5598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378697988
97	NC_016810	GCG	2	6	5755	5760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378697988
98	NC_016810	GCT	2	6	5788	5793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378697988
99	NC_016810	CGC	2	6	5931	5936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_016810	GCC	2	6	5979	5984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378697989
101	NC_016810	ACC	2	6	6096	6101	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378697989
102	NC_016810	CAA	2	6	6110	6115	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378697989
103	NC_016810	CGA	2	6	6301	6306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378697989
104	NC_016810	CAG	2	6	6437	6442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378697989
105	NC_016810	ATC	2	6	6447	6452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378697989
106	NC_016810	GAT	2	6	6467	6472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378697989
107	NC_016810	ACG	2	6	6535	6540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378697989
108	NC_016810	GCG	2	6	6862	6867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378697989
109	NC_016810	CGA	2	6	6940	6945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378697989
110	NC_016810	GCC	2	6	7013	7018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378697989
111	NC_016810	AGG	2	6	7078	7083	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378697989
112	NC_016810	ATG	2	6	7095	7100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378697989
113	NC_016810	GCG	2	6	7140	7145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378697989
114	NC_016810	GCC	2	6	7226	7231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378697989
115	NC_016810	AGC	2	6	7332	7337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378697989
116	NC_016810	TAA	2	6	7372	7377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378697989
117	NC_016810	TTG	2	6	7408	7413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016810	ATG	2	6	7453	7458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016810	GGT	2	6	7506	7511	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016810	CGT	2	6	7599	7604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_016810	ATC	2	6	7608	7613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_016810	CAC	2	6	7697	7702	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378697990
123	NC_016810	CAG	2	6	7845	7850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378697990
124	NC_016810	AGC	2	6	7851	7856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378697990
125	NC_016810	CAG	2	6	7866	7871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378697990
126	NC_016810	GTT	2	6	7872	7877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378697990
127	NC_016810	ATG	2	6	8023	8028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378697990
128	NC_016810	AAG	2	6	8107	8112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378697990
129	NC_016810	GCT	2	6	8132	8137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378697990
130	NC_016810	TAC	2	6	8298	8303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378697990
131	NC_016810	CGT	2	6	8324	8329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378697990
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258	NC_016810	ATG	2	6	16001	16006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
259	NC_016810	CCT	2	6	16022	16027	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
260	NC_016810	ATT	2	6	16055	16060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
261	NC_016810	TAT	2	6	16153	16158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378697998
262	NC_016810	ATA	2	6	16218	16223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378697998
263	NC_016810	GGC	2	6	16339	16344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378697998
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270	NC_016810	AAT	2	6	17000	17005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378697999
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277	NC_016810	ATT	2	6	17612	17617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
278	NC_016810	GTT	2	6	17704	17709	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
279	NC_016810	GTT	2	6	17728	17733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
280	NC_016810	ATC	2	6	17757	17762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
281	NC_016810	GAT	2	6	17769	17774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
282	NC_016810	ACT	2	6	17909	17914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378698001
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284	NC_016810	GAT	2	6	17948	17953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698001
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292	NC_016810	GCT	2	6	18625	18630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698001
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301	NC_016810	CGA	2	6	19387	19392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698001
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312	NC_016810	TCA	2	6	20125	20130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378698002
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374	NC_016810	TAA	2	6	24266	24271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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377	NC_016810	GAA	2	6	24399	24404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
378	NC_016810	CAG	2	6	24409	24414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
379	NC_016810	TGT	2	6	24521	24526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378698004
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