MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. SL1344

Total Repeats: 9670

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016810	AT	3	6	55	60	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016810	GC	3	6	575	580	0 %	0 %	50 %	50 %	378697985
3	NC_016810	CT	3	6	1105	1110	0 %	50 %	0 %	50 %	378697985
4	NC_016810	TG	3	6	1417	1422	0 %	50 %	50 %	0 %	378697985
5	NC_016810	GC	3	6	1436	1441	0 %	0 %	50 %	50 %	378697985
6	NC_016810	CT	3	6	2254	2259	0 %	50 %	0 %	50 %	378697985
7	NC_016810	TC	3	6	2292	2297	0 %	50 %	0 %	50 %	378697985
8	NC_016810	GC	3	6	2314	2319	0 %	0 %	50 %	50 %	378697985
9	NC_016810	CG	3	6	2345	2350	0 %	0 %	50 %	50 %	378697985
10	NC_016810	CG	4	8	3503	3510	0 %	0 %	50 %	50 %	378697986
11	NC_016810	GC	3	6	3558	3563	0 %	0 %	50 %	50 %	378697986
12	NC_016810	CG	3	6	3962	3967	0 %	0 %	50 %	50 %	378697987
13	NC_016810	CG	3	6	4206	4211	0 %	0 %	50 %	50 %	378697987
14	NC_016810	CG	3	6	4662	4667	0 %	0 %	50 %	50 %	378697987
15	NC_016810	AG	3	6	4882	4887	50 %	0 %	50 %	0 %	378697987
16	NC_016810	TG	3	6	5148	5153	0 %	50 %	50 %	0 %	378697988
17	NC_016810	CG	3	6	5251	5256	0 %	0 %	50 %	50 %	378697988
18	NC_016810	CG	3	6	5470	5475	0 %	0 %	50 %	50 %	378697988
19	NC_016810	AG	3	6	5552	5557	50 %	0 %	50 %	0 %	378697988
20	NC_016810	CG	3	6	5971	5976	0 %	0 %	50 %	50 %	378697989
21	NC_016810	GC	3	6	6889	6894	0 %	0 %	50 %	50 %	378697989
22	NC_016810	TC	3	6	7773	7778	0 %	50 %	0 %	50 %	378697990
23	NC_016810	CG	3	6	7860	7865	0 %	0 %	50 %	50 %	378697990
24	NC_016810	CG	3	6	7958	7963	0 %	0 %	50 %	50 %	378697990
25	NC_016810	CT	3	6	8451	8456	0 %	50 %	0 %	50 %	378697990
26	NC_016810	GC	3	6	8475	8480	0 %	0 %	50 %	50 %	378697990
27	NC_016810	TG	3	6	8901	8906	0 %	50 %	50 %	0 %	378697991
28	NC_016810	GC	3	6	9573	9578	0 %	0 %	50 %	50 %	378697992
29	NC_016810	CG	3	6	10533	10538	0 %	0 %	50 %	50 %	378697993
30	NC_016810	CG	3	6	12989	12994	0 %	0 %	50 %	50 %	378697995
31	NC_016810	GC	3	6	14550	14555	0 %	0 %	50 %	50 %	378697996
32	NC_016810	GA	3	6	14661	14666	50 %	0 %	50 %	0 %	378697996
33	NC_016810	AT	3	6	15372	15377	50 %	50 %	0 %	0 %	378697997
34	NC_016810	AT	3	6	15647	15652	50 %	50 %	0 %	0 %	378697997
35	NC_016810	AT	3	6	15900	15905	50 %	50 %	0 %	0 %	378697997
36	NC_016810	GA	3	6	17064	17069	50 %	0 %	50 %	0 %	378698000
37	NC_016810	GC	3	6	18366	18371	0 %	0 %	50 %	50 %	378698001
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39	NC_016810	GC	3	6	20656	20661	0 %	0 %	50 %	50 %	378698002
40	NC_016810	GC	3	6	20776	20781	0 %	0 %	50 %	50 %	378698002
41	NC_016810	GC	3	6	21181	21186	0 %	0 %	50 %	50 %	378698002
42	NC_016810	GC	3	6	22039	22044	0 %	0 %	50 %	50 %	378698002
43	NC_016810	CT	3	6	22794	22799	0 %	50 %	0 %	50 %	378698002
44	NC_016810	AT	3	6	23582	23587	50 %	50 %	0 %	0 %	378698003
45	NC_016810	CG	3	6	23652	23657	0 %	0 %	50 %	50 %	378698003
46	NC_016810	GC	4	8	23795	23802	0 %	0 %	50 %	50 %	378698003
47	NC_016810	AT	3	6	24056	24061	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016810	CG	3	6	25064	25069	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_016810	CT	3	6	25350	25355	0 %	50 %	0 %	50 %	378698005
50	NC_016810	AT	3	6	25380	25385	50 %	50 %	0 %	0 %	378698005
51	NC_016810	GC	3	6	26083	26088	0 %	0 %	50 %	50 %	378698006
52	NC_016810	CG	3	6	28013	28018	0 %	0 %	50 %	50 %	378698006
53	NC_016810	GC	3	6	28141	28146	0 %	0 %	50 %	50 %	378698006
54	NC_016810	GC	3	6	28177	28182	0 %	0 %	50 %	50 %	378698006
55	NC_016810	TC	3	6	28373	28378	0 %	50 %	0 %	50 %	378698006
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57	NC_016810	GT	3	6	28620	28625	0 %	50 %	50 %	0 %	378698007
58	NC_016810	CT	3	6	30105	30110	0 %	50 %	0 %	50 %	378698009
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60	NC_016810	CG	3	6	30431	30436	0 %	0 %	50 %	50 %	378698009
61	NC_016810	AT	3	6	30532	30537	50 %	50 %	0 %	0 %	378698010
62	NC_016810	GC	3	6	30763	30768	0 %	0 %	50 %	50 %	378698010
63	NC_016810	GC	3	6	31053	31058	0 %	0 %	50 %	50 %	378698010
64	NC_016810	GT	3	6	33041	33046	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016810	TC	3	6	33485	33490	0 %	50 %	0 %	50 %	378698014
66	NC_016810	AT	3	6	33735	33740	50 %	50 %	0 %	0 %	378698014
67	NC_016810	TA	3	6	33938	33943	50 %	50 %	0 %	0 %	378698014
68	NC_016810	AT	3	6	34434	34439	50 %	50 %	0 %	0 %	378698015
69	NC_016810	AT	3	6	34695	34700	50 %	50 %	0 %	0 %	378698015
70	NC_016810	AT	3	6	35441	35446	50 %	50 %	0 %	0 %	378698016
71	NC_016810	TG	4	8	35656	35663	0 %	50 %	50 %	0 %	378698016
72	NC_016810	GC	3	6	36249	36254	0 %	0 %	50 %	50 %	378698016
73	NC_016810	TA	3	6	37199	37204	50 %	50 %	0 %	0 %	378698017
74	NC_016810	AT	3	6	39515	39520	50 %	50 %	0 %	0 %	378698018
75	NC_016810	AT	3	6	39831	39836	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016810	AT	3	6	39946	39951	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016810	AT	5	10	40033	40042	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016810	AT	3	6	40089	40094	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016810	CG	3	6	40377	40382	0 %	0 %	50 %	50 %	378698019
80	NC_016810	CG	3	6	41065	41070	0 %	0 %	50 %	50 %	378698019
81	NC_016810	GT	3	6	41771	41776	0 %	50 %	50 %	0 %	378698020
82	NC_016810	TG	3	6	42801	42806	0 %	50 %	50 %	0 %	378698020
83	NC_016810	CG	3	6	43316	43321	0 %	0 %	50 %	50 %	378698021
84	NC_016810	TA	3	6	43689	43694	50 %	50 %	0 %	0 %	378698021
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86	NC_016810	CA	3	6	45002	45007	50 %	0 %	0 %	50 %	378698022
87	NC_016810	GC	3	6	45705	45710	0 %	0 %	50 %	50 %	378698022
88	NC_016810	TA	3	6	46110	46115	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016810	GA	3	6	46177	46182	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016810	TA	3	6	46809	46814	50 %	50 %	0 %	0 %	378698023
91	NC_016810	TG	3	6	47190	47195	0 %	50 %	50 %	0 %	378698023
92	NC_016810	GC	4	8	47329	47336	0 %	0 %	50 %	50 %	378698023
93	NC_016810	GA	3	6	47411	47416	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016810	GA	3	6	48243	48248	50 %	0 %	50 %	0 %	378698024
95	NC_016810	CG	4	8	49310	49317	0 %	0 %	50 %	50 %	378698025
96	NC_016810	CG	3	6	49523	49528	0 %	0 %	50 %	50 %	378698025
97	NC_016810	TG	3	6	50141	50146	0 %	50 %	50 %	0 %	378698025
98	NC_016810	GC	3	6	51209	51214	0 %	0 %	50 %	50 %	378698026
99	NC_016810	GC	3	6	51509	51514	0 %	0 %	50 %	50 %	378698026
100	NC_016810	GC	3	6	52512	52517	0 %	0 %	50 %	50 %	378698027
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102	NC_016810	CG	3	6	53265	53270	0 %	0 %	50 %	50 %	378698029
103	NC_016810	CG	3	6	54353	54358	0 %	0 %	50 %	50 %	378698030
104	NC_016810	GC	3	6	55026	55031	0 %	0 %	50 %	50 %	378698030
105	NC_016810	CG	3	6	55100	55105	0 %	0 %	50 %	50 %	378698030
106	NC_016810	CG	3	6	55834	55839	0 %	0 %	50 %	50 %	378698030
107	NC_016810	CG	3	6	56089	56094	0 %	0 %	50 %	50 %	378698030
108	NC_016810	GC	3	6	57008	57013	0 %	0 %	50 %	50 %	378698031
109	NC_016810	GC	3	6	57884	57889	0 %	0 %	50 %	50 %	378698033
110	NC_016810	GC	4	8	58114	58121	0 %	0 %	50 %	50 %	378698033
111	NC_016810	CT	3	6	59104	59109	0 %	50 %	0 %	50 %	378698034
112	NC_016810	TG	3	6	60723	60728	0 %	50 %	50 %	0 %	378698035
113	NC_016810	TC	3	6	61127	61132	0 %	50 %	0 %	50 %	378698036
114	NC_016810	GC	3	6	62389	62394	0 %	0 %	50 %	50 %	378698037
115	NC_016810	AT	3	6	63064	63069	50 %	50 %	0 %	0 %	378698037
116	NC_016810	GC	3	6	64585	64590	0 %	0 %	50 %	50 %	378698038
117	NC_016810	GC	3	6	66229	66234	0 %	0 %	50 %	50 %	378698039
118	NC_016810	CG	3	6	66326	66331	0 %	0 %	50 %	50 %	378698039
119	NC_016810	GC	3	6	66733	66738	0 %	0 %	50 %	50 %	378698040
120	NC_016810	AT	3	6	68157	68162	50 %	50 %	0 %	0 %	378698041
121	NC_016810	GC	3	6	69036	69041	0 %	0 %	50 %	50 %	378698042
122	NC_016810	GC	3	6	69613	69618	0 %	0 %	50 %	50 %	378698042
123	NC_016810	AC	3	6	69665	69670	50 %	0 %	0 %	50 %	378698042
124	NC_016810	AG	3	6	69811	69816	50 %	0 %	50 %	0 %	378698043
125	NC_016810	CG	3	6	69890	69895	0 %	0 %	50 %	50 %	378698043
126	NC_016810	GC	3	6	69918	69923	0 %	0 %	50 %	50 %	378698043
127	NC_016810	CG	3	6	70547	70552	0 %	0 %	50 %	50 %	378698044
128	NC_016810	CG	3	6	70827	70832	0 %	0 %	50 %	50 %	378698044
129	NC_016810	TG	3	6	71468	71473	0 %	50 %	50 %	0 %	378698045
130	NC_016810	GC	3	6	71979	71984	0 %	0 %	50 %	50 %	378698045
131	NC_016810	CG	3	6	72214	72219	0 %	0 %	50 %	50 %	378698045
132	NC_016810	GC	3	6	72286	72291	0 %	0 %	50 %	50 %	378698045
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134	NC_016810	CG	3	6	73324	73329	0 %	0 %	50 %	50 %	378698047
135	NC_016810	GC	3	6	73470	73475	0 %	0 %	50 %	50 %	378698047
136	NC_016810	TC	3	6	73857	73862	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_016810	GC	3	6	73966	73971	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
138	NC_016810	AT	3	6	74901	74906	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_016810	AT	3	6	75467	75472	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_016810	CT	3	6	76174	76179	0 %	50 %	0 %	50 %	378698049
141	NC_016810	GC	3	6	77342	77347	0 %	0 %	50 %	50 %	378698050
142	NC_016810	CG	3	6	77478	77483	0 %	0 %	50 %	50 %	378698050
143	NC_016810	CG	3	6	77954	77959	0 %	0 %	50 %	50 %	378698050
144	NC_016810	GC	5	10	79000	79009	0 %	0 %	50 %	50 %	378698050
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