MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. SL1344

Total Repeats: 1402

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016810	AT	3	6	55	60	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016810	AT	3	6	24056	24061	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016810	CG	3	6	25064	25069	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_016810	GT	3	6	33041	33046	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016810	AT	3	6	39831	39836	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016810	AT	3	6	39946	39951	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016810	AT	5	10	40033	40042	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016810	AT	3	6	40089	40094	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016810	TA	3	6	46110	46115	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016810	GA	3	6	46177	46182	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016810	GA	3	6	47411	47416	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016810	TC	3	6	73857	73862	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_016810	GC	3	6	73966	73971	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_016810	AT	3	6	74901	74906	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016810	AT	3	6	75467	75472	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016810	GT	4	8	84490	84497	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016810	TG	3	6	84565	84570	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016810	TG	3	6	88572	88577	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016810	GC	4	8	94606	94613	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_016810	CT	3	6	94725	94730	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_016810	AT	3	6	95828	95833	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016810	AT	3	6	116193	116198	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016810	CT	3	6	116718	116723	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_016810	AG	3	6	121343	121348	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016810	AC	3	6	122600	122605	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_016810	GC	4	8	126770	126777	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_016810	CT	4	8	139363	139370	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_016810	TC	3	6	148728	148733	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_016810	CG	3	6	148750	148755	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_016810	GA	4	8	155676	155683	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016810	CT	3	6	157898	157903	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_016810	CG	3	6	162181	162186	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_016810	GT	3	6	174821	174826	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016810	CG	3	6	183890	183895	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_016810	TC	3	6	184073	184078	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_016810	CG	3	6	185164	185169	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_016810	CA	3	6	185424	185429	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_016810	TC	3	6	185469	185474	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_016810	CT	3	6	189964	189969	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_016810	TG	3	6	200666	200671	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016810	AT	3	6	202139	202144	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016810	AT	4	8	209079	209086	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016810	GT	3	6	209224	209229	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016810	AG	3	6	215343	215348	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016810	GA	3	6	220843	220848	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016810	GC	3	6	229939	229944	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_016810	TA	3	6	230297	230302	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016810	TG	3	6	230605	230610	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016810	TA	3	6	231273	231278	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016810	AT	3	6	247260	247265	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016810	AC	3	6	247305	247310	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_016810	CT	3	6	252953	252958	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_016810	GC	3	6	254120	254125	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_016810	AC	3	6	254151	254156	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_016810	AC	4	8	254193	254200	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_016810	CT	3	6	256168	256173	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_016810	TG	3	6	257096	257101	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016810	CG	3	6	259255	259260	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_016810	CT	3	6	278696	278701	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_016810	CA	3	6	288913	288918	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_016810	TG	3	6	289053	289058	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016810	AC	3	6	290394	290399	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_016810	AC	3	6	290563	290568	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_016810	CA	3	6	290739	290744	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_016810	TC	3	6	291169	291174	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_016810	TG	3	6	291510	291515	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016810	GC	3	6	291537	291542	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_016810	AC	3	6	292268	292273	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_016810	GT	3	6	292625	292630	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016810	GT	4	8	292888	292895	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016810	GA	3	6	293060	293065	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016810	GT	3	6	294255	294260	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016810	AG	3	6	294677	294682	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_016810	TA	3	6	311124	311129	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016810	TG	3	6	336539	336544	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016810	TA	3	6	338101	338106	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016810	AG	3	6	338161	338166	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016810	TC	3	6	340136	340141	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_016810	CT	3	6	341341	341346	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_016810	AT	3	6	341529	341534	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016810	GA	3	6	345567	345572	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016810	CA	3	6	348017	348022	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_016810	GC	3	6	351046	351051	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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86	NC_016810	GC	3	6	357228	357233	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
87	NC_016810	AT	3	6	358536	358541	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016810	TA	3	6	358640	358645	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016810	GC	3	6	359143	359148	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
90	NC_016810	CG	3	6	359197	359202	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
91	NC_016810	CG	3	6	359366	359371	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
92	NC_016810	AC	3	6	368258	368263	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_016810	GC	3	6	369888	369893	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
94	NC_016810	TC	3	6	370209	370214	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_016810	TA	3	6	370657	370662	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016810	TA	3	6	370676	370681	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016810	GT	3	6	372133	372138	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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99	NC_016810	CA	3	6	377617	377622	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_016810	TA	3	6	378003	378008	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_016810	TC	3	6	384692	384697	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_016810	TC	3	6	386502	386507	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_016810	AT	3	6	388206	388211	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016810	AT	3	6	389739	389744	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016810	TG	3	6	389817	389822	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016810	TA	3	6	389848	389853	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016810	AT	3	6	391852	391857	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016810	GC	5	10	391867	391876	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
109	NC_016810	GC	3	6	397646	397651	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
110	NC_016810	CA	3	6	400869	400874	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_016810	TA	3	6	401249	401254	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016810	TA	4	8	408231	408238	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016810	GC	3	6	423143	423148	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114	NC_016810	TA	3	6	424263	424268	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016810	TC	3	6	427594	427599	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_016810	GC	3	6	432200	432205	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
117	NC_016810	TA	3	6	434940	434945	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016810	AT	3	6	436346	436351	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016810	TA	3	6	437133	437138	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016810	TG	3	6	439570	439575	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_016810	GC	3	6	445584	445589	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
122	NC_016810	AG	3	6	465174	465179	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_016810	AT	3	6	465958	465963	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_016810	CG	3	6	468140	468145	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125	NC_016810	AG	3	6	470513	470518	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016810	CT	3	6	477158	477163	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_016810	TG	3	6	489452	489457	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_016810	GC	3	6	489672	489677	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_016810	AT	3	6	498013	498018	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_016810	TA	3	6	501014	501019	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016810	GC	3	6	503384	503389	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
132	NC_016810	TA	3	6	503466	503471	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_016810	TG	3	6	504924	504929	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_016810	GA	3	6	505017	505022	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_016810	CA	3	6	520358	520363	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_016810	CG	3	6	527441	527446	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
137	NC_016810	CG	3	6	537389	537394	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
138	NC_016810	GC	3	6	537405	537410	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
139	NC_016810	AT	3	6	539722	539727	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_016810	AG	3	6	540311	540316	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_016810	AG	5	10	542356	542365	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_016810	GC	3	6	548424	548429	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
143	NC_016810	GC	3	6	549811	549816	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
144	NC_016810	GA	3	6	553113	553118	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_016810	GC	3	6	554803	554808	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
146	NC_016810	TA	3	6	557360	557365	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_016810	GC	3	6	563480	563485	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
148	NC_016810	AG	3	6	563495	563500	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_016810	CT	3	6	564365	564370	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_016810	GC	3	6	564405	564410	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
151	NC_016810	AC	3	6	570416	570421	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
152	NC_016810	AC	3	6	570451	570456	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
153	NC_016810	AT	3	6	590763	590768	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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