MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Haemophilus influenzae 10810

Total Repeats: 97

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016809	GTTCTG	2	12	6502	6513	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_016809	AAATAA	2	12	7367	7378	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016809	AACTGG	2	12	8085	8096	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_016809	CACAAC	2	12	8416	8427	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_016809	GAAAAA	2	12	10402	10413	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016809	GCCTTT	2	12	95162	95173	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_016809	CTTTTC	2	12	96418	96429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_016809	TTTTGA	2	12	128875	128886	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016809	AAAATA	2	12	137043	137054	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016809	TAAGAT	2	12	138986	138997	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016809	TAAAGT	2	12	174920	174931	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016809	ATTTAG	2	12	175338	175349	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016809	ATTTCA	2	12	176603	176614	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_016809	CTTTCG	2	12	178575	178586	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_016809	AACCCC	2	12	180014	180025	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_016809	GCCTTC	2	12	180123	180134	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
17	NC_016809	TGAAAA	2	12	185931	185942	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016809	AAAATT	2	12	202338	202349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016809	AAAAAT	2	12	240499	240510	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016809	ATCCCC	2	12	282215	282226	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_016809	CAGGAA	2	12	282627	282638	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_016809	ATTTAA	2	12	287171	287182	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016809	ATTTCA	2	12	292163	292174	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_016809	CTTTCG	2	12	294135	294146	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_016809	AATTAA	4	24	294683	294706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016809	AACCCC	2	12	295831	295842	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_016809	GCCTTC	2	12	295940	295951	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
28	NC_016809	CATCGT	13	78	371873	371950	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_016809	CATTGA	2	12	396386	396397	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_016809	TTACGT	2	12	405349	405360	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_016809	TAAATT	2	12	418196	418207	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016809	TAAGGT	2	12	424408	424419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016809	CTTTTT	2	12	454209	454220	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_016809	ATTTTT	2	12	517051	517062	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016809	AAAAAT	2	12	532066	532077	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016809	TTTTTA	2	12	532109	532120	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016809	AAAAAC	2	12	567915	567926	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_016809	ATAAAA	2	12	637687	637698	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016809	ATAAAA	2	12	674834	674845	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016809	TAAATT	2	12	723410	723421	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016809	TTTATT	2	12	729952	729963	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016809	CGAAGG	2	12	733072	733083	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_016809	GGGGTT	2	12	733182	733193	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016809	AGCGAA	2	12	734619	734630	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_016809	TGAAAT	2	12	736593	736604	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016809	CGAAGG	2	12	766579	766590	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_016809	GGGGTT	2	12	766689	766700	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016809	AGCGAA	2	12	768126	768137	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_016809	TGAAAT	2	12	770100	770111	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016809	TAATTT	2	12	771439	771450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016809	CGAAGG	2	12	877812	877823	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_016809	GGGGTT	2	12	877922	877933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016809	TTTAAT	4	24	879057	879080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016809	AGCGAA	2	12	879616	879627	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_016809	TGAAAT	2	12	881590	881601	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016809	GTTTTT	2	12	882899	882910	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016809	ATAACG	2	12	929941	929952	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_016809	TAACTA	2	12	930184	930195	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_016809	GATTGG	2	12	948695	948706	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016809	GAGGAT	2	12	949428	949439	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016809	TCTTTT	2	12	949529	949540	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_016809	GCTAAA	2	12	976161	976172	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_016809	TCATTT	2	12	978485	978496	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_016809	TAACTT	2	12	1006393	1006404	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_016809	TGAAAT	2	12	1007320	1007331	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016809	TTTTTC	2	12	1021544	1021555	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_016809	TTAATT	2	12	1038218	1038229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016809	CAAGCT	2	12	1138212	1138223	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_016809	TAATGA	2	12	1160240	1160251	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016809	CTTGAA	2	12	1168786	1168797	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_016809	TTTATA	2	12	1174636	1174647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016809	ACCTCG	2	12	1189102	1189113	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
73	NC_016809	ACCTCG	2	12	1207226	1207237	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
74	NC_016809	ATATTC	2	12	1234779	1234790	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_016809	ATTGGG	2	12	1250211	1250222	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016809	TACTTT	2	12	1323672	1323683	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_016809	CTTTTG	2	12	1377620	1377631	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_016809	TTGTAA	2	12	1407764	1407775	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016809	ATTTTT	2	12	1522404	1522415	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016809	ATTTAC	2	12	1588754	1588765	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_016809	ACTTTT	2	12	1622697	1622708	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_016809	TTTTAT	2	12	1644608	1644619	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016809	TAAAAT	2	12	1685004	1685015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016809	TTAATC	2	12	1698407	1698418	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_016809	AAATTG	2	12	1698745	1698756	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016809	ATCATT	2	12	1713003	1713014	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_016809	TAAAAT	2	12	1720595	1720606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016809	TAGGTA	2	12	1787497	1787508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016809	TAAAGA	2	12	1866204	1866215	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016809	TCTAAA	2	12	1925602	1925613	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_016809	AGGTTT	2	12	1960346	1960357	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016809	TAAAAA	2	12	1965440	1965451	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016809	ATTTCA	2	12	1968995	1969006	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_016809	CTTTCG	2	12	1970967	1970978	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_016809	AATTAA	4	24	1971515	1971538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016809	AACCCC	2	12	1972663	1972674	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_016809	GCCTTC	2	12	1972772	1972783	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.