MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Haemophilus influenzae 10810

Total Repeats: 770

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016809	TTTCCT	2	12	4606	4617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378696084
2	NC_016809	TCTAGC	2	12	9561	9572	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	378696085
3	NC_016809	TGGCAA	2	12	14495	14506	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	378696092
4	NC_016809	AAACCA	2	12	16848	16859	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378696094
5	NC_016809	CACGCT	2	12	17710	17721	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	378696094
6	NC_016809	TACGTT	2	12	18181	18192	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	378696095
7	NC_016809	AAGATG	2	12	25494	25505	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	378696100
8	NC_016809	AAGCGA	2	12	26222	26233	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	378696101
9	NC_016809	AATCCA	2	12	26411	26422	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	378696101
10	NC_016809	ACCAAA	2	12	34129	34140	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378696110
11	NC_016809	TTTACT	2	12	41542	41553	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	378696116
12	NC_016809	TACTTT	2	12	42069	42080	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	378696116
13	NC_016809	CTTGTA	2	12	42442	42453	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	378696117
14	NC_016809	AAAGCA	2	12	45965	45976	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	378696121
15	NC_016809	TGGAAT	2	12	56126	56137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378696129
16	NC_016809	TCTAAA	2	12	56998	57009	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	378696130
17	NC_016809	TGCCAA	2	12	58478	58489	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	378696131
18	NC_016809	TTAGAT	2	12	62983	62994	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	378696134
19	NC_016809	ATCAAG	2	12	68706	68717	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	378696139
20	NC_016809	TGCGCC	2	12	70272	70283	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	378696139
21	NC_016809	AGAACA	2	12	73720	73731	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	378696142
22	NC_016809	CAAGAT	2	12	74521	74532	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	378696143
23	NC_016809	CAAATT	2	12	74945	74956	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	378696144
24	NC_016809	TTTGGT	2	12	76267	76278	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378696145
25	NC_016809	ATTAAA	2	12	82561	82572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378696151
26	NC_016809	TGGGCT	2	12	83280	83291	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	378696152
27	NC_016809	TGATAC	2	12	87822	87833	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	378696157
28	NC_016809	TAAAAA	2	12	89894	89905	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	378696159
29	NC_016809	GCCACA	2	12	90890	90901	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	378696159
30	NC_016809	TTAATT	2	12	92048	92059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378696160
31	NC_016809	CTCTAT	2	12	93952	93963	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	378696162
32	NC_016809	GTTCTC	2	12	95896	95907	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	378696165
33	NC_016809	TAATTA	2	12	105889	105900	50 %	50 %	0 %	0 %	378696176
34	NC_016809	GAAGAT	2	12	108262	108273	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	378696177
35	NC_016809	AGAGCA	2	12	109564	109575	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	378696180
36	NC_016809	GGGATT	2	12	111452	111463	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	378696184
37	NC_016809	ATTGAT	2	12	113736	113747	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	378696186
38	NC_016809	AATCCA	2	12	115047	115058	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	378696188
39	NC_016809	ATGAAG	2	12	116119	116130	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	378696188
40	NC_016809	TGGTTA	2	12	116697	116708	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	378696188
41	NC_016809	CCTAAT	2	12	117109	117120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378696188
42	NC_016809	TTTTAT	2	12	117605	117616	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	378696190
43	NC_016809	GCAAAA	2	12	117790	117801	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	378696190
44	NC_016809	CCAGCG	2	12	122032	122043	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	378696193
45	NC_016809	ATATTG	2	12	125994	126005	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	378696198
46	NC_016809	CATTAT	2	12	130014	130025	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	378696203
47	NC_016809	TGAACC	2	12	132152	132163	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	378696206
48	NC_016809	ATAAAG	2	12	141190	141201	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	378696220
49	NC_016809	CTTCAA	2	12	146561	146572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378696224
50	NC_016809	AGTTCA	2	12	146581	146592	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	378696224
51	NC_016809	TTCGCC	2	12	163026	163037	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	378696239
52	NC_016809	ACACGC	2	12	163309	163320	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	378696239
53	NC_016809	CTTGAA	2	12	163832	163843	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	378696240
54	NC_016809	AATTCC	2	12	182411	182422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378696251
55	NC_016809	GTAATC	2	12	184737	184748	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	378696252
56	NC_016809	ATTGGC	2	12	185194	185205	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	378696253
57	NC_016809	CAAATT	2	12	185575	185586	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	378696253
58	NC_016809	GATCAT	2	12	186412	186423	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	378696254
59	NC_016809	GACCAT	2	12	186460	186471	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	378696254
60	NC_016809	ACGACC	2	12	186494	186505	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	378696254
61	NC_016809	CTAAAA	2	12	187201	187212	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	378696255
62	NC_016809	ATATCA	2	12	190174	190185	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	378696257
63	NC_016809	TGCATC	2	12	195084	195095	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	378696262
64	NC_016809	AAAAAC	2	12	196703	196714	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	378696264
65	NC_016809	CTTATA	2	12	198144	198155	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	378696265
66	NC_016809	GGCGCA	2	12	198500	198511	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	378696265
67	NC_016809	ACGTTT	2	12	198764	198775	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	378696266
68	NC_016809	CAATAA	2	12	200074	200085	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	378696266
69	NC_016809	CTAGAA	2	12	203472	203483	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	378696269
70	NC_016809	GAAAAA	2	12	203513	203524	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	378696269
71	NC_016809	CTTTTG	2	12	206157	206168	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	378696272
72	NC_016809	CACCAA	2	12	210422	210433	50 %	0 %	0 %	50 %	378696276
73	NC_016809	TGTTAA	2	12	214491	214502	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	378696279
74	NC_016809	GGCTGA	2	12	215636	215647	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	378696281
75	NC_016809	TTCGTT	2	12	218171	218182	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	378696283
76	NC_016809	TAAAAA	2	12	219010	219021	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	378696283
77	NC_016809	AATATC	2	12	220215	220226	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	378696285
78	NC_016809	ACCTTT	2	12	220296	220307	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	378696285
79	NC_016809	GCATTA	2	12	227520	227531	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	378696293
80	NC_016809	CAACCT	2	12	230159	230170	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	378696295
81	NC_016809	TTGGCA	2	12	230217	230228	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	378696295
82	NC_016809	TTAGTG	2	12	232504	232515	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	378696299
83	NC_016809	TAAACG	3	18	237474	237491	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	378696304
84	NC_016809	ATCTTT	2	12	241160	241171	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	378696308
85	NC_016809	TTCAGT	2	12	241925	241936	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	378696308
86	NC_016809	ACGACC	2	12	242297	242308	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	378696308
87	NC_016809	AAATCT	2	12	242967	242978	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	378696309
88	NC_016809	CATAAT	2	12	243116	243127	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	378696309
89	NC_016809	TAAAGT	2	12	243416	243427	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	378696309
90	NC_016809	GAATTT	2	12	245321	245332	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	378696311
91	NC_016809	TGTACT	2	12	246275	246286	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	378696311
92	NC_016809	GCAGAA	2	12	250292	250303	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	378696316
93	NC_016809	TTGCTT	2	12	250818	250829	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	378696317
94	NC_016809	GCAAGT	2	12	251796	251807	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	378696318
95	NC_016809	TCTGGT	2	12	252292	252303	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	378696318
96	NC_016809	CAGCAA	2	12	257748	257759	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	378696324
97	NC_016809	TTTAAA	2	12	258483	258494	50 %	50 %	0 %	0 %	378696324
98	NC_016809	CGCCAG	2	12	264037	264048	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	378696328
99	NC_016809	TTGGTA	2	12	264706	264717	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	378696329
100	NC_016809	TTGTTC	2	12	265636	265647	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	378696330
101	NC_016809	ATCAAC	2	12	274228	274239	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	378696340
102	NC_016809	TTTCAT	2	12	274376	274387	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	378696340
103	NC_016809	TATGTC	2	12	277881	277892	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	378696344
104	NC_016809	AAAAAC	2	12	278900	278911	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	378696344
105	NC_016809	TTGCGC	2	12	281322	281333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378696345
106	NC_016809	CAACAT	2	12	288807	288818	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	378696348
107	NC_016809	AGGTGC	2	12	298737	298748	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	378696351
108	NC_016809	TTACTA	2	12	299489	299500	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	378696351
109	NC_016809	GGCAAC	2	12	313234	313245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378696368
110	NC_016809	AAATTG	2	12	314863	314874	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	378696369
111	NC_016809	CATTTG	2	12	317889	317900	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	378696374
112	NC_016809	TCAATA	2	12	318598	318609	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	378696374
113	NC_016809	TCTTCA	2	12	321948	321959	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	378696376
114	NC_016809	TTTGTT	2	12	322291	322302	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	378696376
115	NC_016809	TGCCTA	2	12	324385	324396	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	378696379
116	NC_016809	TAATTT	2	12	326239	326250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378696380
117	NC_016809	GTAATA	2	12	327329	327340	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	378696380
118	NC_016809	TTCCTT	2	12	327831	327842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378696380
119	NC_016809	AGTTAA	2	12	328006	328017	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	378696380
120	NC_016809	TACCAT	2	12	328323	328334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378696380
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232	NC_016809	CTTGGG	2	12	652879	652890	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	378696718
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343	NC_016809	TTTTAC	2	12	905350	905361	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	378696941
344	NC_016809	GCAGAA	2	12	905921	905932	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	378696942
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459	NC_016809	TATGGG	2	12	1181239	1181250	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	378697217
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