MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Haemophilus influenzae 10810

Total Repeats: 1574

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016809	CGTAT	2	10	44	53	20 %	40 %	20 %	20 %	378696080
2	NC_016809	CGCAC	2	10	3259	3268	20 %	0 %	20 %	60 %	378696082
3	NC_016809	ATTCT	2	10	4318	4327	20 %	60 %	0 %	20 %	378696083
4	NC_016809	TAAAA	2	10	4761	4770	80 %	20 %	0 %	0 %	378696084
5	NC_016809	TGCAC	2	10	9062	9071	20 %	20 %	20 %	40 %	378696085
6	NC_016809	TATTG	2	10	9172	9181	20 %	60 %	20 %	0 %	378696085
7	NC_016809	AATTT	2	10	10881	10890	40 %	60 %	0 %	0 %	378696087
8	NC_016809	ATTTG	2	10	13124	13133	20 %	60 %	20 %	0 %	378696090
9	NC_016809	TTATT	2	10	15006	15015	20 %	80 %	0 %	0 %	378696093
10	NC_016809	AATCA	2	10	16769	16778	60 %	20 %	0 %	20 %	378696094
11	NC_016809	ACCCA	2	10	17088	17097	40 %	0 %	0 %	60 %	378696094
12	NC_016809	AAAAC	2	10	17977	17986	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_016809	ACCAA	2	10	18862	18871	60 %	0 %	0 %	40 %	378696096
14	NC_016809	TTAAA	2	10	21131	21140	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016809	AATAC	2	10	21748	21757	60 %	20 %	0 %	20 %	378696098
16	NC_016809	CAATT	2	10	25965	25974	40 %	40 %	0 %	20 %	378696101
17	NC_016809	AACAT	2	10	28002	28011	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_016809	CTTTT	2	10	30007	30016	0 %	80 %	0 %	20 %	378696106
19	NC_016809	ATAAA	2	10	30180	30189	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016809	AAAAT	2	10	32653	32662	80 %	20 %	0 %	0 %	378696109
21	NC_016809	TAAAC	2	10	33712	33721	60 %	20 %	0 %	20 %	378696110
22	NC_016809	CAATC	2	10	36020	36029	40 %	20 %	0 %	40 %	378696112
23	NC_016809	AAGAA	2	10	36701	36710	80 %	0 %	20 %	0 %	378696113
24	NC_016809	TTACC	2	10	39465	39474	20 %	40 %	0 %	40 %	378696114
25	NC_016809	TGGTA	2	10	41013	41022	20 %	40 %	40 %	0 %	378696115
26	NC_016809	CCCCT	2	10	41295	41304	0 %	20 %	0 %	80 %	378696116
27	NC_016809	AATGC	2	10	43714	43723	40 %	20 %	20 %	20 %	378696119
28	NC_016809	ATTTT	2	10	45200	45209	20 %	80 %	0 %	0 %	378696121
29	NC_016809	GCCAA	2	10	46040	46049	40 %	0 %	20 %	40 %	378696121
30	NC_016809	TTCCA	2	10	46656	46665	20 %	40 %	0 %	40 %	378696122
31	NC_016809	CTTAA	2	10	49051	49060	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_016809	TTGTT	2	10	49212	49221	0 %	80 %	20 %	0 %	378696125
33	NC_016809	TCAAA	2	10	50471	50480	60 %	20 %	0 %	20 %	378696125
34	NC_016809	AATCA	2	10	51975	51984	60 %	20 %	0 %	20 %	378696126
35	NC_016809	AATGC	2	10	52593	52602	40 %	20 %	20 %	20 %	378696127
36	NC_016809	CCTGC	2	10	52659	52668	0 %	20 %	20 %	60 %	378696127
37	NC_016809	TAAAT	2	10	59026	59035	60 %	40 %	0 %	0 %	378696131
38	NC_016809	ATTTT	2	10	63758	63767	20 %	80 %	0 %	0 %	378696136
39	NC_016809	GCCTT	2	10	67518	67527	0 %	40 %	20 %	40 %	378696138
40	NC_016809	TGAAA	2	10	68863	68872	60 %	20 %	20 %	0 %	378696139
41	NC_016809	TGCAG	2	10	71910	71919	20 %	20 %	40 %	20 %	378696140
42	NC_016809	ATTTA	2	10	72654	72663	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016809	AGGTA	2	10	72848	72857	40 %	20 %	40 %	0 %	378696141
44	NC_016809	CAACG	2	10	75767	75776	40 %	0 %	20 %	40 %	378696145
45	NC_016809	AGAAA	2	10	77127	77136	80 %	0 %	20 %	0 %	378696145
46	NC_016809	TTGTT	2	10	79247	79256	0 %	80 %	20 %	0 %	378696148
47	NC_016809	ACATC	2	10	81999	82008	40 %	20 %	0 %	40 %	378696150
48	NC_016809	TTACA	2	10	82535	82544	40 %	40 %	0 %	20 %	378696151
49	NC_016809	TGATT	2	10	83325	83334	20 %	60 %	20 %	0 %	378696152
50	NC_016809	AATTT	2	10	83483	83492	40 %	60 %	0 %	0 %	378696152
51	NC_016809	GCACC	2	10	86394	86403	20 %	0 %	20 %	60 %	378696156
52	NC_016809	CACAT	2	10	86623	86632	40 %	20 %	0 %	40 %	378696156
53	NC_016809	CTTCT	2	10	87693	87702	0 %	60 %	0 %	40 %	378696157
54	NC_016809	CGTTA	2	10	90026	90035	20 %	40 %	20 %	20 %	378696159
55	NC_016809	CGTTA	2	10	92149	92158	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
56	NC_016809	AATTA	2	10	92266	92275	60 %	40 %	0 %	0 %	378696161
57	NC_016809	TGGCA	2	10	92381	92390	20 %	20 %	40 %	20 %	378696161
58	NC_016809	CAGTA	2	10	93043	93052	40 %	20 %	20 %	20 %	378696161
59	NC_016809	GTACT	2	10	93078	93087	20 %	40 %	20 %	20 %	378696161
60	NC_016809	GTGAA	2	10	93230	93239	40 %	20 %	40 %	0 %	378696161
61	NC_016809	TGAAG	2	10	96522	96531	40 %	20 %	40 %	0 %	378696166
62	NC_016809	TTTGC	2	10	97769	97778	0 %	60 %	20 %	20 %	378696167
63	NC_016809	CTTTG	2	10	97964	97973	0 %	60 %	20 %	20 %	378696167
64	NC_016809	CTTTT	2	10	99685	99694	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_016809	GCCTT	2	10	99826	99835	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
66	NC_016809	GATTG	2	10	102070	102079	20 %	40 %	40 %	0 %	378696171
67	NC_016809	GATTG	2	10	102391	102400	20 %	40 %	40 %	0 %	378696171
68	NC_016809	CTTTT	2	10	103279	103288	0 %	80 %	0 %	20 %	378696172
69	NC_016809	TCAAA	2	10	105509	105518	60 %	20 %	0 %	20 %	378696175
70	NC_016809	TCTTT	2	10	108601	108610	0 %	80 %	0 %	20 %	378696178
71	NC_016809	ACTTT	2	10	110139	110148	20 %	60 %	0 %	20 %	378696182
72	NC_016809	TATTC	2	10	111655	111664	20 %	60 %	0 %	20 %	378696185
73	NC_016809	GCGGT	2	10	111732	111741	0 %	20 %	60 %	20 %	378696185
74	NC_016809	TTTCT	2	10	112485	112494	0 %	80 %	0 %	20 %	378696186
75	NC_016809	TTGCC	2	10	118323	118332	0 %	40 %	20 %	40 %	378696191
76	NC_016809	TAATA	2	10	119454	119463	60 %	40 %	0 %	0 %	378696192
77	NC_016809	TGATC	2	10	121001	121010	20 %	40 %	20 %	20 %	378696193
78	NC_016809	TTTAA	2	10	124593	124602	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016809	GCCTT	2	10	129012	129021	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
80	NC_016809	ATTTT	2	10	129476	129485	20 %	80 %	0 %	0 %	378696201
81	NC_016809	TATAT	2	10	132342	132351	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016809	ATGTT	2	10	132905	132914	20 %	60 %	20 %	0 %	378696207
83	NC_016809	AACAA	2	10	134872	134881	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_016809	CTTCC	2	10	135154	135163	0 %	40 %	0 %	60 %	378696211
85	NC_016809	ATTTC	2	10	136664	136673	20 %	60 %	0 %	20 %	378696215
86	NC_016809	AAATG	2	10	137404	137413	60 %	20 %	20 %	0 %	378696217
87	NC_016809	TTTTG	2	10	139534	139543	0 %	80 %	20 %	0 %	378696219
88	NC_016809	GTCGA	2	10	141670	141679	20 %	20 %	40 %	20 %	378696220
89	NC_016809	TAAAA	2	10	143881	143890	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016809	ATGCC	2	10	147671	147680	20 %	20 %	20 %	40 %	378696224
91	NC_016809	AAATT	2	10	149791	149800	60 %	40 %	0 %	0 %	378696226
92	NC_016809	CTTGC	2	10	150704	150713	0 %	40 %	20 %	40 %	378696226
93	NC_016809	GCAAT	2	10	151398	151407	40 %	20 %	20 %	20 %	378696227
94	NC_016809	CCAAT	2	10	154836	154845	40 %	20 %	0 %	40 %	378696231
95	NC_016809	CAATT	2	10	155134	155143	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_016809	GTTTT	2	10	155512	155521	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016809	TACGC	2	10	158888	158897	20 %	20 %	20 %	40 %	378696235
98	NC_016809	GCAAA	2	10	159559	159568	60 %	0 %	20 %	20 %	378696236
99	NC_016809	TGGAT	2	10	160564	160573	20 %	40 %	40 %	0 %	378696237
100	NC_016809	TGTAA	2	10	162201	162210	40 %	40 %	20 %	0 %	378696239
101	NC_016809	GGTTG	2	10	165728	165737	0 %	40 %	60 %	0 %	378696241
102	NC_016809	AGGCA	2	10	165886	165895	40 %	0 %	40 %	20 %	378696241
103	NC_016809	GTATT	2	10	168415	168424	20 %	60 %	20 %	0 %	378696244
104	NC_016809	GCTTT	2	10	168539	168548	0 %	60 %	20 %	20 %	378696245
105	NC_016809	GCAAA	2	10	172226	172235	60 %	0 %	20 %	20 %	378696250
106	NC_016809	AATGG	2	10	172439	172448	40 %	20 %	40 %	0 %	378696250
107	NC_016809	GCACT	2	10	172716	172725	20 %	20 %	20 %	40 %	378696250
108	NC_016809	GTTAT	2	10	173928	173937	20 %	60 %	20 %	0 %	378696250
109	NC_016809	AAACT	2	10	174719	174728	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_016809	TTAAT	2	10	175304	175313	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016809	TAACC	2	10	177182	177191	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
112	NC_016809	CGACT	2	10	177623	177632	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
113	NC_016809	TCGGT	2	10	177998	178007	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
114	NC_016809	TCGCT	2	10	178225	178234	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
115	NC_016809	GTTTT	2	10	178963	178972	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016809	GCTTC	2	10	179593	179602	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
117	NC_016809	TTCAA	2	10	180847	180856	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
118	NC_016809	AAGAT	2	10	181120	181129	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016809	ATCAA	2	10	181730	181739	60 %	20 %	0 %	20 %	378696251
120	NC_016809	AAATC	2	10	182912	182921	60 %	20 %	0 %	20 %	378696251
121	NC_016809	CAAAG	2	10	183443	183452	60 %	0 %	20 %	20 %	378696251
122	NC_016809	AAAAG	2	10	183677	183686	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_016809	AATTG	2	10	183827	183836	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_016809	AAAAG	2	10	189178	189187	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_016809	TAACT	2	10	190889	190898	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_016809	AAAAC	2	10	191496	191505	80 %	0 %	0 %	20 %	378696258
127	NC_016809	AAATA	2	10	192239	192248	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_016809	GCAGT	2	10	195299	195308	20 %	20 %	40 %	20 %	378696262
129	NC_016809	TCTTT	2	10	196330	196339	0 %	80 %	0 %	20 %	378696264
130	NC_016809	AAATT	2	10	197055	197064	60 %	40 %	0 %	0 %	378696264
131	NC_016809	ACAAA	2	10	197153	197162	80 %	0 %	0 %	20 %	378696264
132	NC_016809	GAATG	2	10	197293	197302	40 %	20 %	40 %	0 %	378696264
133	NC_016809	TTTTG	2	10	199903	199912	0 %	80 %	20 %	0 %	378696266
134	NC_016809	AAAGA	2	10	200317	200326	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_016809	TTTCA	2	10	204438	204447	20 %	60 %	0 %	20 %	378696270
136	NC_016809	TAAAT	2	10	207111	207120	60 %	40 %	0 %	0 %	378696273
137	NC_016809	TTTTG	2	10	207264	207273	0 %	80 %	20 %	0 %	378696273
138	NC_016809	CATTA	2	10	207548	207557	40 %	40 %	0 %	20 %	378696273
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141	NC_016809	GATAA	2	10	209497	209506	60 %	20 %	20 %	0 %	378696275
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149	NC_016809	TGCAC	2	10	212967	212976	20 %	20 %	20 %	40 %	378696278
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