MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Haemophilus influenzae 10810

Total Repeats: 318

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016809	AAAAC	2	10	17977	17986	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_016809	TTAAA	2	10	21131	21140	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016809	AACAT	2	10	28002	28011	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_016809	ATAAA	2	10	30180	30189	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016809	CTTAA	2	10	49051	49060	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_016809	ATTTA	2	10	72654	72663	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016809	CGTTA	2	10	92149	92158	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
8	NC_016809	CTTTT	2	10	99685	99694	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_016809	GCCTT	2	10	99826	99835	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
10	NC_016809	TTTAA	2	10	124593	124602	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016809	GCCTT	2	10	129012	129021	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
12	NC_016809	TATAT	2	10	132342	132351	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016809	AACAA	2	10	134872	134881	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_016809	TAAAA	2	10	143881	143890	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016809	CAATT	2	10	155134	155143	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_016809	GTTTT	2	10	155512	155521	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016809	AAACT	2	10	174719	174728	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_016809	TTAAT	2	10	175304	175313	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016809	TAACC	2	10	177182	177191	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
20	NC_016809	CGACT	2	10	177623	177632	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
21	NC_016809	TCGGT	2	10	177998	178007	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
22	NC_016809	TCGCT	2	10	178225	178234	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
23	NC_016809	GTTTT	2	10	178963	178972	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016809	GCTTC	2	10	179593	179602	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
25	NC_016809	TTCAA	2	10	180847	180856	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_016809	AAGAT	2	10	181120	181129	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016809	AAAAG	2	10	183677	183686	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016809	AATTG	2	10	183827	183836	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016809	AAAAG	2	10	189178	189187	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016809	TAACT	2	10	190889	190898	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_016809	AAATA	2	10	192239	192248	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016809	AAAGA	2	10	200317	200326	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016809	TTAAT	2	10	209556	209565	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016809	TACAA	2	10	212844	212853	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_016809	TGGTC	2	10	219550	219559	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
36	NC_016809	GCAAA	2	10	221496	221505	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
37	NC_016809	CTTTG	2	10	221543	221552	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
38	NC_016809	TCGCT	2	10	221584	221593	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
39	NC_016809	AGCGA	2	10	221820	221829	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
40	NC_016809	CTTTT	2	10	221892	221901	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_016809	ATCAA	2	10	222020	222029	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_016809	ATAAG	2	10	222986	222995	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016809	TTTCT	2	10	245230	245239	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_016809	TCACA	2	10	249459	249468	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
45	NC_016809	TAATT	2	10	270468	270477	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016809	AATAA	2	10	273058	273067	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016809	TTCAA	2	10	273863	273872	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_016809	AAATA	2	10	282105	282114	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016809	ATTTT	2	10	282617	282626	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016809	AAAGA	2	10	286635	286644	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016809	TAAAA	2	10	288079	288088	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016809	TAACC	2	10	292742	292751	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
53	NC_016809	CGACT	2	10	293183	293192	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
54	NC_016809	TCGGT	2	10	293558	293567	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
55	NC_016809	TCGCT	2	10	293785	293794	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
56	NC_016809	GTTTT	2	10	294523	294532	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016809	AATAA	2	10	294726	294735	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016809	TACAC	2	10	294942	294951	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
59	NC_016809	GCTTC	2	10	295410	295419	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
60	NC_016809	TTCAA	2	10	296664	296673	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_016809	CTCAT	2	10	302170	302179	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
62	NC_016809	GAAAT	2	10	305920	305929	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016809	GATTT	2	10	306053	306062	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016809	AAAGA	2	10	306629	306638	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016809	TTTAT	2	10	307929	307938	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016809	TTCAA	2	10	308511	308520	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_016809	TATTT	2	10	308535	308544	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016809	AGAAA	2	10	312397	312406	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016809	TAATG	2	10	323085	323094	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016809	TAAAA	2	10	324628	324637	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016809	TAATC	2	10	329201	329210	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_016809	TTTTA	2	10	332882	332891	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016809	AATCT	2	10	337609	337618	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_016809	TTTGT	2	10	366118	366127	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016809	TAAAA	2	10	371459	371468	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016809	TAACT	2	10	394122	394131	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_016809	ATTTC	2	10	395875	395884	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_016809	CTATC	2	10	396614	396623	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
79	NC_016809	ATACA	2	10	400849	400858	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_016809	TTTTC	2	10	405327	405336	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_016809	TTTCT	2	10	409216	409225	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_016809	TTTAT	2	10	410074	410083	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016809	AATAA	2	10	442078	442087	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016809	AATTA	2	10	442699	442708	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_016809	TTATT	2	10	447785	447794	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016809	GTTTT	2	10	448707	448716	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016809	TAAAG	2	10	448771	448780	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016809	ATTTA	2	10	448789	448798	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016809	TGTTT	2	10	464945	464954	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016809	AATAA	2	10	474657	474666	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016809	TTTTC	2	10	475978	475987	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_016809	TGGAA	2	10	482790	482799	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016809	AAAAC	2	10	497280	497289	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_016809	AACAA	2	10	517084	517093	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_016809	CTTTT	2	10	518636	518645	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_016809	ATCAT	2	10	528862	528871	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
97	NC_016809	TTTAT	2	10	532753	532762	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016809	CCTGA	2	10	536493	536502	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
99	NC_016809	TTCAT	2	10	547584	547593	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_016809	GTTTT	2	10	561855	561864	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_016809	AAAGC	2	10	572784	572793	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
102	NC_016809	TCATC	2	10	589702	589711	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
103	NC_016809	GAAAA	2	10	599909	599918	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016809	TACAA	2	10	608032	608041	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_016809	AAGTT	2	10	615091	615100	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016809	AAGGA	2	10	620298	620307	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016809	TTATC	2	10	627635	627644	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_016809	AATTT	2	10	634238	634247	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016809	AGTTA	2	10	649976	649985	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016809	TAAAA	2	10	654276	654285	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016809	GTTAA	2	10	656696	656705	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016809	AAAAT	2	10	661119	661128	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016809	AATTA	2	10	661139	661148	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_016809	TTTTA	2	10	674866	674875	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016809	TAAAA	2	10	676802	676811	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016809	ATTAG	2	10	685592	685601	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016809	AAGAA	2	10	691585	691594	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016809	GGAAA	2	10	696772	696781	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016809	ATCGT	2	10	699538	699547	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
120	NC_016809	AGAAT	2	10	701327	701336	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_016809	CTTTT	2	10	705144	705153	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_016809	AGAAT	2	10	709666	709675	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_016809	TCAAA	2	10	712189	712198	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_016809	ATTTT	2	10	713400	713409	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_016809	CTTTT	2	10	719252	719261	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_016809	TAAAT	2	10	722991	723000	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_016809	GCGAT	2	10	723166	723175	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
128	NC_016809	AAATC	2	10	723883	723892	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_016809	TGATA	2	10	728245	728254	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_016809	TAAAA	2	10	731213	731222	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016809	TTGAA	2	10	732351	732360	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_016809	GAAGC	2	10	733605	733614	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
133	NC_016809	AAAAC	2	10	734235	734244	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_016809	AGCGA	2	10	734973	734982	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
135	NC_016809	AGTCG	2	10	735575	735584	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
136	NC_016809	TAGGT	2	10	736014	736023	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
137	NC_016809	ATACC	2	10	737906	737915	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
138	NC_016809	ATACC	2	10	738070	738079	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
139	NC_016809	TCATA	2	10	738246	738255	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_016809	GAAAT	2	10	756013	756022	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_016809	TTAAG	2	10	763051	763060	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_016809	TTGAA	2	10	765858	765867	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
143	NC_016809	GAAGC	2	10	767112	767121	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
144	NC_016809	AAAAC	2	10	767742	767751	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
145	NC_016809	AGCGA	2	10	768480	768489	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
146	NC_016809	AGTCG	2	10	769082	769091	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
147	NC_016809	TAGGT	2	10	769521	769530	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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289	NC_016809	CATTC	2	10	1808722	1808731	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
290	NC_016809	ATACA	2	10	1816709	1816718	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
291	NC_016809	TTTAC	2	10	1816748	1816757	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
292	NC_016809	ATAAA	2	10	1834971	1834980	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
293	NC_016809	TAGAA	2	10	1841237	1841246	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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298	NC_016809	AGTAC	2	10	1848970	1848979	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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316	NC_016809	TACAC	2	10	1971774	1971783	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
317	NC_016809	GCTTC	2	10	1972242	1972251	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.