MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Mycoplasma pneumoniae 309

Total Repeats: 394

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016807	GACTTT	2	12	2125	2136	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	377822308
2	NC_016807	AAACGG	2	12	9787	9798	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	377822313
3	NC_016807	AAAGAC	2	12	15102	15113	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	377822319
4	NC_016807	TAATTG	2	12	17481	17492	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	377822322
5	NC_016807	AAGGAA	2	12	23969	23980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	377822326
6	NC_016807	AGGGTG	2	12	26262	26273	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	377822327
7	NC_016807	TTGGGC	2	12	27726	27737	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	377822328
8	NC_016807	GGACAA	2	12	29230	29241	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	377822329
9	NC_016807	ATTTAC	2	12	33768	33779	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	377822334
10	NC_016807	ATTAAG	2	12	33937	33948	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	377822334
11	NC_016807	GTTTTA	2	12	37701	37712	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	377822340
12	NC_016807	TTTCGG	2	12	41091	41102	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	377822340
13	NC_016807	ATACTG	2	12	41472	41483	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	377822341
14	NC_016807	TTACAA	2	12	42035	42046	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	377822341
15	NC_016807	ACTTTA	2	12	44241	44252	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	377822342
16	NC_016807	CTTAAA	2	12	44434	44445	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	377822342
17	NC_016807	AAGTTT	2	12	45197	45208	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	377822342
18	NC_016807	GGTTAT	2	12	50701	50712	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	377822349
19	NC_016807	TAACTG	2	12	52445	52456	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	377822351
20	NC_016807	TGCGTT	2	12	54625	54636	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	377822353
21	NC_016807	ATTTGA	2	12	61121	61132	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	377822356
22	NC_016807	ACCATT	2	12	79172	79183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	377822369
23	NC_016807	ACCAAC	2	12	82426	82437	50 %	0 %	0 %	50 %	377822373
24	NC_016807	ATGCCA	2	12	85488	85499	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	377822377
25	NC_016807	CCTTAA	2	12	85649	85660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	377822378
26	NC_016807	AATCAC	2	12	85743	85754	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	377822378
27	NC_016807	TTTACT	2	12	86498	86509	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	377822379
28	NC_016807	ACTTTA	2	12	89118	89129	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	377822382
29	NC_016807	AATTGC	2	12	94157	94168	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	377822385
30	NC_016807	ACATTG	2	12	94381	94392	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	377822385
31	NC_016807	CGGGAG	2	12	95969	95980	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	377822386
32	NC_016807	CCCAAA	2	12	97261	97272	50 %	0 %	0 %	50 %	377822387
33	NC_016807	ACTTTG	2	12	99187	99198	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	377822387
34	NC_016807	AATCAG	2	12	99201	99212	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	377822387
35	NC_016807	GATTAA	2	12	99368	99379	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	377822387
36	NC_016807	CAAAAT	2	12	100505	100516	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	377822387
37	NC_016807	CCAAGC	2	12	100636	100647	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	377822388
38	NC_016807	TTTGGA	2	12	101737	101748	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	377822388
39	NC_016807	GGTGAT	2	12	102403	102414	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	377822389
40	NC_016807	AATATT	2	12	108225	108236	50 %	50 %	0 %	0 %	377822392
41	NC_016807	AAGCAG	2	12	115038	115049	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	377822400
42	NC_016807	TTAACT	2	12	115551	115562	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	377822402
43	NC_016807	TTATGC	2	12	126269	126280	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	377822406
44	NC_016807	AAAACA	2	12	126465	126476	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	377822406
45	NC_016807	CCCAGC	2	12	128942	128953	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	377822408
46	NC_016807	TTCCAC	2	12	132876	132887	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	377822411
47	NC_016807	AAACCA	2	12	134276	134287	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	377822412
48	NC_016807	AAGTTA	2	12	142230	142241	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	377822418
49	NC_016807	CAAGAA	2	12	143237	143248	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	377822418
50	NC_016807	AGGTAA	2	12	143263	143274	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	377822418
51	NC_016807	AAGCAT	2	12	143453	143464	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	377822418
52	NC_016807	ACAAAC	2	12	143872	143883	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	377822419
53	NC_016807	AAGATG	2	12	144087	144098	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	377822419
54	NC_016807	AAAAGC	2	12	144307	144318	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	377822419
55	NC_016807	CAACTT	2	12	144471	144482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	377822419
56	NC_016807	GAACCA	2	12	153507	153518	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	377822429
57	NC_016807	CTTTAG	2	12	158430	158441	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	377822433
58	NC_016807	CAAAAC	2	12	160590	160601	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	377822433
59	NC_016807	GTCACA	2	12	163931	163942	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	377822436
60	NC_016807	ATCTGG	2	12	166616	166627	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	377822438
61	NC_016807	CACCCC	2	12	166866	166877	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	377822438
62	NC_016807	CCCAAC	2	12	170872	170883	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	377822443
63	NC_016807	CTAATA	2	12	171082	171093	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	377822443
64	NC_016807	GCTAAC	2	12	171179	171190	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	377822443
65	NC_016807	CACCGC	2	12	179412	179423	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	377822453
66	NC_016807	GGCAGT	2	12	179665	179676	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	377822453
67	NC_016807	TGAAGG	2	12	180077	180088	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	377822453
68	NC_016807	AGTTCC	2	12	180145	180156	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	377822453
69	NC_016807	TCCACC	2	12	180166	180177	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	377822453
70	NC_016807	CACCCC	2	12	180417	180428	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	377822453
71	NC_016807	TACCAT	2	12	181143	181154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	377822453
72	NC_016807	CAGCTT	2	12	182715	182726	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	377822453
73	NC_016807	CCCAGC	2	12	183215	183226	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	377822453
74	NC_016807	CTAATA	2	12	183437	183448	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	377822453
75	NC_016807	CAAGGC	2	12	185268	185279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377822454
76	NC_016807	AAGCAG	2	12	185643	185654	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	377822454
77	NC_016807	TTAACT	2	12	186151	186162	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	377822454
78	NC_016807	TCTCCT	2	12	186622	186633	0 %	50 %	0 %	50 %	377822454
79	NC_016807	CAACTA	2	12	193345	193356	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	377822459
80	NC_016807	CAAGGC	2	12	196046	196057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377822461
81	NC_016807	ACTCAA	2	12	198896	198907	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	377822464
82	NC_016807	CTGGTA	2	12	201659	201670	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	377822465
83	NC_016807	GAATTG	2	12	203722	203733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	377822465
84	NC_016807	AGCTTT	2	12	203815	203826	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	377822465
85	NC_016807	CCAACC	2	12	205511	205522	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	377822466
86	NC_016807	CCTTAA	2	12	206245	206256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	377822467
87	NC_016807	AATTAA	2	12	208238	208249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	377822468
88	NC_016807	GGGTTT	2	12	212475	212486	0 %	50 %	50 %	0 %	377822472
89	NC_016807	CTGATA	2	12	214584	214595	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	377822474
90	NC_016807	CATGAT	2	12	214847	214858	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	377822474
91	NC_016807	GACTTT	2	12	215249	215260	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	377822474
92	NC_016807	AACCAA	2	12	217102	217113	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	377822477
93	NC_016807	TAAGGG	2	12	224308	224319	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	377822492
94	NC_016807	AATGCG	2	12	228813	228824	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	377822499
95	NC_016807	CGTACC	2	12	229336	229347	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	377822501
96	NC_016807	AGTGGT	2	12	232102	232113	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	377822506
97	NC_016807	TCTTTG	2	12	232980	232991	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	377822507
98	NC_016807	TTTAAC	2	12	233228	233239	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	377822507
99	NC_016807	GCTAAT	2	12	233291	233302	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	377822507
100	NC_016807	GTAAGT	2	12	233489	233500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	377822507
101	NC_016807	TGATCA	2	12	233604	233615	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	377822507
102	NC_016807	CAATTG	2	12	233730	233741	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	377822507
103	NC_016807	TGTAAT	2	12	236814	236825	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	377822510
104	NC_016807	ACGCTA	2	12	239695	239706	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	377822511
105	NC_016807	TAAAAA	2	12	241961	241972	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	377822512
106	NC_016807	ATCTGC	2	12	241997	242008	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	377822512
107	NC_016807	TAAAAA	2	12	243607	243618	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	377822513
108	NC_016807	CAGCTT	2	12	244949	244960	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	377822514
109	NC_016807	CCCCAA	3	18	245464	245481	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	377822515
110	NC_016807	GGCAGT	2	12	246924	246935	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	377822517
111	NC_016807	TGCTAT	2	12	249011	249022	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	377822519
112	NC_016807	TTTCAA	2	12	252526	252537	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	377822520
113	NC_016807	TAACAC	2	12	252764	252775	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	377822520
114	NC_016807	TTTGTG	2	12	254115	254126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	377822521
115	NC_016807	AAGGTC	2	12	257726	257737	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	377822522
116	NC_016807	TTGTCT	2	12	260046	260057	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	377822524
117	NC_016807	TAACTT	2	12	264772	264783	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	377822527
118	NC_016807	TTAGTG	2	12	268838	268849	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	377822530
119	NC_016807	GATTGC	2	12	269923	269934	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	377822530
120	NC_016807	GGCCAA	2	12	270743	270754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377822531
121	NC_016807	ACTCAA	2	12	273208	273219	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	377822535
122	NC_016807	CAAAAC	2	12	274271	274282	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	377822536
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124	NC_016807	GTAGAA	2	12	276328	276339	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	377822539
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129	NC_016807	TTCGGG	2	12	281458	281469	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	377822544
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142	NC_016807	GTGACA	2	12	306905	306916	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	377822570
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229	NC_016807	TTCGGT	2	12	464162	464173	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	377822704
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231	NC_016807	GCTGGA	2	12	466919	466930	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	377822706
232	NC_016807	GTTGGG	2	12	467108	467119	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	377822706
233	NC_016807	CGCTTC	2	12	468970	468981	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	377822708
234	NC_016807	TCATTT	2	12	469550	469561	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	377822708
235	NC_016807	CAGTAA	2	12	472272	472283	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	377822711
236	NC_016807	GCTAAG	2	12	473172	473183	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	377822711
237	NC_016807	TTATTG	2	12	473679	473690	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	377822711
238	NC_016807	ACTCTT	2	12	474077	474088	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	377822711
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240	NC_016807	TAGGTC	2	12	488771	488782	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	377822724
241	NC_016807	TTTTGC	2	12	489981	489992	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	377822724
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342	NC_016807	GGTTAA	2	12	713925	713936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	377822913
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.