MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycoplasma pneumoniae 309

Total Repeats: 90

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016807	AAACA	2	10	656	665	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_016807	CTTTA	2	10	14782	14791	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_016807	ATTAG	2	10	29772	29781	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016807	AAATA	2	10	46891	46900	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016807	TTTAC	2	10	61556	61565	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_016807	TAATT	2	10	67075	67084	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016807	ATGGC	2	10	69000	69009	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
8	NC_016807	TACTT	2	10	69354	69363	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_016807	TCAGT	2	10	69364	69373	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_016807	CTTTA	2	10	89262	89271	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_016807	ATAAA	2	10	109259	109268	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016807	AAGTG	2	10	109847	109856	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016807	TTCTT	2	10	110109	110118	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_016807	ATACA	2	10	110561	110570	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_016807	ATTCA	2	10	111406	111415	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_016807	ACCAC	2	10	117596	117605	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
17	NC_016807	ACCAA	2	10	117971	117980	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
18	NC_016807	TCGTG	2	10	119376	119385	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
19	NC_016807	TTTTC	2	10	119851	119860	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_016807	AAACA	2	10	119883	119892	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_016807	CAATA	2	10	120055	120064	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_016807	GAAAA	2	10	120277	120286	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016807	CTCAT	2	10	122576	122585	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
24	NC_016807	TCCCC	2	10	130427	130436	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
25	NC_016807	AAAGT	2	10	146616	146625	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016807	AATTG	2	10	146855	146864	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016807	GTTTT	2	10	146871	146880	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016807	ATTTT	2	10	161801	161810	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016807	AAATT	2	10	167011	167020	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016807	ACCAC	2	10	188906	188915	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
31	NC_016807	ATCAA	2	10	191304	191313	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_016807	TTTTC	2	10	193687	193696	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_016807	CAGTC	2	10	200643	200652	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
34	NC_016807	AAAGG	2	10	206020	206029	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016807	TTAAG	2	10	237661	237670	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016807	ACCAC	2	10	244352	244361	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
37	NC_016807	TTTAA	2	10	260508	260517	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016807	TTCAA	2	10	283072	283081	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_016807	TCTTT	2	10	285705	285714	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_016807	GCAAA	2	10	285772	285781	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
41	NC_016807	GTCTT	2	10	322225	322234	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
42	NC_016807	GGAAA	2	10	333125	333134	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016807	AAAAC	2	10	338594	338603	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_016807	TCTTT	2	10	341871	341880	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_016807	AAAAC	2	10	345543	345552	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_016807	CTTAC	2	10	357444	357453	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
47	NC_016807	CAAAA	2	10	371162	371171	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_016807	TTAAC	2	10	371574	371583	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_016807	AAAGA	2	10	411453	411462	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016807	GAAAA	2	10	413510	413519	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016807	TTGTA	2	10	414043	414052	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016807	AGCAA	2	10	414303	414312	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
53	NC_016807	TAAAT	2	10	414366	414375	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016807	AATTA	2	10	427750	427759	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016807	ACCGT	2	10	442567	442576	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
56	NC_016807	TGCAG	2	10	445744	445753	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
57	NC_016807	TGAGT	2	10	445757	445766	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016807	GGTAA	2	10	445848	445857	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016807	TAAAA	2	10	451568	451577	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016807	AATTA	2	10	461481	461490	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016807	TTAAA	2	10	481624	481633	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016807	CTTTA	2	10	514948	514957	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_016807	ATCTT	2	10	583602	583611	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
64	NC_016807	CCCGC	2	10	598886	598895	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
65	NC_016807	TCCCC	2	10	604067	604076	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
66	NC_016807	TTTTG	2	10	615273	615282	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016807	AAAAC	2	10	622295	622304	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_016807	TTAAT	2	10	632027	632036	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016807	TTCTA	2	10	632491	632500	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_016807	ATCTC	2	10	632738	632747	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
71	NC_016807	AAGAA	2	10	632900	632909	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016807	TTCTT	2	10	632985	632994	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_016807	TATTT	2	10	640192	640201	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_016807	TCTCC	2	10	643874	643883	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
75	NC_016807	TTTTA	2	10	646213	646222	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016807	GTTAT	2	10	654572	654581	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016807	AACTT	2	10	687385	687394	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_016807	AATTT	2	10	693352	693361	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016807	AGTGA	2	10	693527	693536	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016807	AGTGT	2	10	694879	694888	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016807	AAGAT	2	10	694934	694943	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016807	AATTT	2	10	698597	698606	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016807	TCTAA	2	10	739811	739820	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_016807	TTAAA	2	10	752208	752217	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_016807	TTTTC	2	10	761727	761736	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_016807	AACTG	2	10	762243	762252	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
87	NC_016807	TGTTC	2	10	774856	774865	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
88	NC_016807	ATATT	2	10	792236	792245	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016807	AACAA	2	10	799583	799592	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
90	NC_016807	ATCTT	2	10	800298	800307	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.