MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides J18 chromosome

Total Repeats: 66

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016805	AACAAA	2	12	22558	22569	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_016805	TAAACC	2	12	33658	33669	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_016805	TTATAG	2	12	75882	75893	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016805	AAGATA	2	12	80611	80622	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016805	AATAAA	2	12	90101	90112	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016805	ATAAAA	2	12	105866	105877	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016805	TAAAAT	2	12	113171	113182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016805	AAGCAC	2	12	130580	130591	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_016805	AACAAA	2	12	145185	145196	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_016805	ATTTTA	2	12	242360	242371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016805	CTAACG	2	12	253883	253894	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_016805	GGTTTC	2	12	260771	260782	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_016805	AAATAT	2	12	264360	264371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016805	TTTTAA	2	12	315156	315167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016805	TCATAG	2	12	383375	383386	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_016805	AAATAG	2	12	398875	398886	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016805	TTTAAT	2	12	425554	425565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016805	GAAGAG	2	12	472151	472162	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016805	TATTTT	2	12	522074	522085	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016805	AGCATA	2	12	585218	585229	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_016805	ATTGTA	2	12	686218	686229	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016805	AAATAT	2	12	701478	701489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016805	AGTTAA	2	12	844087	844098	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016805	ATTAAA	2	12	864715	864726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016805	GGTGAT	2	12	899147	899158	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016805	GTTTTA	2	12	956407	956418	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016805	TAAAAT	2	12	957929	957940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016805	GTTTTT	2	12	985450	985461	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016805	AGAAAA	2	12	990578	990589	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016805	TGCGAA	2	12	1000743	1000754	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_016805	TTATCA	2	12	1046826	1046837	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_016805	AATGAA	2	12	1069927	1069938	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016805	CTTTTT	2	12	1095688	1095699	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_016805	CTATGC	2	12	1134679	1134690	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_016805	TAAAAA	2	12	1136914	1136925	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016805	AAAAAT	2	12	1165476	1165487	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016805	GCAACT	2	12	1204565	1204576	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_016805	ATTTTA	2	12	1210403	1210414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016805	ATCCCC	2	12	1213794	1213805	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_016805	TATTTT	2	12	1241355	1241366	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016805	ATATCC	2	12	1304518	1304529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_016805	CAATAC	2	12	1339156	1339167	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_016805	GTATTG	2	12	1339192	1339203	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016805	TAAAAG	2	12	1361306	1361317	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016805	TCAATT	2	12	1414500	1414511	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_016805	TTAAAT	2	12	1420657	1420668	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016805	AATTTT	2	12	1445185	1445196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016805	GTTTTT	2	12	1455862	1455873	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016805	TTATAA	2	12	1506956	1506967	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016805	TTTGTT	2	12	1536064	1536075	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016805	TTTTAT	2	12	1617530	1617541	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016805	TTTGTT	2	12	1660899	1660910	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016805	CCTTTA	2	12	1661287	1661298	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_016805	AAATCA	2	12	1700834	1700845	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_016805	ATCAAC	2	12	1720867	1720878	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_016805	CTTATA	2	12	1720994	1721005	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_016805	AAATAA	2	12	1723968	1723979	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016805	TTATTC	2	12	1728126	1728137	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_016805	TCAATA	2	12	1729563	1729574	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_016805	TTAGGT	2	12	1729681	1729692	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016805	TTCAAA	2	12	1738225	1738236	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_016805	AAAAGA	2	12	1744823	1744834	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016805	AATAAA	2	12	1759084	1759095	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016805	ATAAAC	2	12	1820706	1820717	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_016805	TAGTAA	2	12	1828836	1828847	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016805	ATTTTA	2	12	1870463	1870474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.