MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides J18 chromosome

Total Repeats: 620

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016805	TTGTAT	2	12	3864	3875	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	381335657
2	NC_016805	CTGATA	2	12	5231	5242	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	381335658
3	NC_016805	TATATT	2	12	6298	6309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	381335658
4	NC_016805	ACTGTA	2	12	7428	7439	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	381335659
5	NC_016805	ACAAGC	2	12	7967	7978	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	381335659
6	NC_016805	TGAAGA	2	12	8195	8206	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	381335659
7	NC_016805	ATTAAT	2	12	20896	20907	50 %	50 %	0 %	0 %	381335670
8	NC_016805	TTATTG	2	12	30070	30081	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	381335672
9	NC_016805	AATTAA	2	12	30156	30167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	381335672
10	NC_016805	AAAATA	2	12	33073	33084	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	381335675
11	NC_016805	ATATGT	2	12	33160	33171	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	381335676
12	NC_016805	TGATTT	2	12	36378	36389	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	381335678
13	NC_016805	CAAATG	2	12	38877	38888	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	381335681
14	NC_016805	TACCAT	2	12	40664	40675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	381335682
15	NC_016805	AAAAGT	2	12	41208	41219	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	381335682
16	NC_016805	TATTGC	2	12	44621	44632	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	381335687
17	NC_016805	GGTAAA	2	12	46066	46077	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	381335689
18	NC_016805	GGCATC	2	12	49319	49330	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	381335692
19	NC_016805	ACAGCA	2	12	49542	49553	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	381335692
20	NC_016805	TAGCAA	2	12	49582	49593	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	381335692
21	NC_016805	AGCATT	2	12	50141	50152	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	381335692
22	NC_016805	GCAAGA	2	12	51008	51019	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	381335693
23	NC_016805	TGGCTG	2	12	56472	56483	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	381335699
24	NC_016805	ATGGGA	2	12	62991	63002	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	381335707
25	NC_016805	AATCTT	2	12	67315	67326	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	381335711
26	NC_016805	TAATTG	2	12	67500	67511	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	381335711
27	NC_016805	TTGCCA	2	12	68688	68699	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	381335713
28	NC_016805	TTGTAA	2	12	71480	71491	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	381335715
29	NC_016805	TGGATC	2	12	73615	73626	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	381335716
30	NC_016805	GTAAAT	2	12	74427	74438	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	381335718
31	NC_016805	TAAGAT	2	12	78430	78441	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	381335726
32	NC_016805	GGTGCT	2	12	81487	81498	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	381335730
33	NC_016805	TGAAAC	2	12	87145	87156	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	381335734
34	NC_016805	ATGATA	2	12	89562	89573	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	381335737
35	NC_016805	TTAGAT	2	12	92835	92846	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	381335740
36	NC_016805	TTGCTA	2	12	101605	101616	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	381335750
37	NC_016805	AATATT	2	12	101895	101906	50 %	50 %	0 %	0 %	381335750
38	NC_016805	AGAATA	2	12	101923	101934	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	381335750
39	NC_016805	TGGTGA	2	12	107727	107738	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	381335757
40	NC_016805	CATGAA	2	12	118054	118065	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	381335766
41	NC_016805	TTAATG	2	12	123933	123944	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	381335772
42	NC_016805	TATGAA	2	12	142117	142128	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	381335787
43	NC_016805	TGTTAA	2	12	144141	144152	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	381335788
44	NC_016805	TTAGAA	2	12	144307	144318	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	381335788
45	NC_016805	GTAAAG	2	12	144798	144809	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	381335789
46	NC_016805	TGAGGA	2	12	156333	156344	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	381335792
47	NC_016805	TTGAGG	2	12	156752	156763	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	381335792
48	NC_016805	GCTATT	2	12	158384	158395	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	381335793
49	NC_016805	TAAAAT	2	12	160041	160052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	381335794
50	NC_016805	ATGTTG	2	12	170305	170316	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	381335804
51	NC_016805	TGCATC	2	12	170429	170440	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	381335804
52	NC_016805	ATTGAA	2	12	173092	173103	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	381335810
53	NC_016805	CTGTTG	2	12	174331	174342	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	381335813
54	NC_016805	TATCGA	2	12	175132	175143	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	381335815
55	NC_016805	ATTGTT	2	12	175759	175770	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	381335816
56	NC_016805	TAAAGG	2	12	176866	176877	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	381335818
57	NC_016805	CTTGGA	2	12	177979	177990	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	381335821
58	NC_016805	TTTATT	2	12	187979	187990	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	381335835
59	NC_016805	AAAATG	2	12	192418	192429	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	381335841
60	NC_016805	TCGATG	2	12	193071	193082	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	381335842
61	NC_016805	TCACAG	2	12	203224	203235	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	381335851
62	NC_016805	GATACA	2	12	204468	204479	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	381335852
63	NC_016805	CTTTAT	2	12	206841	206852	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	381335854
64	NC_016805	TTAATT	2	12	213712	213723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	381335860
65	NC_016805	AGGAGC	2	12	216010	216021	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	381335863
66	NC_016805	CGAAGC	2	12	216219	216230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	381335864
67	NC_016805	GTATGG	2	12	221285	221296	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	381335871
68	NC_016805	TAAGGT	2	12	223742	223753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	381335875
69	NC_016805	GGCTTG	2	12	223779	223790	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	381335875
70	NC_016805	ATTTTG	2	12	224083	224094	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	381335876
71	NC_016805	GTGAAG	2	12	224708	224719	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	381335877
72	NC_016805	AAGATA	2	12	229303	229314	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	381335883
73	NC_016805	AATTGA	2	12	229541	229552	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	381335883
74	NC_016805	GCATTT	2	12	230201	230212	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	381335884
75	NC_016805	TTTTAT	2	12	230928	230939	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	381335885
76	NC_016805	ATGAGT	2	12	234613	234624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	381335889
77	NC_016805	CAATTT	2	12	235407	235418	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	381335889
78	NC_016805	ATTTTG	2	12	243819	243830	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	381335895
79	NC_016805	ATTTGG	2	12	245891	245902	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	381335897
80	NC_016805	ATGAAA	2	12	251538	251549	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	381335902
81	NC_016805	GTTCCT	2	12	256095	256106	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	381335908
82	NC_016805	GCATTT	2	12	257257	257268	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	381335909
83	NC_016805	ATTTTG	2	12	257757	257768	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	381335910
84	NC_016805	GCATTC	2	12	258759	258770	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	381335912
85	NC_016805	TTGCAA	2	12	261811	261822	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	381335916
86	NC_016805	CAAACA	2	12	268822	268833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	381335923
87	NC_016805	TGATAT	2	12	269242	269253	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	381335924
88	NC_016805	GAAAAA	2	12	271841	271852	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	381335924
89	NC_016805	CTTCAA	2	12	275905	275916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	381335928
90	NC_016805	ACAGAA	2	12	278384	278395	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	381335930
91	NC_016805	CATGGC	2	12	279706	279717	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	381335930
92	NC_016805	GATTAT	2	12	282674	282685	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	381335933
93	NC_016805	AATATG	2	12	283879	283890	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	381335934
94	NC_016805	TTAACA	2	12	290779	290790	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	381335941
95	NC_016805	TTAAAC	2	12	291534	291545	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	381335942
96	NC_016805	ATTGGT	2	12	304399	304410	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	381335956
97	NC_016805	TTTCAG	2	12	308760	308771	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	381335959
98	NC_016805	TCATAT	2	12	311940	311951	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	381335962
99	NC_016805	AGATAT	2	12	312082	312093	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	381335963
100	NC_016805	GTATCG	2	12	317978	317989	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	381335971
101	NC_016805	TGGATT	2	12	322294	322305	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	381335975
102	NC_016805	ATGGTA	2	12	324517	324528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	381335978
103	NC_016805	TGGGCA	2	12	325067	325078	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	381335978
104	NC_016805	TATTTT	2	12	326336	326347	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	381335979
105	NC_016805	TTGTTC	2	12	330256	330267	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	381335983
106	NC_016805	ATTGGT	2	12	330360	330371	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	381335983
107	NC_016805	TCATTT	2	12	332895	332906	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	381335985
108	NC_016805	CAGTTT	2	12	339745	339756	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	381335990
109	NC_016805	AATTAT	2	12	341851	341862	50 %	50 %	0 %	0 %	381335991
110	NC_016805	ATATGA	2	12	342635	342646	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	381335992
111	NC_016805	GGTGCT	2	12	345877	345888	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	381335993
112	NC_016805	GTTGAA	3	18	348287	348304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	381335995
113	NC_016805	GCATAT	2	12	353922	353933	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	381335999
114	NC_016805	TAGTTC	2	12	355570	355581	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	381336002
115	NC_016805	GTTGGT	2	12	358125	358136	0 %	50 %	50 %	0 %	381336004
116	NC_016805	TGCTAT	2	12	359114	359125	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	381336004
117	NC_016805	TGGACA	2	12	362609	362620	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	381336007
118	NC_016805	AATGTT	2	12	364361	364372	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	381336009
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228	NC_016805	TTCTGA	2	12	692199	692210	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	381336313
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230	NC_016805	AAATTG	2	12	698580	698591	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	381336318
231	NC_016805	AAATGA	2	12	706800	706811	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	381336324
232	NC_016805	TATTGT	2	12	706812	706823	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	381336324
233	NC_016805	AATGGC	2	12	708834	708845	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	381336326
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330	NC_016805	GTTTTA	2	12	1021343	1021354	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	381336608
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335	NC_016805	TTTGTT	2	12	1035358	1035369	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	381336619
336	NC_016805	GCGATT	2	12	1035694	1035705	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	381336620
337	NC_016805	GCCAAA	2	12	1037939	1037950	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	381336623
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339	NC_016805	CAAAGC	2	12	1042430	1042441	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	381336630
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341	NC_016805	TCGGAT	2	12	1049966	1049977	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	381336634
342	NC_016805	GTTTAG	2	12	1050634	1050645	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	381336636
343	NC_016805	ATTTTA	2	12	1054622	1054633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	381336639
344	NC_016805	AATCAA	2	12	1055135	1055146	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	381336640
345	NC_016805	CCTATT	2	12	1057591	1057602	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	381336644
346	NC_016805	TAATTG	2	12	1057831	1057842	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	381336644
347	NC_016805	TGATAT	2	12	1058510	1058521	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	381336645
348	NC_016805	ATCAAT	2	12	1058682	1058693	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	381336646
349	NC_016805	GAATTT	5	30	1059348	1059377	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	381336647
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382	NC_016805	ACTTGA	2	12	1152792	1152803	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	381336740
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440	NC_016805	TACCAT	2	12	1306044	1306055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	381336889
441	NC_016805	AGTATG	2	12	1306894	1306905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	381336890
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443	NC_016805	ATTTCA	2	12	1307610	1307621	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	381336891
444	NC_016805	TCTCTT	2	12	1308540	1308551	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	381336892
445	NC_016805	AAAAAG	2	12	1310589	1310600	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	381336893
446	NC_016805	ATTATG	2	12	1314469	1314480	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	381336897
447	NC_016805	ACTTCA	2	12	1315007	1315018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	381336897
448	NC_016805	TATGCT	2	12	1315173	1315184	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	381336897
449	NC_016805	TGTCAT	2	12	1315667	1315678	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	381336898
450	NC_016805	TAGCCG	2	12	1319854	1319865	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	381336903
451	NC_016805	TAGCCA	2	12	1319866	1319877	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	381336903
452	NC_016805	AAGCTG	2	12	1327497	1327508	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	381336911
453	NC_016805	ATAAAA	2	12	1331737	1331748	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	381336917
454	NC_016805	GGTGCT	2	12	1339860	1339871	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	381336925
455	NC_016805	ACGCGT	2	12	1342695	1342706	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	381336926
456	NC_016805	CAGCTG	2	12	1344710	1344721	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	381336928
457	NC_016805	AATGCA	2	12	1344934	1344945	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	381336928
458	NC_016805	TTTCCT	2	12	1346962	1346973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	381336929
459	NC_016805	AATTGC	2	12	1348354	1348365	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	381336931
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461	NC_016805	TCAATG	2	12	1351761	1351772	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	381336934
462	NC_016805	TTCAAG	2	12	1353222	1353233	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	381336936
463	NC_016805	ATTGCA	2	12	1353527	1353538	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	381336936
464	NC_016805	ATGGGC	2	12	1359893	1359904	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	381336943
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469	NC_016805	CAGCAT	2	12	1378525	1378536	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	381336956
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471	NC_016805	CACTAT	2	12	1387755	1387766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	381336966
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476	NC_016805	CTAGAA	2	12	1397442	1397453	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	381336979
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482	NC_016805	TGTTTT	2	12	1412318	1412329	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	381336992
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489	NC_016805	AAACTT	2	12	1446384	1446395	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	381337019
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